MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia africae ESF-5 chromosome

Total Repeats: 9524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_012633	TAAT	2	8	450556	450563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_012633	GAG	2	6	451063	451068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_012633	TTG	2	6	451069	451074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_012633	CAA	2	6	451246	451251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_012633	CCT	2	6	451268	451273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3006	NC_012633	TAG	2	6	451296	451301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_012633	AGA	2	6	451490	451495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_012633	AGA	2	6	451514	451519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_012633	ATT	2	6	451550	451555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_012633	AT	3	6	451598	451603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_012633	ATAA	2	8	451632	451639	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_012633	T	6	6	452577	452582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_012633	GAAT	2	8	452651	452658	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_012633	TA	4	8	452677	452684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_012633	AAT	2	6	456150	456155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_012633	AT	3	6	456448	456453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_012633	AT	3	6	456455	456460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_012633	TAGT	2	8	456472	456479	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_012633	TTA	2	6	456481	456486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_012633	AGA	2	6	456494	456499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_012633	A	6	6	456576	456581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_012633	CAT	2	6	456627	456632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_012633	TAAC	2	8	456709	456716	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3024	NC_012633	A	6	6	456730	456735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_012633	TCC	2	6	456736	456741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3026	NC_012633	TA	4	8	456757	456764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_012633	ATT	2	6	456793	456798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_012633	AT	3	6	456861	456866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_012633	TGC	2	6	456876	456881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_012633	TAAAT	2	10	456920	456929	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_012633	AAT	2	6	456948	456953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_012633	AGA	2	6	456959	456964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_012633	ATT	2	6	456988	456993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_012633	GAA	3	9	456997	457005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_012633	ATT	2	6	457064	457069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_012633	TAG	2	6	459929	459934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_012633	TGT	3	9	459968	459976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_012633	ATT	2	6	461564	461569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_012633	TA	3	6	462775	462780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_012633	AGT	2	6	462797	462802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_012633	TA	3	6	462807	462812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_012633	TAA	2	6	462820	462825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_012633	ATT	2	6	462872	462877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_012633	CAT	2	6	462895	462900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3045	NC_012633	T	7	7	463045	463051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_012633	CTG	2	6	463059	463064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_012633	CAT	2	6	463084	463089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_012633	TTAA	2	8	463110	463117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_012633	AGT	2	6	463140	463145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_012633	GT	3	6	463144	463149	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_012633	T	6	6	463153	463158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_012633	TAA	2	6	463163	463168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_012633	TTA	2	6	463173	463178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_012633	TGAT	3	12	463186	463197	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_012633	TTA	2	6	463210	463215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_012633	ATT	2	6	463266	463271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_012633	GGTA	2	8	463289	463296	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_012633	A	6	6	463353	463358	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_012633	AGA	2	6	463384	463389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_012633	TTCT	2	8	463436	463443	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3061	NC_012633	TAG	2	6	463493	463498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_012633	T	6	6	463512	463517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_012633	AGA	2	6	463524	463529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_012633	ATT	2	6	463585	463590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_012633	TCAAG	2	10	463627	463636	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3066	NC_012633	AGT	2	6	463642	463647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_012633	TC	3	6	463667	463672	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3068	NC_012633	T	6	6	463675	463680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_012633	TAGTA	2	10	463728	463737	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_012633	T	6	6	463747	463752	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_012633	ACA	2	6	463766	463771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3072	NC_012633	T	8	8	463772	463779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_012633	T	6	6	463788	463793	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_012633	AT	3	6	463871	463876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_012633	CTT	2	6	463917	463922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3076	NC_012633	ATATA	2	10	463945	463954	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_012633	ATA	2	6	463994	463999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_012633	TGCAA	2	10	464027	464036	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3079	NC_012633	T	6	6	464049	464054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_012633	TAT	2	6	464097	464102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_012633	TAAA	2	8	464112	464119	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_012633	TTA	2	6	464120	464125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_012633	TTC	2	6	464170	464175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3084	NC_012633	T	6	6	464196	464201	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_012633	TTA	2	6	464262	464267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_012633	T	6	6	464270	464275	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_012633	CAT	2	6	464376	464381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3088	NC_012633	TAA	2	6	464394	464399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_012633	ACT	2	6	464401	464406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3090	NC_012633	TATG	2	8	464410	464417	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_012633	T	6	6	464461	464466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_012633	ATA	2	6	464580	464585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_012633	CTA	2	6	464594	464599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3094	NC_012633	TAAA	2	8	464616	464623	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_012633	AAT	2	6	464633	464638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_012633	TGA	2	6	464651	464656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_012633	GTA	2	6	464662	464667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_012633	TTA	2	6	464735	464740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_012633	TCA	2	6	464746	464751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_012633	TGT	2	6	464784	464789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_012633	ATT	2	6	464821	464826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_012633	AGC	2	6	464865	464870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3103	NC_012633	TAT	2	6	464871	464876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_012633	TTA	2	6	464879	464884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_012633	GTT	2	6	464913	464918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_012633	GT	3	6	464919	464924	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_012633	AAC	2	6	464975	464980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3108	NC_012633	GCA	2	6	464997	465002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3109	NC_012633	ATA	2	6	465046	465051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_012633	A	7	7	465051	465057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_012633	T	6	6	465107	465112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_012633	ATCT	2	8	465141	465148	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3113	NC_012633	TAA	2	6	465150	465155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_012633	TAT	2	6	465182	465187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_012633	A	6	6	465197	465202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_012633	TGTAGG	2	12	465203	465214	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_012633	GAA	2	6	465215	465220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_012633	TAAA	2	8	465235	465242	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_012633	ATA	2	6	465882	465887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_012633	TTA	2	6	465896	465901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_012633	TAT	2	6	465904	465909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_012633	A	7	7	465919	465925	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_012633	TA	3	6	465926	465931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_012633	A	6	6	465990	465995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_012633	GAA	2	6	466974	466979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_012633	T	6	6	467011	467016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_012633	AT	4	8	467084	467091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_012633	AC	3	6	467126	467131	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3129	NC_012633	ACT	2	6	467148	467153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3130	NC_012633	CT	3	6	467243	467248	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3131	NC_012633	TTTC	2	8	467267	467274	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3132	NC_012633	TGC	2	6	467276	467281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3133	NC_012633	TTTA	2	8	467974	467981	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_012633	ACT	2	6	467983	467988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3135	NC_012633	ATTT	2	8	468011	468018	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3136	NC_012633	ATT	2	6	468044	468049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3138	NC_012633	ATA	2	6	468100	468105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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