MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 12330

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_012850	GGAA	2	8	1321178	1321185	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_012850	ATT	2	6	1322487	1322492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_012850	ATG	2	6	1322614	1322619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_012850	TAA	2	6	1322720	1322725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_012850	CAA	2	6	1322795	1322800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_012850	GCCG	2	8	1322809	1322816	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3507	NC_012850	AG	3	6	1322834	1322839	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_012850	T	6	6	1325356	1325361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_012850	GCTT	2	8	1325381	1325388	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3510	NC_012850	CGG	2	6	1325418	1325423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3511	NC_012850	TGA	2	6	1325427	1325432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_012850	TTTG	2	8	1325846	1325853	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_012850	GTTCT	2	10	1325892	1325901	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3514	NC_012850	CGG	2	6	1325925	1325930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_012850	CTT	2	6	1325960	1325965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_012850	GGA	2	6	1325978	1325983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_012850	CAG	2	6	1325989	1325994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3518	NC_012850	CCA	2	6	1329348	1329353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3519	NC_012850	T	6	6	1329383	1329388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_012850	TCC	2	6	1330402	1330407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3521	NC_012850	GT	3	6	1330428	1330433	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_012850	GAT	2	6	1330477	1330482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_012850	CAAG	2	8	1330484	1330491	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3524	NC_012850	TGA	2	6	1330503	1330508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_012850	ATGG	2	8	1330612	1330619	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_012850	CGG	2	6	1331674	1331679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_012850	AGC	2	6	1331708	1331713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_012850	CTT	2	6	1331747	1331752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_012850	GAG	2	6	1331801	1331806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_012850	TCT	2	6	1332202	1332207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_012850	CGC	2	6	1332227	1332232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3532	NC_012850	TGA	2	6	1332233	1332238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_012850	CGG	2	6	1332242	1332247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3534	NC_012850	CACC	2	8	1332862	1332869	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3535	NC_012850	TGA	2	6	1333187	1333192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_012850	AGG	2	6	1333264	1333269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_012850	GCG	2	6	1333274	1333279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_012850	AGT	2	6	1333286	1333291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_012850	GGC	2	6	1333319	1333324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3540	NC_012850	TGC	2	6	1333357	1333362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_012850	AGG	2	6	1333461	1333466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_012850	TGA	2	6	1333958	1333963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_012850	AGC	2	6	1333967	1333972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3544	NC_012850	TGG	2	6	1333988	1333993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_012850	CCG	2	6	1334011	1334016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3546	NC_012850	TGG	2	6	1334096	1334101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_012850	T	8	8	1334158	1334165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_012850	GGT	2	6	1334166	1334171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_012850	TCGGC	2	10	1334200	1334209	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3550	NC_012850	GAGGG	2	10	1334221	1334230	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_012850	AGA	2	6	1334283	1334288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_012850	CCG	2	6	1334324	1334329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3553	NC_012850	TTC	2	6	1334706	1334711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_012850	CG	3	6	1334804	1334809	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3555	NC_012850	TTG	2	6	1334872	1334877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_012850	GCC	2	6	1334915	1334920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3557	NC_012850	GGT	2	6	1336518	1336523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_012850	TGG	2	6	1336524	1336529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_012850	CGG	2	6	1341261	1341266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_012850	CGGG	2	8	1341268	1341275	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3561	NC_012850	GTTT	2	8	1341393	1341400	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_012850	TCA	2	6	1341405	1341410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3563	NC_012850	A	6	6	1351950	1351955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_012850	CTG	2	6	1354045	1354050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_012850	GGC	2	6	1354068	1354073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_012850	CCG	2	6	1354108	1354113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3567	NC_012850	ATG	2	6	1354532	1354537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_012850	A	9	9	1354593	1354601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_012850	CGA	2	6	1354658	1354663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_012850	GC	3	6	1354664	1354669	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3571	NC_012850	TCC	2	6	1354681	1354686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3572	NC_012850	CCTG	2	8	1354723	1354730	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3573	NC_012850	TCA	2	6	1354768	1354773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3574	NC_012850	T	7	7	1354776	1354782	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_012850	T	6	6	1354854	1354859	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_012850	TCCT	2	8	1354925	1354932	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3577	NC_012850	CTG	2	6	1354987	1354992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3578	NC_012850	GCC	2	6	1357669	1357674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3579	NC_012850	GAT	2	6	1358393	1358398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_012850	GA	3	6	1358488	1358493	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_012850	GGC	2	6	1358554	1358559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3582	NC_012850	CCT	2	6	1358587	1358592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3583	NC_012850	CAG	2	6	1358619	1358624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3584	NC_012850	AAT	2	6	1359129	1359134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_012850	AGT	2	6	1359174	1359179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_012850	GAG	2	6	1359191	1359196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_012850	GCC	2	6	1359201	1359206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3588	NC_012850	GCG	2	6	1359226	1359231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3589	NC_012850	GCT	2	6	1359249	1359254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3590	NC_012850	TCG	2	6	1359289	1359294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3591	NC_012850	AGG	2	6	1359325	1359330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_012850	ACAT	2	8	1359354	1359361	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3593	NC_012850	TGAC	2	8	1359401	1359408	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3594	NC_012850	GCA	2	6	1359424	1359429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3595	NC_012850	CTT	2	6	1359532	1359537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_012850	CAT	2	6	1359543	1359548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3597	NC_012850	ATTC	2	8	1359575	1359582	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3598	NC_012850	GCC	2	6	1364439	1364444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3599	NC_012850	TGGC	2	8	1364445	1364452	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3600	NC_012850	AG	3	6	1365812	1365817	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_012850	TTC	2	6	1367402	1367407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3602	NC_012850	GCC	2	6	1369288	1369293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3603	NC_012850	TGC	2	6	1369416	1369421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_012850	CG	3	6	1369433	1369438	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3605	NC_012850	AAATG	2	10	1369469	1369478	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_012850	CTGC	2	8	1369492	1369499	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3607	NC_012850	GCG	2	6	1369522	1369527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3608	NC_012850	AGGGG	2	10	1369542	1369551	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_012850	TTC	2	6	1369583	1369588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_012850	TTG	2	6	1369700	1369705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_012850	TTTC	2	8	1369708	1369715	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3612	NC_012850	GAG	2	6	1369759	1369764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_012850	ATG	2	6	1369778	1369783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_012850	CCG	2	6	1369791	1369796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3615	NC_012850	GTCG	2	8	1369815	1369822	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3616	NC_012850	TAG	2	6	1369825	1369830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_012850	CGC	2	6	1369890	1369895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3618	NC_012850	GCG	2	6	1369916	1369921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3619	NC_012850	ATC	2	6	1369938	1369943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3620	NC_012850	A	6	6	1369970	1369975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_012850	GC	4	8	1369990	1369997	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3622	NC_012850	T	6	6	1369998	1370003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_012850	GTC	2	6	1370194	1370199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3624	NC_012850	CCCG	2	8	1370272	1370279	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3625	NC_012850	ATCC	2	8	1371472	1371479	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3626	NC_012850	AG	3	6	1371482	1371487	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_012850	CGAA	2	8	1371493	1371500	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3628	NC_012850	CGGT	2	8	1371502	1371509	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3629	NC_012850	AGAT	2	8	1371516	1371523	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_012850	GTG	2	6	1371666	1371671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_012850	CG	3	6	1372209	1372214	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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