MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodococcus opacus B4 plasmid pKNR

Total Repeats: 246

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012523	TGC	2	6	3248	3253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_012523	GTC	2	6	3364	3369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_012523	CGT	2	6	3619	3624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_012523	CGT	2	6	3633	3638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_012523	AGT	2	6	3733	3738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012523	GGA	2	6	3768	3773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012523	CCA	2	6	3860	3865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_012523	CGT	2	6	3885	3890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_012523	TCA	2	6	3967	3972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_012523	GCG	2	6	3977	3982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_012523	CGC	2	6	4040	4045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_012523	CAT	2	6	6048	6053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_012523	CAC	3	9	8110	8118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_012523	GGC	2	6	8709	8714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_012523	GTT	2	6	8754	8759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012523	GCC	2	6	10847	10852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_012523	CCT	2	6	10880	10885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_012523	CTG	2	6	11014	11019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_012523	GCA	2	6	11105	11110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_012523	GAA	2	6	11173	11178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012523	CAT	2	6	11718	11723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_012523	TTG	2	6	11753	11758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012523	GCT	2	6	11770	11775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_012523	TGC	2	6	11922	11927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_012523	CAC	2	6	12048	12053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_012523	TGC	2	6	12228	12233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_012523	TGA	2	6	12254	12259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012523	CGC	2	6	12322	12327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_012523	GGC	2	6	12492	12497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_012523	CGT	2	6	12505	12510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_012523	CGT	2	6	12634	12639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_012523	CGG	2	6	12727	12732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_012523	CCT	2	6	12792	12797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_012523	GTT	2	6	12813	12818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012523	AGT	2	6	12903	12908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012523	TCG	2	6	12936	12941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_012523	AAC	2	6	18188	18193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_012523	TGA	3	9	28908	28916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012523	CAC	2	6	32411	32416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_012523	AAC	2	6	32417	32422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_012523	CAC	2	6	37540	37545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_012523	CCG	2	6	37631	37636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_012523	CGT	2	6	37666	37671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_012523	AAG	2	6	37686	37691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012523	CGC	2	6	37900	37905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_012523	CGC	2	6	38053	38058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_012523	AGA	2	6	38584	38589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012523	CCG	2	6	38592	38597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_012523	CAA	2	6	39337	39342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_012523	CAC	2	6	39398	39403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_012523	TGC	2	6	41914	41919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_012523	TCG	2	6	41946	41951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_012523	GGT	2	6	41973	41978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012523	CGT	2	6	42012	42017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_012523	GAC	3	9	42025	42033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_012523	GAC	2	6	42049	42054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_012523	GTG	2	6	42085	42090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012523	GTG	2	6	42100	42105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012523	GTG	2	6	42109	42114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012523	TCG	2	6	42124	42129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_012523	GGT	3	9	42139	42147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012523	CCG	2	6	44490	44495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_012523	CGG	2	6	44509	44514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_012523	GGT	2	6	45927	45932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012523	CGT	2	6	45976	45981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_012523	TGC	2	6	46006	46011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_012523	CCG	2	6	46768	46773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_012523	GGA	2	6	46829	46834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012523	GCC	2	6	46856	46861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_012523	CGG	2	6	46871	46876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_012523	CCG	2	6	46891	46896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_012523	AAC	3	9	46921	46929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_012523	GCC	2	6	47012	47017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_012523	GGT	2	6	47053	47058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012523	GCC	2	6	47069	47074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_012523	TGT	2	6	47112	47117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012523	GCG	2	6	47226	47231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_012523	CGG	2	6	47260	47265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_012523	GCG	2	6	47292	47297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_012523	GGC	2	6	48246	48251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_012523	ACC	2	6	48289	48294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_012523	GTG	2	6	48321	48326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012523	CTG	2	6	48382	48387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_012523	CCT	2	6	48434	48439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_012523	CGG	2	6	48476	48481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_012523	CGA	2	6	48522	48527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_012523	GAG	2	6	48608	48613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012523	AGC	2	6	48696	48701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_012523	CCT	2	6	48787	48792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_012523	GTT	2	6	48802	48807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012523	CGC	2	6	48928	48933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_012523	GGC	2	6	48972	48977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_012523	ACG	2	6	50282	50287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_012523	TCC	2	6	50289	50294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_012523	TTC	2	6	50326	50331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_012523	GCT	2	6	50338	50343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_012523	CGG	2	6	50358	50363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_012523	CAG	2	6	59125	59130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_012523	TGG	2	6	59163	59168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012523	TCC	2	6	59881	59886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_012523	GAT	2	6	59890	59895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012523	GTT	2	6	60034	60039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012523	CCT	2	6	60440	60445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_012523	GAC	2	6	60468	60473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_012523	GCC	2	6	60501	60506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_012523	TTC	2	6	60514	60519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_012523	GCA	2	6	60604	60609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_012523	AGC	2	6	60617	60622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_012523	CTG	2	6	60784	60789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_012523	ATC	2	6	60799	60804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_012523	GCC	2	6	60812	60817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_012523	AGT	2	6	61723	61728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012523	CTG	2	6	61743	61748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_012523	GTG	2	6	62531	62536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012523	TCC	2	6	63095	63100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_012523	TTC	2	6	63191	63196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_012523	CCA	2	6	63213	63218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_012523	ACG	2	6	63276	63281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_012523	GAA	2	6	63305	63310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012523	TCG	2	6	63448	63453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_012523	TCC	2	6	63484	63489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_012523	TGC	2	6	63922	63927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_012523	CGG	2	6	63945	63950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_012523	CGG	2	6	63953	63958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_012523	TGG	2	6	64473	64478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012523	TCG	2	6	64970	64975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_012523	ACC	2	6	64983	64988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_012523	GCG	2	6	64990	64995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_012523	GGA	2	6	65095	65100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012523	GCC	2	6	65121	65126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_012523	CGG	2	6	65133	65138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_012523	CCG	2	6	65153	65158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_012523	AAC	2	6	65183	65188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_012523	GGA	2	6	65233	65238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012523	GCC	2	6	65255	65260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_012523	GAC	2	6	65286	65291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_012523	TCG	2	6	65298	65303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_012523	CGG	2	6	65324	65329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_012523	GAC	2	6	66642	66647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_012523	GTG	2	6	66679	66684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.