MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 12330

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_012850	CGG	2	6	1697063	1697068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4502	NC_012850	TGAC	2	8	1697080	1697087	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4503	NC_012850	GAG	3	9	1697094	1697102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_012850	TGT	2	6	1697103	1697108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_012850	GC	3	6	1697121	1697126	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4506	NC_012850	GAG	3	9	1697130	1697138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_012850	CCGGG	2	10	1697193	1697202	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4508	NC_012850	TGC	2	6	1697416	1697421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4509	NC_012850	CGC	2	6	1699273	1699278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4510	NC_012850	AGGCAT	2	12	1699300	1699311	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4511	NC_012850	TC	3	6	1699394	1699399	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4512	NC_012850	CG	3	6	1699528	1699533	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4513	NC_012850	CGT	2	6	1699547	1699552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4514	NC_012850	AACG	2	8	1699562	1699569	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4515	NC_012850	GCC	2	6	1699583	1699588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4516	NC_012850	T	6	6	1701099	1701104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_012850	CGC	2	6	1701174	1701179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4518	NC_012850	AAC	2	6	1701206	1701211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4519	NC_012850	TGG	2	6	1701254	1701259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_012850	GCC	2	6	1701803	1701808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4521	NC_012850	TATC	2	8	1703599	1703606	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4522	NC_012850	CAC	2	6	1703661	1703666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4523	NC_012850	A	7	7	1703703	1703709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_012850	TAC	2	6	1703755	1703760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4525	NC_012850	AGC	2	6	1703770	1703775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4526	NC_012850	ACC	2	6	1703809	1703814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4527	NC_012850	TAG	2	6	1703881	1703886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_012850	GCA	2	6	1703972	1703977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4529	NC_012850	CGC	2	6	1703987	1703992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4530	NC_012850	GAC	2	6	1703994	1703999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4531	NC_012850	TCG	2	6	1704007	1704012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4532	NC_012850	TGC	3	9	1704045	1704053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4533	NC_012850	TCG	2	6	1704058	1704063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4534	NC_012850	CG	3	6	1704062	1704067	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4535	NC_012850	CCG	2	6	1704068	1704073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4536	NC_012850	CATG	2	8	1704104	1704111	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4537	NC_012850	CCG	2	6	1704201	1704206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4538	NC_012850	CGT	2	6	1704345	1704350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4539	NC_012850	GACC	2	8	1704424	1704431	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4540	NC_012850	GC	3	6	1704452	1704457	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4541	NC_012850	CGT	2	6	1704493	1704498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4542	NC_012850	GCC	2	6	1704529	1704534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4543	NC_012850	GAT	2	6	1704550	1704555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_012850	GGC	2	6	1704580	1704585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4545	NC_012850	CGA	2	6	1704608	1704613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4546	NC_012850	CGA	2	6	1706200	1706205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4547	NC_012850	TCT	2	6	1707447	1707452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4548	NC_012850	CGGG	2	8	1707462	1707469	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4549	NC_012850	CAC	2	6	1707512	1707517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4550	NC_012850	CTG	2	6	1707521	1707526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4551	NC_012850	CAG	2	6	1707541	1707546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4552	NC_012850	TCT	2	6	1707547	1707552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4553	NC_012850	CGA	2	6	1707590	1707595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4554	NC_012850	TCG	2	6	1707612	1707617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4555	NC_012850	AGC	2	6	1707621	1707626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4556	NC_012850	CAGTC	2	10	1709414	1709423	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4557	NC_012850	GATT	2	8	1709498	1709505	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_012850	GGGC	2	8	1710238	1710245	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4559	NC_012850	GGT	2	6	1710284	1710289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_012850	CGC	3	9	1711315	1711323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4561	NC_012850	GAC	2	6	1711494	1711499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4562	NC_012850	ATA	2	6	1711548	1711553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_012850	TGAT	2	8	1714243	1714250	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_012850	T	7	7	1714927	1714933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_012850	GC	3	6	1714943	1714948	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4566	NC_012850	CAGG	2	8	1714983	1714990	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4567	NC_012850	TAT	2	6	1715018	1715023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_012850	ATC	2	6	1715093	1715098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4569	NC_012850	ACGG	2	8	1716016	1716023	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4570	NC_012850	CAA	2	6	1718740	1718745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4571	NC_012850	TCA	2	6	1720309	1720314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4572	NC_012850	CG	3	6	1720328	1720333	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4573	NC_012850	AC	3	6	1720343	1720348	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4574	NC_012850	ACG	2	6	1720354	1720359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4575	NC_012850	GCA	2	6	1720379	1720384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4576	NC_012850	ACG	2	6	1724317	1724322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4577	NC_012850	TGAA	2	8	1724347	1724354	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_012850	TGA	2	6	1724429	1724434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_012850	GGC	2	6	1724438	1724443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4580	NC_012850	GCT	2	6	1724449	1724454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4581	NC_012850	CGG	2	6	1725232	1725237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4582	NC_012850	GTC	2	6	1725242	1725247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4583	NC_012850	TCG	2	6	1725251	1725256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4584	NC_012850	AGA	2	6	1725257	1725262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_012850	GCGTC	2	10	1725289	1725298	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4586	NC_012850	TGA	2	6	1725366	1725371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4587	NC_012850	GAA	2	6	1725405	1725410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_012850	GCT	2	6	1726595	1726600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4589	NC_012850	CT	3	6	1726603	1726608	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4590	NC_012850	CGG	2	6	1727989	1727994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4591	NC_012850	ACTG	2	8	1727996	1728003	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4592	NC_012850	ACC	2	6	1728052	1728057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4593	NC_012850	ACG	2	6	1728059	1728064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4594	NC_012850	ACG	2	6	1728131	1728136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4595	NC_012850	CGC	2	6	1730662	1730667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4596	NC_012850	TGA	2	6	1730680	1730685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_012850	GCC	2	6	1730719	1730724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4598	NC_012850	GAAC	2	8	1730733	1730740	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4599	NC_012850	GCC	2	6	1730760	1730765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4600	NC_012850	GCC	2	6	1732032	1732037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4601	NC_012850	GATC	2	8	1732053	1732060	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4602	NC_012850	TCCCG	2	10	1733394	1733403	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4603	NC_012850	GCC	2	6	1733416	1733421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4604	NC_012850	T	6	6	1733439	1733444	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_012850	GTC	2	6	1733527	1733532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4606	NC_012850	GCT	2	6	1733831	1733836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4607	NC_012850	GA	3	6	1735717	1735722	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_012850	CTTC	2	8	1735800	1735807	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4609	NC_012850	GTG	2	6	1735808	1735813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_012850	A	6	6	1735861	1735866	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_012850	ATTT	2	8	1735882	1735889	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_012850	GCG	2	6	1735917	1735922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4613	NC_012850	CGG	2	6	1735942	1735947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4614	NC_012850	CG	3	6	1735965	1735970	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4615	NC_012850	GCCG	2	8	1736004	1736011	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4616	NC_012850	TCGA	2	8	1736015	1736022	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4617	NC_012850	GAC	2	6	1736025	1736030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4618	NC_012850	GTC	2	6	1736093	1736098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4619	NC_012850	GC	4	8	1736143	1736150	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4620	NC_012850	GA	3	6	1736186	1736191	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_012850	CTTC	2	8	1736269	1736276	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4622	NC_012850	GTG	2	6	1736277	1736282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_012850	A	7	7	1736338	1736344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_012850	ATT	2	6	1736377	1736382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4625	NC_012850	GTT	2	6	1736406	1736411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_012850	CGA	2	6	1736421	1736426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4627	NC_012850	GGC	2	6	1736427	1736432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4628	NC_012850	CG	3	6	1736457	1736462	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4629	NC_012850	GGC	2	6	1736470	1736475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4630	NC_012850	GCG	2	6	1737624	1737629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4763	NC_012850	TCA	2	6	1768497	1768502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4764	NC_012850	CATA	2	8	1768509	1768516	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4770	NC_012850	CTTG	2	8	1773940	1773947	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4786	NC_012850	AACG	2	8	1788985	1788992	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4885	NC_012850	CG	3	6	1833325	1833330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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