MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 12330

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_012850	TGC	2	6	901965	901970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2502	NC_012850	CAA	2	6	901973	901978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2503	NC_012850	GCC	3	9	902930	902938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2504	NC_012850	GGC	2	6	904451	904456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2505	NC_012850	ACG	2	6	904494	904499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2506	NC_012850	TC	3	6	904584	904589	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2507	NC_012850	CGCC	2	8	905673	905680	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2508	NC_012850	CG	3	6	905729	905734	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2509	NC_012850	GAC	2	6	908575	908580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2510	NC_012850	AG	3	6	908587	908592	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_012850	GGT	2	6	909655	909660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_012850	TGT	2	6	910564	910569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2513	NC_012850	GGC	2	6	911393	911398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2514	NC_012850	GCC	2	6	911408	911413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2515	NC_012850	GA	3	6	911527	911532	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_012850	ATT	2	6	911533	911538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_012850	TTGC	2	8	911592	911599	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2518	NC_012850	ATT	2	6	911666	911671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_012850	CTG	2	6	911933	911938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2520	NC_012850	GCA	2	6	911951	911956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2521	NC_012850	GCA	2	6	911973	911978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2522	NC_012850	CGG	3	9	912017	912025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2523	NC_012850	AGC	2	6	912141	912146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2524	NC_012850	GCG	2	6	912479	912484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2525	NC_012850	GCC	2	6	912485	912490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2526	NC_012850	AGGA	2	8	912496	912503	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_012850	CG	3	6	912855	912860	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2528	NC_012850	AGG	2	6	912879	912884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_012850	CGATTT	2	12	912920	912931	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2530	NC_012850	GCA	2	6	912942	912947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2531	NC_012850	CGC	2	6	912949	912954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2532	NC_012850	TC	3	6	913201	913206	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2533	NC_012850	GC	3	6	913208	913213	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2534	NC_012850	CCCG	2	8	913215	913222	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2535	NC_012850	CAT	2	6	913740	913745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2536	NC_012850	ATA	2	6	913824	913829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_012850	AGC	2	6	914322	914327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2538	NC_012850	GCC	2	6	914425	914430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2539	NC_012850	CGG	2	6	914611	914616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2540	NC_012850	CAT	2	6	914632	914637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2541	NC_012850	AAGGAG	2	12	915118	915129	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_012850	GGA	2	6	915156	915161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_012850	CCA	2	6	915908	915913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2544	NC_012850	GCC	2	6	917299	917304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2545	NC_012850	GAA	2	6	917955	917960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2546	NC_012850	TTG	2	6	918048	918053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2547	NC_012850	GCG	2	6	918075	918080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2548	NC_012850	CGC	2	6	918086	918091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2549	NC_012850	GC	3	6	919657	919662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2550	NC_012850	GC	3	6	919721	919726	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2551	NC_012850	ATA	2	6	919855	919860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_012850	TCC	2	6	919874	919879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2553	NC_012850	AAG	2	6	919919	919924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_012850	CA	3	6	922171	922176	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2555	NC_012850	TGC	2	6	922218	922223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2556	NC_012850	AAG	2	6	922230	922235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2557	NC_012850	GGA	2	6	922323	922328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_012850	CGGT	2	8	922406	922413	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2559	NC_012850	CGC	2	6	922445	922450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2560	NC_012850	GCC	2	6	924044	924049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2561	NC_012850	GCC	2	6	924074	924079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2562	NC_012850	GCAG	2	8	924109	924116	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2563	NC_012850	AGG	2	6	924233	924238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_012850	TTG	2	6	924663	924668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2565	NC_012850	AAGC	2	8	924702	924709	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2566	NC_012850	CTG	2	6	925278	925283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2567	NC_012850	GC	3	6	927186	927191	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2568	NC_012850	CTTG	2	8	927267	927274	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2569	NC_012850	CGG	2	6	927276	927281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2570	NC_012850	CTG	2	6	928070	928075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2571	NC_012850	TCG	2	6	928086	928091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2572	NC_012850	TGG	2	6	928095	928100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2573	NC_012850	GAC	2	6	928136	928141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2574	NC_012850	CGA	2	6	928162	928167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2575	NC_012850	TCA	2	6	929481	929486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2576	NC_012850	GCG	2	6	929493	929498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2577	NC_012850	GTC	2	6	929542	929547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2578	NC_012850	TC	3	6	929546	929551	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2579	NC_012850	CAT	2	6	929552	929557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2580	NC_012850	CTC	2	6	929591	929596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2581	NC_012850	GCC	2	6	929611	929616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2582	NC_012850	CT	3	6	929646	929651	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2583	NC_012850	GCA	2	6	929870	929875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2584	NC_012850	GCG	2	6	929905	929910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2585	NC_012850	CGA	2	6	930067	930072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2586	NC_012850	GAG	2	6	930084	930089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2587	NC_012850	GC	3	6	932488	932493	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2588	NC_012850	GCT	2	6	932497	932502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2589	NC_012850	GCGCC	2	10	932505	932514	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2590	NC_012850	GGC	2	6	932530	932535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2591	NC_012850	CA	3	6	932548	932553	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2592	NC_012850	GC	4	8	932566	932573	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2593	NC_012850	TTTGA	2	10	932579	932588	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2594	NC_012850	CA	3	6	932615	932620	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2595	NC_012850	GGT	2	6	933613	933618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2596	NC_012850	GCT	2	6	933686	933691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2597	NC_012850	ACG	2	6	933720	933725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2598	NC_012850	CGA	2	6	934250	934255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2599	NC_012850	ATG	2	6	934264	934269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2600	NC_012850	GAA	2	6	934276	934281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_012850	CACG	2	8	934288	934295	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2602	NC_012850	CG	3	6	934294	934299	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2603	NC_012850	TCTT	2	8	934774	934781	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2604	NC_012850	CTT	3	9	934794	934802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2605	NC_012850	TGT	2	6	934863	934868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_012850	AAG	2	6	934896	934901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2607	NC_012850	CG	3	6	934962	934967	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2608	NC_012850	GCA	2	6	936104	936109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2609	NC_012850	TAT	2	6	936123	936128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_012850	GGC	2	6	936231	936236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2611	NC_012850	CTC	2	6	936243	936248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2612	NC_012850	TGC	2	6	937339	937344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2613	NC_012850	CAT	2	6	937362	937367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2614	NC_012850	CAGC	2	8	937377	937384	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2615	NC_012850	CATTC	2	10	937393	937402	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
2616	NC_012850	CAT	2	6	937403	937408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2617	NC_012850	TGC	2	6	937442	937447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2619	NC_012850	CGG	2	6	937535	937540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2620	NC_012850	AGG	2	6	937560	937565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2621	NC_012850	ACG	2	6	938510	938515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2622	NC_012850	AAGCGC	2	12	938524	938535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2623	NC_012850	CGG	2	6	938551	938556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2624	NC_012850	AGCCC	2	10	938562	938571	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2625	NC_012850	AC	3	6	939237	939242	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2626	NC_012850	TGT	2	6	939248	939253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2627	NC_012850	TGC	2	6	939311	939316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2628	NC_012850	TGA	2	6	940298	940303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2629	NC_012850	AAAT	2	8	940330	940337	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2630	NC_012850	CTTT	2	8	941652	941659	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2631	NC_012850	T	6	6	941657	941662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2632	NC_012850	CCTC	2	8	943375	943382	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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2634	NC_012850	C	6	6	944617	944622	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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2902	NC_012850	GCT	2	6	1039223	1039228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2904	NC_012850	ATTG	2	8	1039613	1039620	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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