MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132501

Total Repeats: 1998

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012848	TGG	2	6	348186	348191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_012848	CA	3	6	348328	348333	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1003	NC_012848	AGG	2	6	348347	348352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_012848	CGG	2	6	349231	349236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_012848	CGT	2	6	349240	349245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_012848	GACC	2	8	349301	349308	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1007	NC_012848	AGC	2	6	349452	349457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_012848	CAC	2	6	349556	349561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1009	NC_012848	ACG	2	6	349846	349851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_012848	A	6	6	349880	349885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_012848	GAC	2	6	349899	349904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_012848	GA	3	6	349917	349922	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_012848	GCG	2	6	350900	350905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_012848	CCT	2	6	350916	350921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1015	NC_012848	GGA	2	6	351003	351008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_012848	CCT	2	6	351010	351015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1017	NC_012848	CGG	2	6	351041	351046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_012848	CCGT	2	8	351052	351059	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1019	NC_012848	GAC	2	6	351069	351074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_012848	GGC	2	6	351143	351148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_012848	CGG	2	6	351159	351164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_012848	CT	3	6	351165	351170	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1023	NC_012848	GCCG	2	8	351195	351202	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1024	NC_012848	GCA	2	6	351207	351212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_012848	ACGA	2	8	351598	351605	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1026	NC_012848	TTA	2	6	351615	351620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_012848	C	6	6	352630	352635	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1028	NC_012848	CGC	2	6	352688	352693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1029	NC_012848	GTC	2	6	352707	352712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_012848	GCAG	2	8	352740	352747	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1031	NC_012848	CCG	2	6	352770	352775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1032	NC_012848	TCT	2	6	353746	353751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_012848	CTTC	2	8	353766	353773	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1034	NC_012848	GGC	3	9	354070	354078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_012848	CGAT	2	8	354109	354116	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1036	NC_012848	TGC	2	6	356219	356224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_012848	GATG	2	8	356228	356235	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_012848	CCA	2	6	356317	356322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1039	NC_012848	AGCGA	2	10	356334	356343	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1040	NC_012848	CGG	2	6	356395	356400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_012848	AG	3	6	359767	359772	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_012848	CGA	2	6	359849	359854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_012848	CTTG	2	8	359882	359889	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1044	NC_012848	GCT	2	6	359895	359900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_012848	GGA	2	6	359901	359906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_012848	TGG	2	6	359927	359932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_012848	T	7	7	360050	360056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_012848	ACT	2	6	360067	360072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_012848	GCT	2	6	360092	360097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_012848	CGG	2	6	360100	360105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_012848	ACATG	2	10	360109	360118	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1052	NC_012848	CGAGG	2	10	360137	360146	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1053	NC_012848	GAA	2	6	360157	360162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_012848	TGGGG	2	10	360176	360185	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_012848	GCAG	2	8	362805	362812	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1056	NC_012848	TTA	2	6	363853	363858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_012848	ACA	2	6	364040	364045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_012848	GCC	2	6	364050	364055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1059	NC_012848	TGC	2	6	364073	364078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_012848	GGA	2	6	364088	364093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_012848	CGG	2	6	366917	366922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_012848	TCG	2	6	367911	367916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_012848	CGCT	2	8	367930	367937	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1064	NC_012848	TGCCG	2	10	367943	367952	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1065	NC_012848	TCCTC	2	10	372235	372244	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
1066	NC_012848	GCGCC	2	10	372304	372313	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1067	NC_012848	GC	3	6	372381	372386	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1068	NC_012848	TCC	2	6	373707	373712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1069	NC_012848	TCC	2	6	373765	373770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1070	NC_012848	GTG	2	6	373774	373779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_012848	TCC	2	6	373793	373798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1072	NC_012848	GCC	2	6	373971	373976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1073	NC_012848	TCA	2	6	373983	373988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_012848	GC	3	6	374060	374065	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1075	NC_012848	GGA	2	6	374778	374783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_012848	GGA	2	6	376869	376874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_012848	GGA	2	6	377318	377323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_012848	CGT	2	6	378585	378590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_012848	TCC	2	6	379192	379197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1080	NC_012848	TGCCT	2	10	379945	379954	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1081	NC_012848	TGC	2	6	379981	379986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_012848	GGA	2	6	380025	380030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_012848	CCG	2	6	384660	384665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1084	NC_012848	CGT	2	6	384739	384744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_012848	CGC	2	6	384749	384754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1086	NC_012848	TGG	2	6	386163	386168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_012848	CAG	2	6	386169	386174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_012848	CAG	2	6	386198	386203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_012848	AGC	3	9	386275	386283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_012848	CTG	2	6	386289	386294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_012848	T	7	7	386832	386838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_012848	TC	3	6	386843	386848	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1093	NC_012848	TC	3	6	386871	386876	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1094	NC_012848	GTT	2	6	386885	386890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_012848	GC	3	6	387029	387034	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1096	NC_012848	GAG	2	6	387065	387070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_012848	GGA	2	6	390652	390657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_012848	TG	3	6	392323	392328	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_012848	GAA	3	9	393127	393135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_012848	GT	3	6	393215	393220	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_012848	GCACC	2	10	393226	393235	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1102	NC_012848	CAT	2	6	393252	393257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_012848	GGC	2	6	393260	393265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_012848	CGG	2	6	395569	395574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_012848	ACCG	2	8	395651	395658	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1106	NC_012848	TCG	2	6	395663	395668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_012848	A	6	6	398852	398857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_012848	CTT	2	6	398864	398869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_012848	CGG	2	6	398908	398913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_012848	GGA	2	6	399959	399964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_012848	GCCG	2	8	400658	400665	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1112	NC_012848	CGG	2	6	400670	400675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_012848	CGATA	2	10	400709	400718	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1114	NC_012848	GGC	2	6	400734	400739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_012848	GA	3	6	401488	401493	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_012848	CG	3	6	402823	402828	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1117	NC_012848	CA	3	6	403208	403213	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1118	NC_012848	CGT	2	6	405967	405972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_012848	CCT	2	6	406061	406066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1120	NC_012848	GAG	2	6	406072	406077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_012848	CGCAGC	2	12	406096	406107	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1122	NC_012848	AGC	3	9	407821	407829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_012848	CCT	2	6	408872	408877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1124	NC_012848	GAT	2	6	408883	408888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_012848	GAA	2	6	408891	408896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_012848	GCAA	2	8	410794	410801	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1127	NC_012848	GGGAA	2	10	410804	410813	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_012848	CTATG	2	10	410836	410845	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1129	NC_012848	GAT	2	6	410848	410853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_012848	AGC	2	6	410925	410930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_012848	TGT	2	6	410941	410946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_012848	ATC	2	6	411045	411050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_012848	GAT	2	6	411060	411065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_012848	AGC	2	6	415130	415135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_012848	GCG	2	6	415159	415164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_012848	TCG	2	6	415178	415183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1139	NC_012848	GCC	2	6	417706	417711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1259	NC_012848	GCGGG	2	10	471701	471710	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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1261	NC_012848	TCC	2	6	474611	474616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1262	NC_012848	TGCG	2	8	474624	474631	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1263	NC_012848	CT	3	6	474632	474637	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1264	NC_012848	GTCA	2	8	474669	474676	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1265	NC_012848	TA	3	6	474679	474684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1266	NC_012848	CGG	2	6	479974	479979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1267	NC_012848	CTG	2	6	482848	482853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1268	NC_012848	A	7	7	484803	484809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1403	NC_012848	CCG	2	6	550542	550547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1404	NC_012848	ACAAGG	2	12	550552	550563	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1405	NC_012848	GAC	2	6	550569	550574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1406	NC_012848	CGG	2	6	550601	550606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1407	NC_012848	GCCA	2	8	550632	550639	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1408	NC_012848	CGT	2	6	550748	550753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1409	NC_012848	CCA	2	6	550762	550767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1410	NC_012848	ACG	2	6	550774	550779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1411	NC_012848	TTC	2	6	550785	550790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1412	NC_012848	GTG	2	6	550806	550811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1413	NC_012848	CG	3	6	550831	550836	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1414	NC_012848	GAT	2	6	550844	550849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1415	NC_012848	CGG	2	6	550903	550908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1416	NC_012848	ACA	2	6	550993	550998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1417	NC_012848	GCG	2	6	551086	551091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1418	NC_012848	TCG	2	6	551307	551312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1420	NC_012848	GAG	2	6	551385	551390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1421	NC_012848	CCGA	2	8	551403	551410	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1422	NC_012848	CGAAG	2	10	551504	551513	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1423	NC_012848	GCG	2	6	552936	552941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1424	NC_012848	GC	3	6	552994	552999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1425	NC_012848	ATC	2	6	553032	553037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1426	NC_012848	AAGG	2	8	553063	553070	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1427	NC_012848	CGA	2	6	553111	553116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1428	NC_012848	AGC	2	6	554063	554068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1429	NC_012848	GCC	2	6	554119	554124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1430	NC_012848	GGA	2	6	554130	554135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1431	NC_012848	GAAT	2	8	555090	555097	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1432	NC_012848	TCC	2	6	555148	555153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1433	NC_012848	GC	3	6	556311	556316	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1434	NC_012848	CATGG	2	10	556396	556405	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1435	NC_012848	TGC	2	6	556419	556424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1436	NC_012848	GGC	2	6	556448	556453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1437	NC_012848	AT	3	6	556517	556522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1438	NC_012848	GC	3	6	556547	556552	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1439	NC_012848	GAG	2	6	556586	556591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1440	NC_012848	ATC	2	6	556611	556616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1441	NC_012848	GCC	2	6	556632	556637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1442	NC_012848	GAG	2	6	556664	556669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1443	NC_012848	GAG	3	9	557757	557765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1444	NC_012848	TGA	2	6	568103	568108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1447	NC_012848	GGC	2	6	568257	568262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1448	NC_012848	CGCGC	2	10	568358	568367	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1449	NC_012848	GC	3	6	569404	569409	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1450	NC_012848	CAA	2	6	569417	569422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1451	NC_012848	ATG	2	6	569436	569441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1453	NC_012848	CG	3	6	569551	569556	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1454	NC_012848	AGG	2	6	569572	569577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1455	NC_012848	TTG	2	6	569578	569583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1456	NC_012848	CTG	2	6	569593	569598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1457	NC_012848	GCC	2	6	569607	569612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1461	NC_012848	GC	3	6	570883	570888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1475	NC_012848	CCTGA	2	10	573993	574002	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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1487	NC_012848	TC	3	6	583935	583940	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1498	NC_012848	GGC	2	6	586259	586264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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