MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132501

Total Repeats: 200

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012848	CG	3	6	2571	2576	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_012848	CG	3	6	7231	7236	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_012848	CG	3	6	14394	14399	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_012848	TA	3	6	16996	17001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012848	CT	3	6	17740	17745	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_012848	GC	3	6	24916	24921	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_012848	TC	3	6	26770	26775	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_012848	CG	3	6	36115	36120	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_012848	GC	3	6	36300	36305	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_012848	GC	3	6	36320	36325	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_012848	GC	3	6	36341	36346	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_012848	AT	3	6	40290	40295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012848	CG	3	6	40513	40518	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_012848	CG	3	6	58692	58697	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_012848	CA	3	6	64047	64052	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_012848	CG	3	6	64248	64253	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_012848	GC	3	6	64313	64318	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_012848	GC	3	6	64747	64752	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_012848	GC	3	6	65519	65524	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_012848	CG	3	6	65825	65830	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_012848	GC	3	6	66022	66027	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_012848	AG	3	6	79532	79537	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012848	CG	3	6	85578	85583	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_012848	AG	3	6	95893	95898	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012848	CG	3	6	98356	98361	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_012848	GC	4	8	99489	99496	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_012848	CG	3	6	99562	99567	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_012848	CG	3	6	99741	99746	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_012848	CA	3	6	101857	101862	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_012848	GC	3	6	110196	110201	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_012848	CG	3	6	110292	110297	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_012848	GC	3	6	110358	110363	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_012848	CT	3	6	110816	110821	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_012848	GC	4	8	113065	113072	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_012848	GC	3	6	113151	113156	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_012848	GC	3	6	113373	113378	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_012848	CG	3	6	130958	130963	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_012848	GC	3	6	138464	138469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_012848	AG	3	6	139273	139278	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012848	CG	3	6	140284	140289	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_012848	GC	3	6	146672	146677	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_012848	CA	3	6	174277	174282	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_012848	CG	3	6	187648	187653	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_012848	CG	3	6	191365	191370	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_012848	GC	3	6	192169	192174	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_012848	AG	3	6	208031	208036	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012848	GA	3	6	208051	208056	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012848	CG	3	6	208139	208144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_012848	GT	3	6	229765	229770	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012848	GC	3	6	229807	229812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_012848	GC	3	6	231352	231357	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_012848	GA	3	6	239173	239178	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012848	GC	3	6	241792	241797	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_012848	AC	3	6	260308	260313	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_012848	GC	3	6	265778	265783	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_012848	GC	3	6	266705	266710	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_012848	GC	3	6	267587	267592	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_012848	CA	3	6	267947	267952	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_012848	CG	3	6	268998	269003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_012848	GC	3	6	269427	269432	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_012848	GA	3	6	269473	269478	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012848	GA	3	6	271316	271321	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012848	GC	4	8	272313	272320	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_012848	TG	3	6	272453	272458	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012848	TA	3	6	273143	273148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012848	TA	4	8	273153	273160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012848	CT	3	6	273199	273204	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_012848	CG	3	6	273543	273548	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_012848	AG	3	6	273720	273725	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012848	TC	3	6	273827	273832	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_012848	TC	3	6	275154	275159	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_012848	GA	3	6	275187	275192	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012848	GA	3	6	275285	275290	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012848	CG	3	6	275415	275420	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_012848	GC	3	6	276688	276693	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_012848	TC	3	6	276750	276755	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_012848	AG	3	6	277104	277109	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012848	TC	3	6	277466	277471	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_012848	GC	3	6	278173	278178	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_012848	GC	3	6	278904	278909	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_012848	CG	3	6	280883	280888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_012848	GT	3	6	280977	280982	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012848	GA	3	6	288536	288541	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012848	TC	3	6	292480	292485	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_012848	GC	3	6	300062	300067	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_012848	CG	3	6	300391	300396	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_012848	CG	3	6	300948	300953	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_012848	GA	3	6	309425	309430	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012848	AT	3	6	316154	316159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012848	AT	3	6	316238	316243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012848	TA	3	6	316249	316254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012848	CG	3	6	316411	316416	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_012848	CT	4	8	316715	316722	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_012848	GC	3	6	316803	316808	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_012848	AT	3	6	327772	327777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012848	AT	3	6	327782	327787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012848	GC	3	6	329992	329997	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_012848	AC	3	6	340784	340789	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_012848	CG	3	6	340805	340810	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_012848	AT	3	6	346123	346128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012848	CG	3	6	346529	346534	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_012848	CA	3	6	346541	346546	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_012848	GA	3	6	346870	346875	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012848	CT	3	6	346888	346893	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_012848	CA	3	6	348328	348333	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_012848	GA	3	6	349917	349922	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012848	CT	3	6	351165	351170	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_012848	AG	3	6	359767	359772	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012848	GC	3	6	372381	372386	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_012848	GC	3	6	374060	374065	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_012848	TC	3	6	386843	386848	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_012848	TC	3	6	386871	386876	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_012848	GC	3	6	387029	387034	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_012848	TG	3	6	392323	392328	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012848	GT	3	6	393215	393220	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012848	GA	3	6	401488	401493	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012848	CG	3	6	402823	402828	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_012848	CA	3	6	403208	403213	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_012848	TC	4	8	419980	419987	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_012848	CT	4	8	420035	420042	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_012848	TA	3	6	420908	420913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012848	CG	3	6	423383	423388	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_012848	CG	5	10	425986	425995	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_012848	CT	3	6	426060	426065	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_012848	GC	3	6	447132	447137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_012848	CA	4	8	447171	447178	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_012848	CA	3	6	448129	448134	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_012848	TC	3	6	448232	448237	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_012848	TG	3	6	454080	454085	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012848	TA	3	6	457840	457845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012848	CG	3	6	460199	460204	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_012848	GC	3	6	460398	460403	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_012848	CT	3	6	474632	474637	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_012848	TA	3	6	474679	474684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012848	CG	3	6	485193	485198	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_012848	GC	3	6	501143	501148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_012848	TA	4	8	501786	501793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012848	GA	3	6	518968	518973	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012848	CG	3	6	531491	531496	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_012848	GC	3	6	542925	542930	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_012848	GC	3	6	542940	542945	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_012848	AG	3	6	549063	549068	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012848	CG	3	6	550831	550836	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_012848	GC	3	6	552994	552999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_012848	GC	3	6	556311	556316	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_012848	AT	3	6	556517	556522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012848	GC	3	6	556547	556552	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_012848	GC	3	6	569404	569409	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_012848	CG	3	6	569551	569556	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_012848	GC	3	6	570818	570823	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151	NC_012848	GC	3	6	570883	570888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_012848	CG	3	6	573286	573291	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
153	NC_012848	TG	3	6	580362	580367	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_012848	TC	3	6	583191	583196	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
155	NC_012848	TC	3	6	583935	583940	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
156	NC_012848	AG	3	6	600368	600373	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
157	NC_012848	GC	3	6	602451	602456	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
158	NC_012848	CG	3	6	602565	602570	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
159	NC_012848	AG	3	6	603499	603504	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
160	NC_012848	GA	3	6	616641	616646	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
161	NC_012848	AT	3	6	628782	628787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_012848	TC	3	6	629867	629872	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
163	NC_012848	TC	3	6	632748	632753	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
164	NC_012848	CG	3	6	632783	632788	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
165	NC_012848	GA	3	6	644979	644984	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
166	NC_012848	AG	4	8	645007	645014	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
167	NC_012848	AG	3	6	645040	645045	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
168	NC_012848	GA	3	6	647147	647152	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
169	NC_012848	CA	3	6	657381	657386	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
170	NC_012848	CG	3	6	664591	664596	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
171	NC_012848	CG	5	10	666623	666632	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
172	NC_012848	CG	3	6	672499	672504	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
173	NC_012848	TA	3	6	676462	676467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_012848	CG	3	6	676526	676531	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
175	NC_012848	CT	3	6	677275	677280	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
176	NC_012848	CG	4	8	678257	678264	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
177	NC_012848	GC	4	8	682561	682568	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
178	NC_012848	TG	3	6	687938	687943	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
179	NC_012848	TG	3	6	689300	689305	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
180	NC_012848	AC	3	6	696686	696691	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
181	NC_012848	CG	3	6	705410	705415	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
182	NC_012848	CG	3	6	706661	706666	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
183	NC_012848	CG	3	6	706768	706773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
184	NC_012848	AG	3	6	715270	715275	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
185	NC_012848	TC	4	8	726471	726478	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
186	NC_012848	TA	3	6	730113	730118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_012848	GC	3	6	730346	730351	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
188	NC_012848	GC	3	6	730469	730474	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
189	NC_012848	AG	3	6	730553	730558	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
190	NC_012848	GT	3	6	737846	737851	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
191	NC_012848	AT	3	6	739324	739329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_012848	GC	3	6	746820	746825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
193	NC_012848	AT	4	8	760734	760741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_012848	GC	3	6	788603	788608	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
195	NC_012848	GA	3	6	795598	795603	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
196	NC_012848	AC	4	8	802812	802819	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
197	NC_012848	TG	3	6	810310	810315	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
198	NC_012848	AG	3	6	812472	812477	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
199	NC_012848	CG	3	6	821189	821194	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
200	NC_012848	GA	3	6	826800	826805	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.