MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 12330

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_012850	TCG	2	6	2487992	2487997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6502	NC_012850	CCG	2	6	2488052	2488057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6503	NC_012850	TCC	2	6	2488060	2488065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6504	NC_012850	GGA	2	6	2488078	2488083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6505	NC_012850	CCG	2	6	2489018	2489023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6506	NC_012850	ACA	2	6	2489104	2489109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6507	NC_012850	TCG	2	6	2492621	2492626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6508	NC_012850	CA	3	6	2492662	2492667	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6509	NC_012850	GCC	2	6	2492684	2492689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6510	NC_012850	CGG	2	6	2492695	2492700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6511	NC_012850	CGGT	2	8	2492742	2492749	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6512	NC_012850	A	6	6	2494527	2494532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6513	NC_012850	CAA	2	6	2494623	2494628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6514	NC_012850	CAT	2	6	2494637	2494642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6515	NC_012850	CAG	2	6	2494686	2494691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6516	NC_012850	GAA	2	6	2495690	2495695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6517	NC_012850	GCC	2	6	2495706	2495711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6518	NC_012850	C	6	6	2495710	2495715	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6519	NC_012850	CGC	2	6	2495718	2495723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6520	NC_012850	CGC	3	9	2495729	2495737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6521	NC_012850	CAA	2	6	2495739	2495744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6522	NC_012850	ACG	3	9	2495753	2495761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6523	NC_012850	AAT	2	6	2496239	2496244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6524	NC_012850	TTG	2	6	2496268	2496273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6525	NC_012850	GCCG	2	8	2496286	2496293	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6526	NC_012850	AT	3	6	2496304	2496309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6527	NC_012850	AGG	2	6	2497501	2497506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6528	NC_012850	GAA	2	6	2499323	2499328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6529	NC_012850	CGG	2	6	2499371	2499376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6530	NC_012850	AGG	2	6	2499499	2499504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6531	NC_012850	ATTC	2	8	2499564	2499571	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6532	NC_012850	CT	3	6	2499613	2499618	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6533	NC_012850	GGC	2	6	2502644	2502649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6534	NC_012850	TG	3	6	2502666	2502671	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6535	NC_012850	TTC	2	6	2503216	2503221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6536	NC_012850	CG	3	6	2503222	2503227	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6537	NC_012850	CG	3	6	2503283	2503288	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6538	NC_012850	CCCG	2	8	2503339	2503346	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6539	NC_012850	ATA	2	6	2503357	2503362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6540	NC_012850	AAACC	2	10	2503372	2503381	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
6541	NC_012850	A	6	6	2503443	2503448	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6542	NC_012850	GTC	2	6	2503515	2503520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6543	NC_012850	T	6	6	2503539	2503544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6544	NC_012850	ACC	2	6	2506484	2506489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6545	NC_012850	TCT	2	6	2506606	2506611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6546	NC_012850	AGA	2	6	2509584	2509589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6547	NC_012850	TGC	2	6	2509619	2509624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6548	NC_012850	GAG	2	6	2509667	2509672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6549	NC_012850	CAGCC	2	10	2510153	2510162	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
6550	NC_012850	CAAT	2	8	2510204	2510211	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6551	NC_012850	GCTCC	2	10	2510226	2510235	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6552	NC_012850	TGCC	2	8	2510263	2510270	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6553	NC_012850	A	6	6	2510286	2510291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6554	NC_012850	GCTT	2	8	2510439	2510446	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6555	NC_012850	GACTG	2	10	2510499	2510508	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6556	NC_012850	GGC	2	6	2510534	2510539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6557	NC_012850	ATCG	2	8	2510608	2510615	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6558	NC_012850	TAC	2	6	2510658	2510663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6559	NC_012850	CG	3	6	2510918	2510923	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6560	NC_012850	CGG	2	6	2510969	2510974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6561	NC_012850	GCCC	2	8	2511022	2511029	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6562	NC_012850	GCG	2	6	2511032	2511037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6563	NC_012850	GCG	2	6	2511051	2511056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6564	NC_012850	GGC	2	6	2513093	2513098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6565	NC_012850	CGC	2	6	2513113	2513118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6566	NC_012850	TGT	2	6	2513158	2513163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6567	NC_012850	CAG	2	6	2513209	2513214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6568	NC_012850	CGG	2	6	2513224	2513229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6569	NC_012850	AC	3	6	2513240	2513245	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6570	NC_012850	AT	3	6	2513259	2513264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6571	NC_012850	CGGA	2	8	2513274	2513281	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6572	NC_012850	AAT	2	6	2513293	2513298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6573	NC_012850	A	7	7	2513299	2513305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6574	NC_012850	AGC	2	6	2513401	2513406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6575	NC_012850	CG	3	6	2513430	2513435	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6576	NC_012850	AATAG	2	10	2513497	2513506	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6577	NC_012850	CTT	2	6	2513558	2513563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6578	NC_012850	CCAA	2	8	2513643	2513650	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6579	NC_012850	CAAC	2	8	2513654	2513661	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6580	NC_012850	GCC	2	6	2514890	2514895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6581	NC_012850	CGTG	2	8	2514912	2514919	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6582	NC_012850	T	6	6	2514984	2514989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6583	NC_012850	A	6	6	2515013	2515018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6584	NC_012850	CTC	2	6	2515283	2515288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6585	NC_012850	GCC	2	6	2515343	2515348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6586	NC_012850	ACG	2	6	2515362	2515367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6587	NC_012850	CCG	3	9	2516498	2516506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6588	NC_012850	ACC	2	6	2516534	2516539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6589	NC_012850	TGT	2	6	2516550	2516555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6590	NC_012850	GGC	2	6	2516628	2516633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6591	NC_012850	TTC	2	6	2516678	2516683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6592	NC_012850	GCC	2	6	2516696	2516701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6593	NC_012850	CCTT	2	8	2516703	2516710	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6594	NC_012850	GCCG	2	8	2516761	2516768	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6595	NC_012850	CAG	2	6	2516779	2516784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6596	NC_012850	GC	3	6	2516786	2516791	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6597	NC_012850	GTGA	2	8	2516898	2516905	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6598	NC_012850	CATA	2	8	2517567	2517574	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6599	NC_012850	TCCC	2	8	2517576	2517583	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6600	NC_012850	TTCCC	2	10	2517603	2517612	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
6601	NC_012850	GTGA	2	8	2517647	2517654	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6602	NC_012850	T	6	6	2518222	2518227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6603	NC_012850	GAT	2	6	2518228	2518233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6604	NC_012850	GACG	2	8	2519045	2519052	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6605	NC_012850	GCCC	2	8	2519066	2519073	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6606	NC_012850	TCCG	2	8	2519078	2519085	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6607	NC_012850	TGGGG	2	10	2519097	2519106	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
6608	NC_012850	GCA	2	6	2519122	2519127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6609	NC_012850	CG	3	6	2520138	2520143	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6610	NC_012850	G	6	6	2520233	2520238	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6611	NC_012850	TCTG	2	8	2522317	2522324	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6612	NC_012850	GCA	2	6	2522339	2522344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6613	NC_012850	TGC	3	9	2522372	2522380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6614	NC_012850	TTG	2	6	2522383	2522388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6615	NC_012850	GCA	2	6	2522411	2522416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6616	NC_012850	AGCG	2	8	2522580	2522587	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6617	NC_012850	AGGCT	2	10	2523177	2523186	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6618	NC_012850	TGC	3	9	2523255	2523263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6619	NC_012850	CCGA	2	8	2525909	2525916	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6620	NC_012850	TC	3	6	2526455	2526460	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6621	NC_012850	CAA	2	6	2526496	2526501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6622	NC_012850	GGA	2	6	2526530	2526535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6623	NC_012850	GCC	2	6	2527210	2527215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6624	NC_012850	GCC	2	6	2527222	2527227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6625	NC_012850	TGC	2	6	2527278	2527283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6626	NC_012850	ATC	2	6	2527312	2527317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6627	NC_012850	GA	3	6	2527331	2527336	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6628	NC_012850	CTCC	2	8	2527583	2527590	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6629	NC_012850	CGC	3	9	2527659	2527667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6630	NC_012850	CGA	2	6	2528396	2528401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6631	NC_012850	CA	3	6	2528422	2528427	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6632	NC_012850	GC	3	6	2529131	2529136	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6633	NC_012850	GCCG	2	8	2529139	2529146	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6634	NC_012850	TA	3	6	2529830	2529835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6635	NC_012850	GGCCC	2	10	2530980	2530989	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6636	NC_012850	ATCG	2	8	2531018	2531025	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6637	NC_012850	GCG	2	6	2531064	2531069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6638	NC_012850	AGCG	2	8	2531094	2531101	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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6649	NC_012850	AC	3	6	2535936	2535941	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6650	NC_012850	TTA	2	6	2535955	2535960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6651	NC_012850	ATCA	2	8	2535974	2535981	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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6655	NC_012850	ACG	2	6	2538271	2538276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6669	NC_012850	CGCC	2	8	2539672	2539679	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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6672	NC_012850	ACTA	2	8	2541159	2541166	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6673	NC_012850	GCG	2	6	2541169	2541174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6674	NC_012850	CGC	2	6	2541221	2541226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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