MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132504

Total Repeats: 808

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012852	TCA	2	6	200368	200373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_012852	GGA	2	6	200394	200399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
503	NC_012852	AGG	2	6	202370	202375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
504	NC_012852	AGG	2	6	202403	202408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
505	NC_012852	CAT	2	6	203748	203753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_012852	TCC	2	6	203755	203760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
507	NC_012852	CAT	2	6	203780	203785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_012852	GGC	2	6	203792	203797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_012852	GGA	2	6	203813	203818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
510	NC_012852	GCA	2	6	206618	206623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_012852	GATCG	2	10	206757	206766	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
512	NC_012852	ATC	2	6	206789	206794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_012852	A	6	6	207907	207912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_012852	TCCA	2	8	211789	211796	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
515	NC_012852	GGA	2	6	212626	212631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
516	NC_012852	CAT	2	6	215079	215084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_012852	CAG	2	6	215131	215136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_012852	CGG	2	6	216389	216394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_012852	TTTA	2	8	217861	217868	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_012852	GAG	2	6	217903	217908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
521	NC_012852	CGGC	2	8	219568	219575	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
522	NC_012852	AGG	2	6	219603	219608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
523	NC_012852	CAT	2	6	220592	220597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_012852	CTC	2	6	220700	220705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
525	NC_012852	GCA	2	6	220726	220731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_012852	T	6	6	227979	227984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_012852	TAG	2	6	228005	228010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_012852	TCA	2	6	228081	228086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_012852	T	6	6	228092	228097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_012852	TGGCA	2	10	228136	228145	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
531	NC_012852	AAG	2	6	228166	228171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_012852	CT	3	6	228178	228183	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
533	NC_012852	A	7	7	228187	228193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_012852	CGA	2	6	228247	228252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_012852	GGA	2	6	228271	228276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
536	NC_012852	CTG	2	6	231754	231759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_012852	TTGGC	2	10	231761	231770	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
538	NC_012852	GCC	2	6	231792	231797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
539	NC_012852	GGGGA	2	10	231798	231807	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
540	NC_012852	GGCC	2	8	231808	231815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
541	NC_012852	CTG	2	6	231846	231851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_012852	CGAATG	2	12	232356	232367	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
543	NC_012852	GC	3	6	232438	232443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
544	NC_012852	CGGC	2	8	232450	232457	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
545	NC_012852	TCG	2	6	232482	232487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_012852	TGA	2	6	232524	232529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_012852	ATTG	2	8	232534	232541	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
548	NC_012852	TG	3	6	233729	233734	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
549	NC_012852	TCG	2	6	233763	233768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_012852	GCA	2	6	234745	234750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_012852	ATG	2	6	234755	234760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_012852	CCG	2	6	234763	234768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
553	NC_012852	TGC	2	6	234794	234799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_012852	GTTC	2	8	236323	236330	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
555	NC_012852	AGA	2	6	240791	240796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_012852	AAG	2	6	240862	240867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_012852	AGC	2	6	240900	240905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_012852	GCC	2	6	241753	241758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_012852	T	6	6	241768	241773	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_012852	CCG	2	6	242715	242720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
561	NC_012852	GAACG	2	10	242779	242788	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
562	NC_012852	CTTC	2	8	243718	243725	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
563	NC_012852	AGGA	2	8	243738	243745	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
564	NC_012852	CCGG	2	8	244681	244688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
565	NC_012852	CTCG	2	8	245635	245642	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
566	NC_012852	CGG	2	6	245675	245680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_012852	ACT	2	6	245693	245698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_012852	GATGC	2	10	245887	245896	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
569	NC_012852	TGC	2	6	248590	248595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_012852	CTT	2	6	248669	248674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_012852	GCG	2	6	248717	248722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_012852	TTC	2	6	248725	248730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_012852	TGCAA	2	10	248772	248781	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
574	NC_012852	ACA	2	6	248791	248796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_012852	TG	3	6	248802	248807	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
576	NC_012852	TCAA	2	8	248893	248900	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
577	NC_012852	ATCT	2	8	248942	248949	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
578	NC_012852	AT	4	8	248956	248963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_012852	GTC	2	6	249101	249106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_012852	TCA	2	6	251375	251380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_012852	CTC	2	6	251391	251396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
582	NC_012852	CGG	2	6	251425	251430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_012852	GGGT	2	8	251511	251518	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
584	NC_012852	AAC	2	6	251548	251553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_012852	CGC	2	6	251615	251620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
586	NC_012852	TGC	2	6	251648	251653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_012852	CCT	2	6	251654	251659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
588	NC_012852	TTAT	2	8	252762	252769	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_012852	AGCA	2	8	252805	252812	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
590	NC_012852	CT	3	6	252891	252896	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
591	NC_012852	GCG	2	6	252906	252911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_012852	GCT	2	6	252921	252926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_012852	GATCT	2	10	252971	252980	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
594	NC_012852	GTC	2	6	253014	253019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_012852	GCA	2	6	253027	253032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_012852	TGA	2	6	253156	253161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_012852	TC	3	6	257310	257315	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
598	NC_012852	CGCT	2	8	258605	258612	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
599	NC_012852	GCG	2	6	263892	263897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_012852	ATC	2	6	263930	263935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_012852	ATG	2	6	264004	264009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_012852	ACCCG	2	10	264023	264032	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
603	NC_012852	AGC	2	6	264045	264050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_012852	CCGG	2	8	264118	264125	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
605	NC_012852	CT	3	6	270642	270647	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
606	NC_012852	TTG	2	6	270772	270777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_012852	T	6	6	270827	270832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_012852	GGC	2	6	270852	270857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_012852	GCC	2	6	270858	270863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
610	NC_012852	CGA	2	6	270887	270892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_012852	GCG	2	6	270932	270937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_012852	GC	3	6	270939	270944	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
613	NC_012852	TGC	2	6	271011	271016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_012852	TCA	2	6	271046	271051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_012852	AAC	2	6	271071	271076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_012852	AGC	2	6	272567	272572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_012852	GCG	2	6	272677	272682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_012852	GC	3	6	272704	272709	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
619	NC_012852	GAT	2	6	272742	272747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_012852	GA	3	6	274375	274380	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
621	NC_012852	CGGC	2	8	274424	274431	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
622	NC_012852	GCCT	2	8	274487	274494	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
623	NC_012852	CG	3	6	274533	274538	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
624	NC_012852	CCGG	2	8	274539	274546	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
625	NC_012852	A	6	6	274611	274616	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_012852	CAA	2	6	274653	274658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_012852	CAA	2	6	280260	280265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_012852	ATG	2	6	280396	280401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_012852	TGG	2	6	280434	280439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
630	NC_012852	ACCG	2	8	280447	280454	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
631	NC_012852	ACT	2	6	280571	280576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_012852	GTT	2	6	284619	284624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
633	NC_012852	CGG	2	6	286026	286031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_012852	GCT	2	6	286037	286042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_012852	GGC	2	6	286046	286051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_012852	GACG	2	8	286106	286113	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
637	NC_012852	ATG	2	6	286145	286150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
638	NC_012852	TCA	2	6	287047	287052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_012852	CAT	2	6	287845	287850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_012852	GCCT	2	8	288160	288167	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
641	NC_012852	CG	3	6	288226	288231	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
642	NC_012852	CTG	2	6	288314	288319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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650	NC_012852	CGG	2	6	292333	292338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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652	NC_012852	CG	3	6	292424	292429	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
653	NC_012852	CGA	2	6	292467	292472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
654	NC_012852	GAG	2	6	292477	292482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
655	NC_012852	CCG	2	6	297906	297911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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657	NC_012852	G	6	6	300122	300127	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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661	NC_012852	T	6	6	300234	300239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
662	NC_012852	CTA	2	6	300271	300276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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665	NC_012852	GGC	2	6	300424	300429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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669	NC_012852	CGAC	2	8	300553	300560	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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674	NC_012852	AGC	2	6	300686	300691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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770	NC_012852	TC	3	6	337967	337972	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
771	NC_012852	CAA	2	6	337989	337994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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