MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides KD131 plasmid pRSKD131B

Total Repeats: 196

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011960	GCC	2	6	677	682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_011960	GCG	2	6	2067	2072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011960	CGG	2	6	2377	2382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011960	GGA	2	6	2398	2403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011960	CGG	3	9	2408	2416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011960	GCC	2	6	2726	2731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_011960	GCG	3	9	2820	2828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011960	GGC	2	6	2871	2876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_011960	CGG	2	6	2877	2882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011960	CTG	2	6	2982	2987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_011960	GCG	2	6	3646	3651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011960	GCC	2	6	3667	3672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_011960	GAC	2	6	3722	3727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011960	CGG	2	6	3757	3762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_011960	AGG	2	6	3795	3800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011960	CGC	2	6	4428	4433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_011960	CGC	2	6	7300	7305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_011960	CCG	2	6	7337	7342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_011960	GCC	2	6	7535	7540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_011960	GAG	2	6	7542	7547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011960	GCC	2	6	7911	7916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_011960	GCC	2	6	7923	7928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_011960	GCG	2	6	8061	8066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011960	CGG	2	6	9861	9866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011960	GCG	2	6	9869	9874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_011960	CGG	2	6	12461	12466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_011960	GCG	2	6	12490	12495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_011960	GGC	2	6	12507	12512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_011960	CCG	2	6	12598	12603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_011960	AGG	2	6	12642	12647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011960	GGC	2	6	12724	12729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_011960	CGC	2	6	12776	12781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_011960	TGC	2	6	12785	12790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011960	CCG	3	9	15327	15335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_011960	CGG	2	6	15377	15382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_011960	GAC	2	6	15429	15434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_011960	GGC	2	6	15512	15517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011960	GAC	2	6	15736	15741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011960	GAT	2	6	15751	15756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011960	CGA	2	6	15777	15782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_011960	GAA	2	6	21046	21051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011960	GAT	2	6	21142	21147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011960	GCG	2	6	21218	21223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011960	GGA	2	6	21309	21314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011960	CGG	2	6	22759	22764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011960	ACG	2	6	22820	22825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_011960	GCC	2	6	22852	22857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_011960	TCG	2	6	22863	22868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011960	GCT	2	6	22899	22904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_011960	GGC	2	6	22916	22921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_011960	ACA	2	6	23344	23349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_011960	TAT	2	6	23384	23389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011960	GGC	2	6	23451	23456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_011960	GTC	2	6	23497	23502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_011960	AAT	2	6	23556	23561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011960	GAA	2	6	23611	23616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011960	CGG	2	6	23805	23810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_011960	CGC	2	6	26266	26271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_011960	CGC	2	6	26318	26323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_011960	CGT	2	6	26382	26387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_011960	TCC	2	6	26418	26423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_011960	GCC	2	6	26615	26620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_011960	CCG	2	6	27119	27124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_011960	GCG	2	6	27177	27182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_011960	GCC	3	9	27197	27205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_011960	GCG	2	6	27249	27254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_011960	GCC	2	6	27294	27299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_011960	CGG	2	6	27310	27315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_011960	GGC	2	6	27339	27344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_011960	GCG	2	6	28310	28315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_011960	CCT	2	6	28335	28340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_011960	GCT	2	6	28343	28348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_011960	GTC	2	6	28378	28383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_011960	CTC	2	6	28499	28504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_011960	GCC	2	6	28507	28512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_011960	CCG	2	6	28516	28521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_011960	CCG	2	6	28550	28555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_011960	CGG	2	6	28572	28577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_011960	GGC	2	6	30956	30961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_011960	CGG	2	6	30973	30978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_011960	GCC	2	6	30979	30984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_011960	CCG	2	6	31051	31056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_011960	CTC	2	6	31595	31600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_011960	GAA	2	6	32537	32542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011960	GGC	2	6	32677	32682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_011960	CGG	2	6	32694	32699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_011960	AGA	2	6	32700	32705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011960	CTG	2	6	32767	32772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_011960	CGA	2	6	32818	32823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_011960	GCC	2	6	32859	32864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_011960	CCG	2	6	32883	32888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_011960	AAC	2	6	32909	32914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_011960	TCT	2	6	33369	33374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_011960	CGA	2	6	33413	33418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_011960	CGC	2	6	33472	33477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_011960	GGC	2	6	33506	33511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_011960	TCC	2	6	33915	33920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_011960	CGA	2	6	34034	34039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_011960	GAT	2	6	34101	34106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011960	CCT	2	6	35236	35241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_011960	GAG	2	6	35330	35335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011960	CGG	2	6	41063	41068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_011960	CAA	2	6	41167	41172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_011960	CCG	2	6	41544	41549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_011960	TAC	2	6	41709	41714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_011960	TTC	2	6	41744	41749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_011960	GCC	2	6	42032	42037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_011960	TGA	2	6	42067	42072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011960	CAA	2	6	42129	42134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_011960	ACG	2	6	42297	42302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_011960	GAG	2	6	42377	42382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011960	GCC	2	6	42443	42448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_011960	CGG	2	6	42457	42462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_011960	CGT	2	6	42527	42532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_011960	GCC	2	6	42600	42605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_011960	GGC	3	9	43084	43092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_011960	CGG	2	6	43094	43099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_011960	TCC	2	6	43554	43559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_011960	CGG	2	6	43627	43632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_011960	AGT	2	6	43675	43680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011960	CCA	2	6	43963	43968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_011960	TCC	2	6	44784	44789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_011960	CGG	2	6	44865	44870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_011960	GGC	2	6	45067	45072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_011960	CGG	2	6	45114	45119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_011960	AGG	2	6	45173	45178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011960	CGG	2	6	45192	45197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_011960	CAG	2	6	45427	45432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_011960	CGG	2	6	45445	45450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_011960	CGT	2	6	45508	45513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_011960	TCA	2	6	45514	45519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_011960	CGC	2	6	45525	45530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_011960	GAC	2	6	45602	45607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_011960	CCT	2	6	52756	52761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_011960	CGG	2	6	52805	52810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_011960	CGA	2	6	52839	52844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_011960	CCG	2	6	52900	52905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_011960	CGG	2	6	52960	52965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_011960	TCC	2	6	53041	53046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_011960	GAG	2	6	53185	53190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011960	GGA	2	6	53218	53223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.