MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 12330

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_012850	AGC	2	6	603892	603897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_012850	ATT	2	6	603935	603940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_012850	AGA	2	6	603951	603956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_012850	ATT	2	6	603972	603977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_012850	GGA	2	6	604079	604084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_012850	GCT	2	6	604166	604171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_012850	CCG	2	6	606032	606037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1508	NC_012850	CGG	2	6	606048	606053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_012850	AAT	2	6	606101	606106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_012850	T	6	6	606118	606123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_012850	GCA	2	6	606158	606163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_012850	AGC	2	6	606174	606179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_012850	TCT	2	6	606190	606195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_012850	GC	3	6	606202	606207	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1515	NC_012850	CGG	2	6	608148	608153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_012850	CCG	2	6	608697	608702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1517	NC_012850	GGC	2	6	608705	608710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_012850	GGGA	2	8	610859	610866	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_012850	CGC	2	6	610936	610941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1520	NC_012850	TTGCC	2	10	610993	611002	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1521	NC_012850	AG	3	6	613444	613449	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_012850	CTA	2	6	613450	613455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_012850	CGC	2	6	615486	615491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1524	NC_012850	GAT	2	6	616435	616440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_012850	CTT	2	6	616463	616468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_012850	CGG	2	6	616477	616482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_012850	CGC	2	6	616485	616490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1528	NC_012850	CGGGCG	2	12	617474	617485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_012850	AGG	2	6	617499	617504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_012850	GAT	2	6	618494	618499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_012850	GATTGA	2	12	619093	619104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_012850	TCT	2	6	619815	619820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_012850	GCC	2	6	619859	619864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1534	NC_012850	CCT	2	6	619904	619909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1535	NC_012850	GGTGT	2	10	619957	619966	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_012850	TCG	2	6	620035	620040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_012850	CTG	2	6	623422	623427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_012850	GCA	2	6	623431	623436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_012850	TCC	2	6	624900	624905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1540	NC_012850	CG	3	6	624923	624928	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1541	NC_012850	TGC	2	6	624968	624973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_012850	GCA	2	6	625008	625013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_012850	CCG	2	6	626033	626038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1544	NC_012850	TTC	2	6	626671	626676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_012850	GGTC	2	8	626677	626684	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1546	NC_012850	CAG	3	9	626690	626698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_012850	GAAGGA	2	12	627006	627017	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_012850	GC	3	6	627023	627028	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1549	NC_012850	CCG	2	6	627031	627036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1550	NC_012850	GCAT	2	8	628364	628371	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1551	NC_012850	CAT	2	6	628402	628407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_012850	GA	3	6	628537	628542	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_012850	TGG	2	6	629113	629118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_012850	GGC	2	6	629131	629136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_012850	CG	4	8	629151	629158	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1556	NC_012850	GGT	2	6	629198	629203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_012850	GGC	2	6	629204	629209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_012850	GC	3	6	629226	629231	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1559	NC_012850	GAA	2	6	630368	630373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_012850	CGAG	2	8	630432	630439	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1561	NC_012850	GGA	2	6	630450	630455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_012850	GCC	2	6	633008	633013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1563	NC_012850	GCC	2	6	636076	636081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1564	NC_012850	C	6	6	636141	636146	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1565	NC_012850	GCG	2	6	636147	636152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_012850	CGG	2	6	637342	637347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_012850	CGC	2	6	637372	637377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1568	NC_012850	GTC	2	6	637385	637390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_012850	GCGG	2	8	639369	639376	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1570	NC_012850	T	6	6	639394	639399	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_012850	G	6	6	639454	639459	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_012850	AGA	2	6	639460	639465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_012850	GCG	2	6	639471	639476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_012850	ATG	2	6	641579	641584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_012850	CAT	2	6	641613	641618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_012850	CGG	2	6	641663	641668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_012850	CGATC	2	10	641687	641696	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1578	NC_012850	GGA	2	6	641698	641703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_012850	ATC	2	6	641709	641714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_012850	CG	3	6	642707	642712	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1581	NC_012850	GC	3	6	642750	642755	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1582	NC_012850	CG	3	6	642756	642761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1583	NC_012850	CG	3	6	642772	642777	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1584	NC_012850	CAG	2	6	644863	644868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_012850	CAA	2	6	644891	644896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_012850	GGA	2	6	645003	645008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_012850	AGT	2	6	645075	645080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_012850	GCT	2	6	645529	645534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_012850	TCT	2	6	645699	645704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_012850	CGC	2	6	646191	646196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1591	NC_012850	ATG	2	6	646251	646256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_012850	TGA	2	6	646284	646289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_012850	CCG	2	6	646314	646319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1594	NC_012850	TCA	2	6	646323	646328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_012850	TTC	2	6	646339	646344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1596	NC_012850	G	6	6	646431	646436	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_012850	TGC	2	6	646454	646459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_012850	CGGA	2	8	646601	646608	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1599	NC_012850	TC	3	6	646616	646621	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1600	NC_012850	CATA	2	8	647478	647485	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1601	NC_012850	CTT	2	6	647492	647497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_012850	TAC	2	6	647543	647548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_012850	CGA	2	6	647559	647564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_012850	AGC	2	6	647570	647575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_012850	CAG	2	6	647618	647623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_012850	AG	3	6	647625	647630	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_012850	GAG	2	6	650594	650599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_012850	ACA	2	6	650630	650635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_012850	GGAG	2	8	650656	650663	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_012850	CGG	2	6	652018	652023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_012850	ACA	2	6	652138	652143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_012850	TGA	3	9	652162	652170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_012850	TAT	2	6	653954	653959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_012850	AAC	2	6	653986	653991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_012850	T	6	6	654014	654019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_012850	CCA	3	9	654087	654095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1617	NC_012850	ACC	2	6	654098	654103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1618	NC_012850	TGGAGG	2	12	654142	654153	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_012850	CGG	2	6	654175	654180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_012850	TGGCGG	2	12	654187	654198	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
1621	NC_012850	TGG	2	6	654202	654207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_012850	AGG	2	6	654208	654213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_012850	T	6	6	654263	654268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_012850	CGGG	2	8	654282	654289	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1625	NC_012850	GC	3	6	654318	654323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1626	NC_012850	GCC	2	6	656405	656410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1627	NC_012850	ACG	2	6	656952	656957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_012850	AAG	2	6	656977	656982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_012850	GGA	2	6	658971	658976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_012850	CCG	2	6	659054	659059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1631	NC_012850	CCA	2	6	659100	659105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1632	NC_012850	CAG	2	6	659185	659190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1634	NC_012850	ATG	2	6	659283	659288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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