MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rickettsia africae ESF-5 chromosome

Total Repeats: 1100

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012633	TTTA	2	8	866	873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012633	ATTT	2	8	1359	1366	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012633	TAAA	2	8	6603	6610	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012633	TTAA	2	8	9509	9516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012633	TAAA	2	8	11225	11232	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012633	TTAG	2	8	11887	11894	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012633	GCAA	2	8	11986	11993	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_012633	TCTT	2	8	12063	12070	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_012633	ATCA	2	8	15759	15766	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_012633	AAGA	2	8	15842	15849	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012633	AGTA	2	8	15889	15896	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012633	ATTA	2	8	15914	15921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012633	AATA	2	8	15958	15965	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012633	CTTT	2	8	16003	16010	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_012633	TGAA	2	8	16151	16158	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012633	TAAA	2	8	16194	16201	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012633	AGAT	2	8	16382	16389	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012633	AGTA	2	8	16961	16968	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012633	AAAC	2	8	17011	17018	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_012633	TAAA	2	8	17086	17093	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012633	TTAT	2	8	17284	17291	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012633	ACTA	2	8	22995	23002	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_012633	TTAT	2	8	23709	23716	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012633	AGCA	2	8	23784	23791	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_012633	AAGT	2	8	24237	24244	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012633	ATTA	2	8	24888	24895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012633	TCTT	2	8	25471	25478	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_012633	TAAA	2	8	25736	25743	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012633	GATA	2	8	25824	25831	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012633	TAAA	2	8	26067	26074	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012633	GCTA	2	8	26077	26084	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_012633	TAAT	2	8	27324	27331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012633	TGTT	2	8	33578	33585	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012633	AATG	2	8	35045	35052	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012633	GCTT	2	8	35833	35840	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_012633	ATAA	2	8	36059	36066	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012633	AACA	2	8	36156	36163	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_012633	CTGA	2	8	38126	38133	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_012633	ATTG	2	8	38296	38303	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012633	TAAA	2	8	38453	38460	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012633	ATTT	2	8	38560	38567	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012633	ATTA	2	8	38784	38791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012633	TGCT	2	8	38907	38914	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_012633	ATTA	2	8	39445	39452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012633	TAAT	2	8	39740	39747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012633	TAAT	2	8	39800	39807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012633	ATTA	2	8	39810	39817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012633	ACAA	2	8	40427	40434	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_012633	TACC	2	8	41985	41992	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_012633	AAAC	2	8	41993	42000	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_012633	ATGA	2	8	42268	42275	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012633	TAAC	2	8	42458	42465	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_012633	ATTC	2	8	42889	42896	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_012633	ATGT	2	8	43238	43245	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012633	ATTT	2	8	43396	43403	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012633	TTAC	2	8	43475	43482	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_012633	ATAC	2	8	46384	46391	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_012633	TTGC	2	8	46529	46536	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_012633	TGTT	2	8	46900	46907	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012633	AAGT	2	8	46937	46944	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012633	ATCT	2	8	47991	47998	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_012633	TTTA	2	8	48578	48585	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012633	TCAC	2	8	48687	48694	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_012633	TAAA	2	8	48727	48734	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012633	ATTA	2	8	49842	49849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012633	TAAA	2	8	53230	53237	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012633	ATCT	2	8	54435	54442	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_012633	GTTA	2	8	56181	56188	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012633	TAAA	2	8	59567	59574	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012633	ATTT	2	8	59588	59595	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012633	ATTT	2	8	61590	61597	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012633	TTAA	2	8	63252	63259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012633	TAGT	2	8	63743	63750	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012633	ATAA	2	8	65815	65822	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012633	GTAA	2	8	65863	65870	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012633	CAAT	2	8	71369	71376	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_012633	CAAT	2	8	72667	72674	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_012633	TAGA	2	8	73589	73596	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012633	TAAA	2	8	73610	73617	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012633	TTTA	2	8	73655	73662	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012633	ATTT	2	8	75259	75266	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012633	AAAT	2	8	81213	81220	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012633	AATT	2	8	83360	83367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012633	TTTG	2	8	84420	84427	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012633	AGGT	2	8	85843	85850	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012633	TAAA	2	8	90569	90576	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012633	TTTA	2	8	93137	93144	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012633	AATT	2	8	93382	93389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012633	TAAA	2	8	94738	94745	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012633	ACCA	2	8	94788	94795	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_012633	ATTA	2	8	94964	94971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012633	AAGC	2	8	98023	98030	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_012633	ATGT	2	8	100078	100085	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012633	ATCA	2	8	103371	103378	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_012633	AGAA	2	8	103633	103640	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012633	ATGC	2	8	103647	103654	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_012633	AAAG	2	8	104852	104859	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012633	TTTA	2	8	105044	105051	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012633	ATTA	2	8	111143	111150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012633	GAAA	2	8	111267	111274	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012633	ACTC	2	8	115209	115216	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_012633	CAAA	2	8	115231	115238	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_012633	CTAT	2	8	115301	115308	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_012633	AAGT	2	8	118566	118573	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012633	TTCT	2	8	120282	120289	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_012633	TTAA	2	8	120291	120298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012633	CTAC	2	8	120385	120392	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_012633	AGTA	2	8	120494	120501	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012633	CGCT	2	8	123095	123102	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_012633	TCAC	2	8	123124	123131	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_012633	AAAG	2	8	123690	123697	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012633	ATAA	2	8	123702	123709	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012633	ATCA	2	8	123726	123733	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_012633	GCCG	2	8	123874	123881	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_012633	ACGT	2	8	126210	126217	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_012633	ATTC	2	8	127592	127599	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_012633	TAAT	2	8	127613	127620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012633	TTTA	2	8	127787	127794	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012633	GAAA	2	8	129158	129165	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012633	TAAT	2	8	129433	129440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012633	TTTG	2	8	130281	130288	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012633	AAAT	2	8	132752	132759	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012633	CTGT	2	8	135207	135214	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_012633	TAGC	2	8	138484	138491	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_012633	TTAA	2	8	138951	138958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012633	GATT	2	8	139431	139438	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012633	TATT	2	8	139772	139779	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012633	GTAT	2	8	139831	139838	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012633	TATG	2	8	139893	139900	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012633	AAAG	2	8	140265	140272	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012633	TCGC	2	8	146271	146278	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_012633	AAAC	2	8	149833	149840	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_012633	GAAG	2	8	149977	149984	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012633	TGAT	2	8	150028	150035	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012633	ATTA	2	8	150298	150305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012633	TAAT	2	8	150673	150680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012633	TAGA	2	8	151070	151077	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012633	ATTT	2	8	151356	151363	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012633	ATAA	2	8	151544	151551	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012633	ATTT	2	8	152287	152294	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012633	AAAG	2	8	152686	152693	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012633	GGTG	2	8	153057	153064	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012633	ATAA	2	8	153067	153074	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012633	TTTA	2	8	165828	165835	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_012633	TTTA	2	8	168393	168400	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_012633	TCAT	2	8	171249	171256	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_012633	ATTA	2	8	176444	176451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_012633	TTAA	2	8	178603	178610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_012633	TCAA	2	8	179178	179185	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_012633	TAAA	2	8	179307	179314	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_012633	ATAA	2	8	179757	179764	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_012633	TCAG	2	8	179982	179989	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
153	NC_012633	AGTA	2	8	190100	190107	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
154	NC_012633	TTAC	2	8	191848	191855	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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