MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 7861

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012850	GGC	2	6	7	12	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_012850	GGC	2	6	46	51	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_012850	GCG	2	6	2841	2846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_012850	GCC	2	6	2858	2863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_012850	CGT	2	6	2880	2885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_012850	GGC	2	6	5930	5935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_012850	ATC	2	6	5994	5999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_012850	CGC	2	6	7109	7114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_012850	CTT	2	6	7140	7145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_012850	TTC	2	6	8909	8914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_012850	GCA	2	6	8965	8970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_012850	CTC	2	6	9059	9064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_012850	TGC	2	6	9088	9093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_012850	GGA	2	6	9600	9605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012850	CTT	2	6	9971	9976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_012850	GAG	2	6	10329	10334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012850	CGG	2	6	10386	10391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_012850	TGT	2	6	10437	10442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012850	CGT	2	6	10443	10448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_012850	TCA	2	6	10506	10511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_012850	CGC	2	6	10542	10547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_012850	CGA	2	6	10632	10637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_012850	CAT	2	6	11211	11216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_012850	TAG	2	6	13225	13230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012850	TGA	2	6	13248	13253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012850	GGC	2	6	13328	13333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_012850	TCA	2	6	13909	13914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_012850	GCC	2	6	15704	15709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_012850	TTC	2	6	15735	15740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_012850	TCG	2	6	15787	15792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_012850	GCA	2	6	15869	15874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_012850	CAA	2	6	15894	15899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_012850	TCG	2	6	17281	17286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_012850	ACC	2	6	17389	17394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_012850	ATT	2	6	17448	17453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012850	GAT	2	6	17657	17662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012850	CAT	2	6	17702	17707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_012850	CGT	2	6	19489	19494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_012850	TCG	2	6	21563	21568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_012850	CGA	2	6	21611	21616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_012850	ATT	2	6	21673	21678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012850	CTG	2	6	21767	21772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_012850	GCC	2	6	21824	21829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_012850	GTT	2	6	21992	21997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012850	CCA	2	6	22075	22080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_012850	GCA	2	6	22745	22750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_012850	GAC	2	6	22938	22943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_012850	AGC	2	6	25031	25036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_012850	GTT	2	6	25044	25049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012850	CGG	2	6	25469	25474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_012850	GAT	2	6	25559	25564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012850	CGC	2	6	25675	25680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_012850	GCC	2	6	29934	29939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_012850	TCT	3	9	29954	29962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_012850	GCA	2	6	29984	29989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_012850	CCG	2	6	30061	30066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_012850	GGC	2	6	30075	30080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_012850	TGC	2	6	30207	30212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_012850	CGC	2	6	31519	31524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_012850	TTC	2	6	33428	33433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_012850	AGA	2	6	33437	33442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012850	GAT	2	6	33498	33503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012850	GAA	2	6	34147	34152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012850	GTC	2	6	35279	35284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_012850	TGG	2	6	35295	35300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012850	TGC	2	6	35327	35332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_012850	GCA	2	6	35338	35343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_012850	CGC	2	6	35367	35372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_012850	GGC	2	6	36478	36483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_012850	AAT	2	6	37150	37155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012850	CGC	2	6	43295	43300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_012850	ACA	2	6	46443	46448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_012850	GGA	2	6	46487	46492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012850	CTC	2	6	48783	48788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_012850	GCT	2	6	48873	48878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_012850	GGC	2	6	48918	48923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_012850	GTT	2	6	48985	48990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012850	TGC	2	6	50246	50251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_012850	GAT	2	6	50317	50322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012850	GCC	2	6	57946	57951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_012850	CGC	2	6	58471	58476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_012850	ATT	2	6	58804	58809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012850	GCC	2	6	59803	59808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_012850	TTG	2	6	59881	59886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012850	TAA	2	6	59917	59922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012850	GGC	2	6	59942	59947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_012850	GCG	2	6	59966	59971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_012850	GAT	2	6	62158	62163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012850	GGA	2	6	62290	62295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012850	GTT	2	6	63927	63932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012850	CGG	2	6	64949	64954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_012850	GCC	2	6	64997	65002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_012850	CGC	2	6	65054	65059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_012850	AAG	2	6	65208	65213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012850	GTG	2	6	65806	65811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012850	GCG	2	6	65813	65818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_012850	GCC	2	6	65824	65829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_012850	TCT	2	6	66765	66770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_012850	GCC	2	6	66811	66816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_012850	TCT	2	6	67745	67750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_012850	GAC	2	6	67761	67766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_012850	AGA	2	6	69051	69056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012850	GCG	2	6	69058	69063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_012850	CGC	2	6	69150	69155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_012850	GCG	2	6	69192	69197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_012850	GCG	2	6	71359	71364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_012850	ATG	2	6	71389	71394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012850	CGG	2	6	75655	75660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_012850	GCC	2	6	75687	75692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_012850	CGA	2	6	77680	77685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_012850	AAG	2	6	78419	78424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012850	GCA	2	6	78430	78435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_012850	CGG	2	6	79262	79267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_012850	AAT	2	6	83368	83373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012850	GAC	2	6	84785	84790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_012850	GAG	2	6	84824	84829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012850	TGA	2	6	85549	85554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012850	CAG	2	6	86773	86778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_012850	CTG	2	6	86802	86807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_012850	CGG	2	6	86824	86829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_012850	GAA	2	6	87852	87857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012850	TCA	2	6	87978	87983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_012850	GCT	2	6	87986	87991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_012850	CGC	2	6	88066	88071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_012850	CCT	2	6	88842	88847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_012850	CCG	2	6	88874	88879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_012850	CTT	2	6	91276	91281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_012850	GTT	2	6	91304	91309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012850	TCG	2	6	91483	91488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_012850	TAA	2	6	91591	91596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012850	AGG	2	6	91655	91660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012850	CGC	2	6	93691	93696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_012850	GCG	2	6	93703	93708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_012850	GCT	2	6	93729	93734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_012850	GGC	2	6	93788	93793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_012850	TGC	2	6	93799	93804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_012850	GCT	2	6	95363	95368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_012850	CCG	2	6	95450	95455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_012850	GAA	2	6	95587	95592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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405	NC_012850	GTC	2	6	223284	223289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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