MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodococcus erythropolis PR4 DNA

Total Repeats: 139

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012490	CGGCTT	2	12	2788	2799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_012490	GCTGCC	2	12	20467	20478	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3	NC_012490	ATTCGA	2	12	43001	43012	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_012490	TGCGAG	2	12	52743	52754	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_012490	CGTATT	2	12	53323	53334	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_012490	ACGTCA	2	12	140657	140668	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_012490	TCAAGT	2	12	171351	171362	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_012490	GACGCC	2	12	193627	193638	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
9	NC_012490	CGATCC	2	12	323915	323926	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10	NC_012490	GTGAAT	2	12	350679	350690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012490	CCGCCA	2	12	371459	371470	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_012490	ATCGTA	2	12	504211	504222	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_012490	TGTGCA	2	12	542736	542747	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_012490	CGGTGC	2	12	557303	557314	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_012490	TTCGTT	2	12	573822	573833	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_012490	AGTGCA	2	12	576615	576626	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_012490	CCGGCA	2	12	576687	576698	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
18	NC_012490	AGTGCA	2	12	594650	594661	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_012490	CCGGCA	2	12	594722	594733	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
20	NC_012490	TGTGAT	2	12	617959	617970	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012490	GCACTG	2	12	664018	664029	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_012490	CCTATC	2	12	689900	689911	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_012490	CGGTGG	2	12	733735	733746	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_012490	ACCGTT	2	12	782713	782724	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_012490	CGTCTG	2	12	865188	865199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_012490	GTCGAC	2	12	872014	872025	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_012490	GATTAT	2	12	1006934	1006945	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012490	CAGCGC	2	12	1096426	1096437	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
29	NC_012490	TGTGCA	2	12	1176944	1176955	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_012490	TTCCGT	2	12	1268618	1268629	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_012490	AAGAAA	2	12	1330649	1330660	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012490	TCGCCA	2	12	1383883	1383894	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
33	NC_012490	TCCGGA	2	12	1384354	1384365	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_012490	TTGTGA	2	12	1384547	1384558	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012490	GATGCT	2	12	1390455	1390466	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_012490	GCGATC	2	12	1414414	1414425	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_012490	AGTTCG	2	12	1414981	1414992	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_012490	TTTACG	2	12	1458254	1458265	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_012490	GACAAG	2	12	1519097	1519108	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_012490	AACCCT	2	12	1541847	1541858	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_012490	CGGGTG	2	12	1591727	1591738	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_012490	GTGGAG	2	12	1615978	1615989	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012490	TGCGGC	2	12	1732812	1732823	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_012490	GTCGAC	2	12	1772494	1772505	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_012490	TTGCAC	2	12	1783758	1783769	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_012490	CGATGC	2	12	1810137	1810148	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_012490	TCTGTG	2	12	1902705	1902716	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_012490	CTATGG	2	12	1925255	1925266	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_012490	GGTTCG	2	12	2039243	2039254	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_012490	GGGTAA	2	12	2044464	2044475	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012490	GGTAGG	2	12	2076895	2076906	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012490	GTCGGA	2	12	2109781	2109792	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_012490	TGAGCG	2	12	2134333	2134344	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_012490	CGGCTG	2	12	2176932	2176943	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_012490	GTTCGC	2	12	2217413	2217424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_012490	GACGGC	2	12	2240533	2240544	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_012490	CCGGGA	2	12	2259130	2259141	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_012490	GCGTCG	2	12	2358722	2358733	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_012490	CTTCGT	2	12	2392051	2392062	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_012490	GCGCAA	2	12	2423660	2423671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_012490	CTGTGC	2	12	2437555	2437566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_012490	TGTCGA	2	12	2475683	2475694	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_012490	CGAGGT	2	12	2482165	2482176	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_012490	GTATCG	2	12	2558599	2558610	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_012490	CAGAGT	2	12	2694461	2694472	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_012490	AAAGGT	2	12	2709928	2709939	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012490	TCGGAT	2	12	2721004	2721015	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_012490	CGCCAC	2	12	2733173	2733184	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_012490	CGCAGC	2	12	2840314	2840325	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
70	NC_012490	TTCGAT	2	12	2932869	2932880	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_012490	AAAGGT	2	12	2991838	2991849	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012490	TCGACG	2	12	2992806	2992817	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_012490	CGGTTC	2	12	3080095	3080106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_012490	ATGTCG	2	12	3088755	3088766	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_012490	CAAGTC	2	12	3122974	3122985	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_012490	CCCGGC	2	12	3228173	3228184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_012490	AGCAGG	2	12	3228773	3228784	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_012490	ACCCGT	2	12	3328454	3328465	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
79	NC_012490	AGATGG	2	12	3348716	3348727	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012490	GTTGAT	2	12	3359339	3359350	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012490	CAACCG	2	12	3479403	3479414	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
82	NC_012490	CCGAGT	2	12	3484107	3484118	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_012490	CCGAGT	2	12	3484355	3484366	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_012490	AACCCG	2	12	3546128	3546139	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
85	NC_012490	TGCCGG	2	12	3546726	3546737	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_012490	TGCACT	2	12	3546798	3546809	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_012490	TACGCG	2	12	3559185	3559196	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_012490	CTGCCT	2	12	3619278	3619289	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
89	NC_012490	AGTGCG	2	12	3711802	3711813	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_012490	TGGGAC	2	12	3712065	3712076	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_012490	GCGGGA	2	12	3832119	3832130	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_012490	CAGTGC	2	12	3922007	3922018	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_012490	GACCGG	2	12	3934500	3934511	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_012490	GATTTC	2	12	4194797	4194808	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_012490	TTGCTA	2	12	4198791	4198802	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_012490	CGGCAG	2	12	4227818	4227829	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_012490	CCCGCG	2	12	4227987	4227998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_012490	AGAGCG	2	12	4269293	4269304	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_012490	TGCCGG	2	12	4276581	4276592	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_012490	TGCACT	2	12	4276653	4276664	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_012490	AACGAA	2	12	4279436	4279447	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_012490	TGTCGG	2	12	4291275	4291286	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_012490	GAACCG	2	12	4297654	4297665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_012490	ATGCAC	2	12	4317372	4317383	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_012490	CCAGAC	2	12	4333585	4333596	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
106	NC_012490	CGTGCA	2	12	4348354	4348365	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_012490	TGCCGG	2	12	4467285	4467296	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_012490	TGCACT	2	12	4467357	4467368	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_012490	AACGAA	2	12	4470140	4470151	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_012490	CCGGTT	2	12	4617571	4617582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_012490	CGACCG	2	12	4655044	4655055	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
112	NC_012490	CACAAA	2	12	4791849	4791860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_012490	AACGGC	2	12	4798775	4798786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_012490	GTTGCC	3	18	4818922	4818939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_012490	CCGTTG	2	12	4819028	4819039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_012490	CCGAGG	2	12	4870302	4870313	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_012490	TTCCCT	2	12	4942799	4942810	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_012490	CATCGA	2	12	4975111	4975122	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_012490	AAGCGG	2	12	5082592	5082603	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_012490	TTTCGC	2	12	5229555	5229566	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_012490	GGAAGC	2	12	5276980	5276991	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_012490	CAACAG	2	12	5315185	5315196	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_012490	AACGGA	2	12	5352019	5352030	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_012490	CCGATG	2	12	5422117	5422128	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_012490	AGCCGA	2	12	5431187	5431198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_012490	CCACCT	2	12	5448508	5448519	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_012490	CAGTGA	2	12	5599103	5599114	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_012490	GCGTCA	2	12	5705698	5705709	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_012490	TAGATA	2	12	5798049	5798060	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012490	TCGGAT	2	12	5808359	5808370	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_012490	CAGGCC	2	12	5819854	5819865	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
132	NC_012490	GCAGCC	2	12	5849832	5849843	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
133	NC_012490	TCAACT	2	12	5954442	5954453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_012490	TCGAAG	2	12	5995718	5995729	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_012490	CGACCA	2	12	6039827	6039838	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
136	NC_012490	CCGAGG	2	12	6154387	6154398	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_012490	GTCAAG	2	12	6230908	6230919	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_012490	CACCTT	2	12	6266616	6266627	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_012490	ACTGTC	2	12	6372902	6372913	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.