MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Rickettsia peacockii str. Rustic

Total Repeats: 416

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012730	AATTA	2	10	9406	9415	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012730	TACCC	2	10	12142	12151	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
3	NC_012730	TACCG	2	10	13503	13512	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_012730	TATAA	2	10	13857	13866	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012730	TTTGA	2	10	16038	16047	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012730	TTTTC	2	10	16817	16826	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_012730	TTATT	2	10	20033	20042	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012730	TTATT	2	10	22121	22130	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012730	AATCA	2	10	22831	22840	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_012730	AATTA	2	10	31993	32002	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012730	TATTT	2	10	41167	41176	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012730	GAAAT	2	10	42151	42160	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012730	ATTTT	2	10	42204	42213	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012730	TTAAA	2	10	46266	46275	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012730	ACATA	2	10	46324	46333	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_012730	ATTAA	2	10	56595	56604	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012730	AAACT	2	10	58427	58436	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_012730	AATTA	2	10	58859	58868	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012730	TTTAA	2	10	60096	60105	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012730	ATTTA	2	10	60386	60395	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012730	TTGAC	2	10	67064	67073	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_012730	GTCTT	2	10	69212	69221	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_012730	CCCAT	2	10	69389	69398	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
24	NC_012730	CTATT	2	10	71542	71551	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_012730	ATTTT	2	10	72269	72278	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012730	ACAAA	2	10	72443	72452	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_012730	GAATT	2	10	77716	77725	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012730	AACTG	2	10	78627	78636	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_012730	TTACT	2	10	80716	80725	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_012730	TTAAT	2	10	80736	80745	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012730	TTATA	2	10	92464	92473	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012730	AATTA	2	10	93229	93238	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012730	TACAA	2	10	94437	94446	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_012730	GCTTG	2	10	97575	97584	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_012730	TAAAT	2	10	101416	101425	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012730	AAAAT	2	10	101658	101667	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012730	ATATA	2	10	101953	101962	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012730	GCTCC	2	10	102874	102883	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
39	NC_012730	TTTAT	2	10	104700	104709	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012730	ATTAT	2	10	105145	105154	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012730	TAAAA	2	10	111359	111368	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012730	CCAAA	2	10	113956	113965	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
43	NC_012730	CCTGT	2	10	114110	114119	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
44	NC_012730	ATCTT	2	10	114284	114293	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_012730	TATAA	2	10	115346	115355	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012730	GTATA	2	10	126719	126728	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012730	GACTA	2	10	134004	134013	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_012730	TTAAT	2	10	134220	134229	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012730	TAATA	2	10	134329	134338	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012730	CAATT	2	10	145922	145931	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_012730	TCATT	2	10	147816	147825	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_012730	TTGCT	2	10	148414	148423	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_012730	ATTTT	2	10	149214	149223	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012730	GGTAA	2	10	150505	150514	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012730	AGAAT	2	10	151720	151729	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012730	GAATT	2	10	152087	152096	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012730	CGCTC	2	10	153510	153519	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
58	NC_012730	ATTAC	2	10	166318	166327	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_012730	ATTTT	2	10	166448	166457	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012730	ATGCT	2	10	166589	166598	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_012730	TATAA	2	10	168296	168305	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012730	ATATT	2	10	169878	169887	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012730	ATATT	2	10	169916	169925	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012730	AAATA	2	10	170363	170372	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012730	ATGTT	2	10	171074	171083	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012730	TGCTA	2	10	174722	174731	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_012730	AAGTG	2	10	177270	177279	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012730	ATTTT	2	10	177282	177291	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012730	TTAAT	2	10	178982	178991	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012730	TGAGT	2	10	179009	179018	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012730	TTAGT	2	10	182538	182547	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012730	CTTTT	2	10	184608	184617	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_012730	TTATT	2	10	185011	185020	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012730	TTTTA	2	10	185115	185124	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012730	TAAGT	2	10	188368	188377	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012730	AGAAA	2	10	191352	191361	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012730	AATTT	2	10	191367	191376	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012730	TAAAT	2	10	192918	192927	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012730	AAAAT	2	10	195934	195943	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012730	TAAAA	2	10	196990	196999	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012730	TAATT	2	10	197585	197594	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012730	AAAAT	2	10	201356	201365	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012730	CCGAA	2	10	212371	212380	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
84	NC_012730	TACAT	2	10	212384	212393	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_012730	TTCTT	2	10	221456	221465	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_012730	TCACT	2	10	221734	221743	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
87	NC_012730	TTTTA	2	10	230154	230163	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012730	CATAA	2	10	230365	230374	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_012730	TAATT	2	10	231758	231767	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012730	ACTAT	2	10	232439	232448	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_012730	TTTAT	2	10	234346	234355	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012730	ATTTT	2	10	248017	248026	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012730	TAAAG	2	10	248648	248657	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012730	AGAAA	2	10	251346	251355	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012730	AAGTA	2	10	251711	251720	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012730	TCAAT	2	10	251970	251979	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_012730	CAACA	2	10	252302	252311	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
98	NC_012730	AAGTA	2	10	252391	252400	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012730	ATAAA	2	10	257610	257619	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012730	TTTAA	2	10	259614	259623	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012730	TAGAT	2	10	262588	262597	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012730	TTAAC	2	10	262980	262989	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_012730	ATTTT	2	10	264293	264302	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012730	CAAAT	2	10	264319	264328	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_012730	ATTTT	2	10	278073	278082	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012730	AAAAT	2	10	278122	278131	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012730	ATATC	2	10	283030	283039	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_012730	AATTA	2	10	293566	293575	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012730	TATCT	2	10	295567	295576	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_012730	ATTTG	2	10	295706	295715	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012730	ATATT	2	10	296764	296773	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012730	AAATA	2	10	299074	299083	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012730	AAATG	2	10	299134	299143	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012730	TTGCA	2	10	301501	301510	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_012730	GGGAT	2	10	301586	301595	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012730	CTTCG	2	10	302648	302657	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
117	NC_012730	TAATT	2	10	307865	307874	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012730	TAAAA	2	10	308482	308491	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012730	CCAAT	2	10	308676	308685	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
120	NC_012730	ATTTT	2	10	314338	314347	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012730	GTTTT	2	10	315140	315149	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012730	TTGTC	2	10	327771	327780	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_012730	AATAA	2	10	328266	328275	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012730	TTAGC	2	10	332333	332342	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_012730	CCATG	2	10	332680	332689	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
126	NC_012730	ATCAA	2	10	335137	335146	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_012730	TAAAT	2	10	337187	337196	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012730	AATAG	2	10	349493	349502	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012730	TATAA	2	10	349902	349911	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012730	TTTAT	2	10	356052	356061	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012730	TAAAA	2	10	366780	366789	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012730	ATATT	2	10	375540	375549	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012730	AGGAA	2	10	375625	375634	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012730	AATGA	2	10	375841	375850	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012730	ATAAA	2	10	376905	376914	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012730	CAACA	2	10	383356	383365	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
137	NC_012730	TTACT	2	10	384483	384492	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_012730	TCTGC	2	10	384808	384817	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
139	NC_012730	TTGGT	2	10	385808	385817	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012730	ATTAA	2	10	386576	386585	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012730	TGATA	2	10	387147	387156	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012730	ATTAT	2	10	398064	398073	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012730	TAAAT	2	10	409689	409698	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012730	GATTA	2	10	414055	414064	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_012730	ATACA	2	10	423895	423904	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_012730	TAAAT	2	10	427684	427693	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012730	TATAA	2	10	437543	437552	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_012730	TTGTA	2	10	437681	437690	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_012730	AATTA	2	10	438989	438998	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_012730	CCAAA	2	10	446419	446428	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
151	NC_012730	TTTAT	2	10	446812	446821	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_012730	TAATA	2	10	447726	447735	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_012730	TAAAA	2	10	462866	462875	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_012730	GCAAG	2	10	465729	465738	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
155	NC_012730	TTAAA	2	10	467667	467676	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_012730	TTGCT	2	10	471359	471368	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
157	NC_012730	CGCTC	2	10	471966	471975	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
158	NC_012730	TTGAT	2	10	491888	491897	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
159	NC_012730	AAAGA	2	10	494959	494968	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
160	NC_012730	TAATT	2	10	495008	495017	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_012730	GCTTC	2	10	498202	498211	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
162	NC_012730	TATTT	2	10	498281	498290	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_012730	GATTT	2	10	498673	498682	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
164	NC_012730	TTATT	2	10	501116	501125	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_012730	AGTCA	2	10	503888	503897	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
166	NC_012730	AAATT	2	10	504241	504250	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_012730	CAAGA	2	10	508699	508708	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
168	NC_012730	ATTTT	2	10	511988	511997	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_012730	TTAGT	2	10	515412	515421	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
170	NC_012730	AATTA	2	10	529400	529409	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_012730	TATAT	2	10	530585	530594	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_012730	TCTTA	2	10	543264	543273	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
173	NC_012730	TAAAT	2	10	544794	544803	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_012730	GGTCA	2	10	548041	548050	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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177	NC_012730	CCATA	2	10	564837	564846	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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182	NC_012730	AAACT	2	10	569429	569438	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
183	NC_012730	TATAA	2	10	575644	575653	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_012730	ATTAT	2	10	575661	575670	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_012730	TGTAT	2	10	578516	578525	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
186	NC_012730	CTAAA	2	10	579140	579149	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
187	NC_012730	GCCAA	2	10	579180	579189	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
188	NC_012730	TCGCT	2	10	585404	585413	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
189	NC_012730	AAATT	2	10	593430	593439	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_012730	CCAAA	2	10	595147	595156	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
192	NC_012730	TGAGC	2	10	595840	595849	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
193	NC_012730	TTATT	2	10	596130	596139	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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198	NC_012730	GTACT	2	10	613584	613593	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
199	NC_012730	TTACT	2	10	615684	615693	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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226	NC_012730	ATTGT	2	10	714392	714401	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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274	NC_012730	CGGTA	2	10	890793	890802	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
275	NC_012730	TAGCC	2	10	891338	891347	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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289	NC_012730	AATTA	2	10	912702	912711	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_012730	TGGTA	2	10	915811	915820	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.