MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia africae ESF-5 chromosome

Total Repeats: 9524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012633	AGC	2	6	150464	150469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_012633	TAT	2	6	150487	150492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_012633	AGT	2	6	150527	150532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_012633	TAA	2	6	150589	150594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_012633	TAA	2	6	150644	150649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_012633	TAAT	2	8	150673	150680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_012633	AGC	2	6	150698	150703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_012633	A	7	7	150704	150710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_012633	GAA	2	6	150725	150730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_012633	TAT	2	6	150746	150751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_012633	CGT	2	6	150826	150831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_012633	ATT	2	6	150880	150885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_012633	TGC	2	6	150891	150896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_012633	AGA	2	6	150918	150923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_012633	AGA	2	6	150972	150977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_012633	TAT	2	6	150998	151003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_012633	TGC	3	9	151047	151055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_012633	TAGA	2	8	151070	151077	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_012633	TGC	2	6	151140	151145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_012633	AT	3	6	151187	151192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_012633	TAG	2	6	151193	151198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_012633	AGC	2	6	151232	151237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_012633	TAT	2	6	151293	151298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_012633	TAT	2	6	151332	151337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_012633	ATTT	2	8	151356	151363	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_012633	AAT	2	6	151403	151408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_012633	T	7	7	151507	151513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_012633	A	6	6	151516	151521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_012633	ATA	2	6	151524	151529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_012633	ATT	2	6	151534	151539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_012633	ATAA	2	8	151544	151551	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_012633	GAT	2	6	151581	151586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_012633	ATT	2	6	151599	151604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_012633	TGG	2	6	151620	151625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_012633	A	6	6	151626	151631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_012633	CAA	2	6	151632	151637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_012633	TAA	2	6	151691	151696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_012633	TTC	2	6	151795	151800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_012633	TCC	2	6	151859	151864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1040	NC_012633	A	6	6	151890	151895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_012633	TAT	2	6	151896	151901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_012633	AGC	2	6	151953	151958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_012633	TAT	2	6	152000	152005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_012633	AGT	3	9	152022	152030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_012633	ATG	2	6	152097	152102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_012633	AGT	2	6	152132	152137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_012633	TA	3	6	152191	152196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_012633	ATTT	2	8	152287	152294	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_012633	CTG	2	6	152329	152334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_012633	ATA	2	6	152380	152385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_012633	GAT	2	6	152432	152437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_012633	A	6	6	152440	152445	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_012633	A	7	7	152448	152454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_012633	TAA	2	6	152463	152468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_012633	ATC	2	6	152522	152527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_012633	TGA	2	6	152538	152543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_012633	T	7	7	152606	152612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_012633	AT	3	6	152616	152621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_012633	AT	3	6	152632	152637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_012633	AGA	2	6	152669	152674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_012633	T	6	6	152675	152680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_012633	AAAG	2	8	152686	152693	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_012633	ATA	2	6	152721	152726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_012633	ATG	2	6	152742	152747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_012633	GAA	2	6	152752	152757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_012633	GCA	3	9	152806	152814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_012633	AGC	2	6	152840	152845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_012633	AAG	2	6	152852	152857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_012633	GCT	2	6	152925	152930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_012633	CAA	2	6	152982	152987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_012633	ACA	2	6	153012	153017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_012633	GCT	3	9	153018	153026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_012633	A	6	6	153027	153032	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_012633	AAAGA	2	10	153034	153043	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_012633	GGTG	2	8	153057	153064	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_012633	ATAA	2	8	153067	153074	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_012633	CTA	2	6	153110	153115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_012633	AT	3	6	154265	154270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_012633	AGC	2	6	154337	154342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_012633	ATA	2	6	154369	154374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_012633	A	6	6	154671	154676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_012633	TA	3	6	154700	154705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_012633	CAA	2	6	154726	154731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_012633	AT	3	6	154733	154738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_012633	ATC	2	6	155673	155678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_012633	TTG	2	6	155693	155698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_012633	GAG	2	6	157117	157122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_012633	GA	3	6	157169	157174	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_012633	ATA	2	6	157196	157201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_012633	AAT	2	6	157268	157273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_012633	TTG	2	6	159806	159811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_012633	ATA	3	9	159861	159869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_012633	AAT	2	6	159888	159893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_012633	TTA	2	6	161666	161671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_012633	AT	4	8	161676	161683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_012633	TA	3	6	163755	163760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_012633	AT	4	8	163766	163773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_012633	ACA	2	6	164931	164936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_012633	TTTA	2	8	165828	165835	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_012633	AAT	2	6	167363	167368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_012633	TAA	2	6	167397	167402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_012633	T	6	6	167423	167428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_012633	ATA	2	6	167479	167484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_012633	GTA	2	6	168268	168273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_012633	A	6	6	168302	168307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_012633	TTTTAA	2	12	168314	168325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_012633	T	6	6	168344	168349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_012633	TTTA	2	8	168393	168400	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_012633	GAG	2	6	168805	168810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_012633	ATA	2	6	168841	168846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_012633	ATA	2	6	168914	168919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_012633	A	6	6	169430	169435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_012633	TCAT	2	8	171249	171256	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1114	NC_012633	T	6	6	171325	171330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_012633	A	9	9	171361	171369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_012633	TA	4	8	171370	171377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_012633	AATTTA	2	12	172071	172082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_012633	TA	4	8	172166	172173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_012633	T	8	8	172176	172183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_012633	T	8	8	172190	172197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_012633	ATT	2	6	172589	172594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_012633	AG	3	6	172599	172604	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_012633	A	6	6	172605	172610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_012633	TGT	2	6	175244	175249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_012633	TAT	2	6	175285	175290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_012633	T	6	6	175296	175301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_012633	AAT	2	6	175302	175307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_012633	TAA	2	6	175320	175325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_012633	T	6	6	175336	175341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_012633	T	6	6	175447	175452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_012633	AAG	2	6	175598	175603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_012633	TAA	2	6	175606	175611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_012633	ATTA	2	8	176444	176451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_012633	TTG	2	6	176486	176491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_012633	CGT	2	6	176502	176507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_012633	AGC	2	6	176515	176520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1137	NC_012633	ATA	2	6	176548	176553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1413	NC_012633	TAA	2	6	229221	229226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1416	NC_012633	ATT	2	6	230516	230521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1417	NC_012633	ATT	2	6	230543	230548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1418	NC_012633	TAT	2	6	230551	230556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1419	NC_012633	A	6	6	230594	230599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1420	NC_012633	AT	3	6	230601	230606	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1421	NC_012633	ATA	2	6	230677	230682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1422	NC_012633	TGA	2	6	230684	230689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1423	NC_012633	A	7	7	230693	230699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1424	NC_012633	ATTAG	2	10	230701	230710	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1425	NC_012633	ATACT	2	10	231172	231181	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1426	NC_012633	TGT	2	6	231190	231195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1427	NC_012633	AAACT	2	10	231204	231213	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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1429	NC_012633	A	6	6	231267	231272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1430	NC_012633	A	6	6	231419	231424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1431	NC_012633	T	8	8	231440	231447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1432	NC_012633	ATT	2	6	231448	231453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1433	NC_012633	T	6	6	231452	231457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1434	NC_012633	TGT	2	6	231487	231492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1436	NC_012633	AT	3	6	231548	231553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1441	NC_012633	TCC	2	6	232068	232073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1449	NC_012633	TTA	2	6	232245	232250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1451	NC_012633	TCT	2	6	232281	232286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1452	NC_012633	ACA	2	6	232369	232374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1454	NC_012633	TACT	2	8	233630	233637	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1462	NC_012633	ATT	2	6	238708	238713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1463	NC_012633	GTT	2	6	238728	238733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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