MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Ralstonia pickettii 12D plasmid pRp12D02

Total Repeats: 103

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012849	AGCG	2	8	115	122	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_012849	ATGT	2	8	7504	7511	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012849	CCTG	2	8	7593	7600	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_012849	CCAA	2	8	9634	9641	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_012849	CTTT	2	8	10657	10664	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_012849	GCAT	2	8	14291	14298	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_012849	CTGT	2	8	19742	19749	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_012849	CGGT	2	8	23844	23851	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_012849	CCGG	2	8	24636	24643	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_012849	GCTG	2	8	25076	25083	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_012849	CGCC	2	8	25124	25131	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12	NC_012849	CTGC	2	8	25811	25818	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_012849	ATCA	2	8	26148	26155	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_012849	CTGT	2	8	27924	27931	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_012849	CGGA	2	8	28037	28044	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_012849	AACT	2	8	32270	32277	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_012849	ACCC	2	8	42219	42226	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
18	NC_012849	GCCG	2	8	42819	42826	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_012849	GGTT	2	8	43123	43130	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012849	CGCC	2	8	43668	43675	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
21	NC_012849	GGCT	2	8	47873	47880	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_012849	GCCG	2	8	55481	55488	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_012849	CTTG	2	8	59107	59114	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_012849	ATCG	2	8	59119	59126	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_012849	TACC	2	8	60126	60133	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_012849	CGCA	2	8	62090	62097	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_012849	TTCA	2	8	64351	64358	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_012849	TCGC	2	8	64388	64395	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_012849	GCTC	2	8	64631	64638	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_012849	TGGA	2	8	68778	68785	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012849	TCCA	2	8	74143	74150	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_012849	AGCG	2	8	74433	74440	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_012849	ACCC	2	8	74521	74528	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
34	NC_012849	CACG	2	8	86083	86090	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_012849	CCAT	2	8	86538	86545	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_012849	GAAT	2	8	89110	89117	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012849	CTTG	2	8	89175	89182	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_012849	CATT	2	8	89417	89424	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_012849	CAGG	2	8	97318	97325	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_012849	CTTT	2	8	104738	104745	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_012849	TGGA	2	8	116292	116299	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012849	TGGG	2	8	116384	116391	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012849	GCCG	2	8	116567	116574	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_012849	GGAC	2	8	116626	116633	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_012849	CCGG	2	8	120480	120487	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_012849	ATGT	2	8	121578	121585	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012849	AGCC	2	8	124940	124947	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_012849	AGTC	2	8	125786	125793	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_012849	ACGC	2	8	131198	131205	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_012849	GGTC	2	8	131221	131228	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_012849	GGCC	2	8	132618	132625	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_012849	CATT	2	8	134560	134567	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_012849	GTCG	2	8	138128	138135	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_012849	GCCC	2	8	139120	139127	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
55	NC_012849	GGCC	2	8	139665	139672	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_012849	GCCA	2	8	139688	139695	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_012849	GACA	2	8	139756	139763	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_012849	ACGA	2	8	142463	142470	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_012849	ATCG	2	8	143088	143095	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_012849	TCGT	2	8	143141	143148	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_012849	GCCG	2	8	143643	143650	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_012849	AGCA	2	8	143780	143787	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_012849	GCCG	2	8	144424	144431	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_012849	CAGC	2	8	146828	146835	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_012849	TTCC	2	8	147955	147962	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_012849	CGGC	2	8	181379	181386	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_012849	CACG	2	8	182305	182312	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_012849	GGTG	2	8	189928	189935	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012849	ATTG	2	8	203727	203734	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012849	GCCG	2	8	203741	203748	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_012849	ATCG	2	8	206042	206049	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_012849	TGTC	2	8	207632	207639	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_012849	CGGC	2	8	208148	208155	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_012849	TTCT	2	8	209685	209692	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_012849	CGAC	2	8	215119	215126	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_012849	AGCG	2	8	217099	217106	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_012849	CACG	2	8	217326	217333	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_012849	GTGG	2	8	223130	223137	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012849	TCAG	2	8	225894	225901	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_012849	CACC	2	8	225931	225938	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
81	NC_012849	GATC	2	8	236447	236454	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_012849	CTCG	2	8	253937	253944	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_012849	GCCC	2	8	254010	254017	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
84	NC_012849	GAAA	2	8	254395	254402	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012849	GGCC	2	8	255098	255105	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_012849	GGTC	2	8	256708	256715	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_012849	CCCG	2	8	258696	258703	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
88	NC_012849	TCCA	2	8	259455	259462	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_012849	CGCC	2	8	259983	259990	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
90	NC_012849	TTCT	2	8	260455	260462	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_012849	GCGA	2	8	260527	260534	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_012849	GGGA	2	8	260585	260592	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012849	CGTT	2	8	260908	260915	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_012849	TCGT	2	8	261019	261026	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_012849	AGCA	2	8	261206	261213	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_012849	TTGC	2	8	261238	261245	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_012849	GCGA	2	8	265442	265449	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_012849	GTAG	2	8	266225	266232	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012849	CGTC	2	8	266292	266299	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_012849	GCCT	2	8	266432	266439	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_012849	CCAT	2	8	266504	266511	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_012849	GCGT	2	8	266676	266683	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_012849	GCCA	2	8	266791	266798	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.