MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Ralstonia pickettii 12D plasmid pRp12D02

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012849	ATGTA	2	10	2285	2294	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012849	TTGGC	2	10	10472	10481	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_012849	GCCAC	2	10	23606	23615	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4	NC_012849	GAACC	2	10	24808	24817	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_012849	GCACC	2	10	26249	26258	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
6	NC_012849	ACGTG	2	10	26648	26657	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_012849	TGCGC	2	10	42985	42994	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8	NC_012849	CTCCG	2	10	43193	43202	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
9	NC_012849	AGGGG	2	10	54898	54907	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012849	CCCCG	2	10	56466	56475	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
11	NC_012849	TCGTA	3	15	59162	59176	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_012849	ATACG	2	10	59210	59219	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_012849	GCAAG	2	10	64619	64628	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_012849	GGGGA	2	10	74184	74193	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012849	TGACA	2	10	89359	89368	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_012849	GCGTC	2	10	109822	109831	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_012849	GAAGG	2	10	121740	121749	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012849	CCATC	2	10	132805	132814	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
19	NC_012849	TTCTG	2	10	139743	139752	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_012849	CTGAT	2	10	144372	144381	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_012849	GCGCC	2	10	149644	149653	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
22	NC_012849	TTTCA	2	10	150963	150972	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_012849	ATCTC	2	10	157728	157737	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
24	NC_012849	TTTTC	2	10	159966	159975	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_012849	GCTGG	2	10	181985	181994	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
26	NC_012849	TTGGC	2	10	187075	187084	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_012849	CAGGT	2	10	189425	189434	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_012849	GGTGT	2	10	208089	208098	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012849	GCGCA	2	10	216955	216964	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
30	NC_012849	TTTTC	2	10	232328	232337	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_012849	CCAAT	2	10	240358	240367	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_012849	ACAGC	2	10	262620	262629	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_012849	TGGCG	2	10	265535	265544	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
34	NC_012849	AGTCA	2	10	266689	266698	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.