MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 12330

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012850	GCT	2	6	384094	384099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_012850	CCT	2	6	384580	384585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1003	NC_012850	CAT	2	6	388551	388556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_012850	CAT	2	6	389492	389497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_012850	ATC	2	6	389501	389506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_012850	GAC	2	6	389507	389512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_012850	GC	3	6	389544	389549	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1008	NC_012850	TAA	2	6	389555	389560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_012850	GTT	2	6	389603	389608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_012850	CGG	2	6	389682	389687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_012850	GCA	2	6	389757	389762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_012850	AGG	2	6	389771	389776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_012850	CG	3	6	390633	390638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1014	NC_012850	CG	3	6	390649	390654	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1015	NC_012850	ATC	2	6	390718	390723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_012850	CAT	2	6	390752	390757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_012850	TTGCC	2	10	392575	392584	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1018	NC_012850	GA	3	6	392660	392665	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_012850	ATG	2	6	393576	393581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_012850	GAC	2	6	393605	393610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_012850	TCC	2	6	394655	394660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1022	NC_012850	GCCC	2	8	394663	394670	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1023	NC_012850	GCC	2	6	394693	394698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1024	NC_012850	ATC	2	6	394732	394737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_012850	GC	3	6	394740	394745	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1026	NC_012850	GCC	2	6	396329	396334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1027	NC_012850	CGG	2	6	396342	396347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_012850	AT	3	6	396398	396403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_012850	GGGA	2	8	396491	396498	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_012850	GA	4	8	400409	400416	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_012850	GGC	2	6	401507	401512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_012850	GCT	2	6	401581	401586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_012850	TTTG	2	8	402093	402100	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_012850	CGG	2	6	403978	403983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_012850	TC	3	6	406210	406215	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1036	NC_012850	GGC	2	6	406229	406234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_012850	TAATC	2	10	406240	406249	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1038	NC_012850	A	6	6	406255	406260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_012850	GTGCA	2	10	406267	406276	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1040	NC_012850	TC	3	6	406282	406287	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1041	NC_012850	AC	3	6	409086	409091	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1042	NC_012850	CAT	2	6	409114	409119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_012850	TTG	3	9	410603	410611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_012850	AG	3	6	410616	410621	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_012850	TCACC	2	10	410822	410831	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1046	NC_012850	CGA	2	6	410833	410838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_012850	CCG	2	6	410882	410887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1048	NC_012850	GTT	2	6	410955	410960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_012850	GCC	2	6	410983	410988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1050	NC_012850	GCC	2	6	411053	411058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1051	NC_012850	GAG	2	6	411064	411069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_012850	GACC	2	8	413632	413639	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1053	NC_012850	GGC	2	6	413723	413728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_012850	GTCC	2	8	413749	413756	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1055	NC_012850	CG	3	6	416943	416948	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1056	NC_012850	CG	3	6	416959	416964	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1057	NC_012850	GAA	2	6	416971	416976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_012850	GGCT	2	8	417001	417008	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1059	NC_012850	TCT	2	6	417252	417257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_012850	CCT	2	6	417258	417263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1061	NC_012850	GAG	2	6	418672	418677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_012850	TTCC	2	8	420209	420216	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1063	NC_012850	AACA	2	8	420270	420277	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1064	NC_012850	CGGA	2	8	421398	421405	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1065	NC_012850	T	7	7	421418	421424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_012850	AAT	2	6	421474	421479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_012850	CTC	2	6	424394	424399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1068	NC_012850	CCG	2	6	426366	426371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1069	NC_012850	CG	3	6	426453	426458	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1070	NC_012850	ATG	2	6	426512	426517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_012850	CAT	2	6	426546	426551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_012850	AATGC	2	10	426589	426598	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1073	NC_012850	GAG	2	6	426624	426629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_012850	TTG	2	6	428753	428758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_012850	GGC	2	6	428777	428782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_012850	CTT	2	6	432658	432663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_012850	TTA	2	6	432675	432680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_012850	AGA	2	6	432706	432711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_012850	AAT	2	6	432757	432762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_012850	TA	3	6	432788	432793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_012850	CAT	2	6	432796	432801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_012850	CAA	2	6	432803	432808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_012850	GCAG	2	8	432811	432818	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1084	NC_012850	C	6	6	433488	433493	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1085	NC_012850	AGC	2	6	435521	435526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_012850	AGG	2	6	435633	435638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_012850	CTG	2	6	437269	437274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_012850	TA	3	6	437452	437457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_012850	GTTTTT	2	12	438019	438030	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_012850	GGT	2	6	438041	438046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_012850	TAAA	2	8	438221	438228	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_012850	A	6	6	438281	438286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_012850	AAC	2	6	438288	438293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_012850	AAT	2	6	439908	439913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_012850	CGG	2	6	439944	439949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_012850	CCG	2	6	439964	439969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1097	NC_012850	TCCG	2	8	443900	443907	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1098	NC_012850	GAG	2	6	443971	443976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_012850	CGG	2	6	447404	447409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_012850	ATT	2	6	447437	447442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_012850	GAA	2	6	447468	447473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_012850	TC	3	6	447516	447521	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1103	NC_012850	GAG	2	6	447540	447545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_012850	AC	3	6	451366	451371	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1105	NC_012850	CCA	3	9	451388	451396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_012850	TGG	2	6	451483	451488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_012850	ATAGC	2	10	451494	451503	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1108	NC_012850	CGT	2	6	451507	451512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_012850	GAC	2	6	451657	451662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_012850	ACG	2	6	451671	451676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_012850	ATG	2	6	451776	451781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_012850	ATT	2	6	451819	451824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_012850	GAT	2	6	451881	451886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_012850	CGCT	2	8	451887	451894	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1115	NC_012850	GTC	2	6	451934	451939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_012850	TCG	2	6	451979	451984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_012850	GCA	2	6	451995	452000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_012850	CG	3	6	452048	452053	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1119	NC_012850	CCG	2	6	452100	452105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1120	NC_012850	CCG	2	6	452136	452141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1121	NC_012850	GCGAG	2	10	452256	452265	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1122	NC_012850	CTG	2	6	453027	453032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_012850	GGCGAG	2	12	453045	453056	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
1124	NC_012850	GCG	2	6	453071	453076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_012850	GAT	2	6	453080	453085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_012850	CGT	2	6	453095	453100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_012850	GTCC	2	8	453104	453111	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1128	NC_012850	TC	3	6	455225	455230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1129	NC_012850	AAC	2	6	455290	455295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_012850	GCG	2	6	455302	455307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_012850	GC	3	6	455364	455369	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1132	NC_012850	T	7	7	455461	455467	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_012850	TCCTG	2	10	455470	455479	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1134	NC_012850	GCC	2	6	455553	455558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1135	NC_012850	TTG	2	6	455590	455595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_012850	CG	3	6	455610	455615	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1267	NC_012850	GCG	2	6	499223	499228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1268	NC_012850	GGAAA	2	10	499321	499330	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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1407	NC_012850	ACCT	2	8	566575	566582	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1408	NC_012850	TGG	2	6	566666	566671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1409	NC_012850	CGC	2	6	566784	566789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1410	NC_012850	GCAA	2	8	566792	566799	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1411	NC_012850	GTT	2	6	570053	570058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1429	NC_012850	CGG	2	6	572319	572324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1430	NC_012850	TCC	2	6	572384	572389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1433	NC_012850	AAG	2	6	572439	572444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1434	NC_012850	GCC	2	6	573630	573635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1435	NC_012850	CAA	2	6	573675	573680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1439	NC_012850	GTG	2	6	573827	573832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1440	NC_012850	ATT	2	6	573862	573867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1441	NC_012850	ATG	2	6	573898	573903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1442	NC_012850	TGC	2	6	573910	573915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1443	NC_012850	GTC	2	6	573931	573936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1444	NC_012850	TTGTC	2	10	573975	573984	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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1447	NC_012850	TCCC	2	8	577078	577085	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1448	NC_012850	TTTGA	2	10	578548	578557	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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1485	NC_012850	C	6	6	594782	594787	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1486	NC_012850	AAGA	2	8	594795	594802	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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