MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia africae ESF-5 chromosome

Total Repeats: 9524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_012633	A	6	6	248697	248702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_012633	CTT	2	6	248707	248712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_012633	ATG	2	6	248742	248747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_012633	GCT	2	6	248750	248755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_012633	ATA	2	6	248780	248785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_012633	ATG	2	6	248798	248803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_012633	A	6	6	248828	248833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_012633	CAG	2	6	248894	248899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_012633	A	6	6	248936	248941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_012633	CAT	2	6	248983	248988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_012633	TAT	2	6	249041	249046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_012633	CATGG	2	10	249067	249076	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1513	NC_012633	AGA	2	6	249083	249088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_012633	GAT	2	6	249103	249108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_012633	A	6	6	249123	249128	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_012633	AAT	2	6	249138	249143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_012633	AG	3	6	249231	249236	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_012633	TAA	2	6	249242	249247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_012633	A	6	6	249246	249251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_012633	GCA	2	6	249670	249675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_012633	TTA	2	6	249688	249693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_012633	ATT	2	6	249714	249719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_012633	TAA	2	6	249728	249733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_012633	ATT	2	6	249740	249745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_012633	TTTC	2	8	249751	249758	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1526	NC_012633	TTA	2	6	249778	249783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_012633	A	7	7	249788	249794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_012633	GAG	2	6	251316	251321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_012633	AAC	2	6	251960	251965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_012633	A	6	6	251976	251981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_012633	AAG	2	6	252010	252015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_012633	ATA	2	6	252016	252021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_012633	A	7	7	252021	252027	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_012633	ATT	2	6	252038	252043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_012633	TGA	2	6	252052	252057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_012633	T	7	7	252068	252074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_012633	GTT	2	6	252078	252083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_012633	T	6	6	252089	252094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_012633	T	6	6	252104	252109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_012633	TAA	2	6	252115	252120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_012633	ACA	2	6	252157	252162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_012633	TAA	2	6	252196	252201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_012633	ATT	2	6	252267	252272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_012633	TA	3	6	252280	252285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_012633	AAT	2	6	252293	252298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_012633	ATA	2	6	252330	252335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_012633	AAT	2	6	252336	252341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_012633	G	6	6	252355	252360	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_012633	TA	3	6	252370	252375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_012633	AAT	3	9	252404	252412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_012633	TATT	2	8	252416	252423	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_012633	AT	3	6	253433	253438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_012633	TA	4	8	253452	253459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_012633	ATT	2	6	253472	253477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_012633	T	6	6	253476	253481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_012633	ATT	2	6	253490	253495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_012633	A	7	7	253875	253881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_012633	TTA	2	6	253882	253887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_012633	TATTTT	2	12	253924	253935	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_012633	TGT	2	6	253943	253948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_012633	GACAA	2	10	253983	253992	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1562	NC_012633	TAA	2	6	254014	254019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_012633	CAA	2	6	254202	254207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_012633	TAATTA	2	12	254855	254866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_012633	TAT	2	6	254895	254900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_012633	A	6	6	255816	255821	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_012633	CTACA	2	10	255840	255849	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1568	NC_012633	AAAT	2	8	255873	255880	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_012633	AAT	2	6	255932	255937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_012633	AAT	2	6	255971	255976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_012633	CT	3	6	256004	256009	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1572	NC_012633	TTG	3	9	256010	256018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_012633	TGTT	2	8	256031	256038	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_012633	TTA	2	6	256047	256052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_012633	GTT	2	6	256097	256102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_012633	ACA	2	6	256117	256122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_012633	GCT	2	6	256126	256131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1578	NC_012633	GCA	2	6	256147	256152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_012633	TGT	2	6	256162	256167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_012633	AT	3	6	256198	256203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_012633	TTAT	2	8	256231	256238	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_012633	TAT	2	6	256274	256279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_012633	TC	3	6	256280	256285	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1584	NC_012633	TCG	2	6	256333	256338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_012633	TTC	2	6	256362	256367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_012633	TCT	2	6	256393	256398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_012633	AT	3	6	256409	256414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_012633	AGC	2	6	256430	256435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_012633	CTT	2	6	256491	256496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_012633	T	6	6	256535	256540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_012633	AGA	2	6	256543	256548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_012633	AAT	2	6	256630	256635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_012633	AT	4	8	256661	256668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_012633	TTA	2	6	256747	256752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_012633	TTGT	2	8	256755	256762	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_012633	AAGA	2	8	256811	256818	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_012633	T	6	6	256820	256825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_012633	GTATT	2	10	256835	256844	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_012633	A	6	6	256886	256891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_012633	AGT	2	6	256897	256902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_012633	TA	3	6	256912	256917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_012633	ATTG	2	8	256935	256942	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_012633	ATTA	2	8	256949	256956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_012633	TGTA	2	8	256982	256989	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_012633	GCT	2	6	257032	257037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_012633	T	8	8	257060	257067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_012633	AG	4	8	257088	257095	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_012633	AT	3	6	257155	257160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_012633	ATT	2	6	257209	257214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_012633	TGT	2	6	257222	257227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_012633	TTA	2	6	257229	257234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_012633	T	6	6	257257	257262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_012633	TTC	2	6	257266	257271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1614	NC_012633	GTC	2	6	257293	257298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_012633	TCT	2	6	257336	257341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_012633	CTA	2	6	257346	257351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_012633	TGAA	2	8	257390	257397	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_012633	T	6	6	257476	257481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_012633	AT	3	6	257488	257493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_012633	GTT	2	6	257525	257530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_012633	AAT	2	6	257540	257545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_012633	TTC	2	6	257560	257565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_012633	GTT	2	6	257581	257586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_012633	T	6	6	257609	257614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_012633	TAC	2	6	257635	257640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_012633	CTG	2	6	257663	257668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NC_012633	AAT	2	6	257678	257683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_012633	TCT	3	9	257737	257745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1629	NC_012633	AT	3	6	257788	257793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_012633	AGG	2	6	260123	260128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_012633	ATA	2	6	260140	260145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_012633	TAA	2	6	260164	260169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_012633	GA	3	6	260186	260191	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_012633	GAC	2	6	260355	260360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1635	NC_012633	CAT	2	6	260383	260388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1636	NC_012633	TA	3	6	260391	260396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1637	NC_012633	AAT	2	6	260421	260426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1638	NC_012633	TAA	2	6	260435	260440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1639	NC_012633	TAA	2	6	260490	260495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1640	NC_012633	TCA	2	6	260580	260585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1641	NC_012633	ATA	2	6	260601	260606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1642	NC_012633	TAA	2	6	260628	260633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1643	NC_012633	A	6	6	260635	260640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1644	NC_012633	TAA	2	6	260657	260662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1651	NC_012633	CTG	2	6	260824	260829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1661	NC_012633	AAT	2	6	261287	261292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1758	NC_012633	TA	4	8	268074	268081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1759	NC_012633	T	6	6	270374	270379	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1760	NC_012633	AT	3	6	270401	270406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1761	NC_012633	A	7	7	270415	270421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1762	NC_012633	AGC	2	6	271047	271052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1763	NC_012633	ATA	2	6	271079	271084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1764	NC_012633	AC	3	6	271085	271090	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1765	NC_012633	ATGACG	2	12	271127	271138	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1766	NC_012633	ATA	2	6	273184	273189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1767	NC_012633	A	7	7	273204	273210	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1768	NC_012633	TTA	2	6	273591	273596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1769	NC_012633	TCGC	2	8	273625	273632	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1770	NC_012633	ATG	2	6	273673	273678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1912	NC_012633	TTC	2	6	281655	281660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1914	NC_012633	TAT	2	6	281683	281688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1915	NC_012633	TCC	2	6	281689	281694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1933	NC_012633	ATA	2	6	284178	284183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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