MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia africae ESF-5 chromosome

Total Repeats: 9524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_012633	TGT	2	6	371459	371464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_012633	ATTTAT	2	12	371467	371478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_012633	CTT	2	6	371479	371484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2504	NC_012633	TTC	2	6	371489	371494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2505	NC_012633	T	6	6	371544	371549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_012633	TAA	2	6	371592	371597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_012633	ATT	2	6	371634	371639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_012633	GTA	2	6	371734	371739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_012633	T	6	6	371749	371754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_012633	TAT	2	6	371781	371786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_012633	GTTA	2	8	371825	371832	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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2513	NC_012633	TTG	2	6	371951	371956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2514	NC_012633	CATT	2	8	371991	371998	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2515	NC_012633	CTG	2	6	372172	372177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2517	NC_012633	TCA	2	6	372274	372279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2519	NC_012633	GTT	2	6	372335	372340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_012633	AAG	2	6	372361	372366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_012633	A	6	6	372367	372372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_012633	ATA	2	6	372376	372381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_012633	GAA	2	6	372399	372404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2526	NC_012633	TATC	2	8	372555	372562	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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2531	NC_012633	AAGATA	2	12	372746	372757	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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2533	NC_012633	ACT	2	6	372768	372773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2535	NC_012633	TGA	2	6	372816	372821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2536	NC_012633	TAT	2	6	372828	372833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2539	NC_012633	ATT	3	9	373132	373140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2540	NC_012633	TA	3	6	373145	373150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2542	NC_012633	TAA	2	6	373182	373187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2545	NC_012633	TTG	2	6	373238	373243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2553	NC_012633	GGATA	2	10	373569	373578	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_012633	GAAA	2	8	373594	373601	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_012633	TTA	2	6	373621	373626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2559	NC_012633	TTAT	2	8	373750	373757	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_012633	A	7	7	373799	373805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2561	NC_012633	A	6	6	373823	373828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2562	NC_012633	ATC	2	6	373838	373843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2564	NC_012633	AAG	2	6	373893	373898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2565	NC_012633	GATA	2	8	373964	373971	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_012633	A	9	9	373993	374001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2599	NC_012633	AATA	2	8	376022	376029	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2601	NC_012633	A	8	8	376069	376076	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2602	NC_012633	TCT	2	6	376105	376110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2613	NC_012633	TA	3	6	376841	376846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2621	NC_012633	A	7	7	380464	380470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2622	NC_012633	TCT	2	6	380520	380525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2623	NC_012633	ACA	2	6	380550	380555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2626	NC_012633	TA	3	6	382253	382258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2627	NC_012633	CTT	2	6	382259	382264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2632	NC_012633	ATA	2	6	387780	387785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2633	NC_012633	ATTTA	2	10	387794	387803	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2634	NC_012633	TTG	2	6	387835	387840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2635	NC_012633	ATAA	2	8	387872	387879	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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