MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides KD131 chromosome 2

Total Repeats: 67

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011958	CCGGCG	2	12	17729	17740	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_011958	GACCGG	2	12	38157	38168	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011958	GCCCGC	2	12	55977	55988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_011958	TCCGGG	2	12	63054	63065	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_011958	GCCAAC	2	12	65376	65387	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6	NC_011958	GAAGGA	2	12	83881	83892	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011958	GCGGGA	2	12	92955	92966	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_011958	CCCTTC	2	12	142949	142960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_011958	GCCGGC	2	12	168233	168244	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_011958	GGGCGG	2	12	175254	175265	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_011958	CCGCGC	2	12	181911	181922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_011958	CAGCCA	2	12	186270	186281	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
13	NC_011958	CCTATA	2	12	191750	191761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011958	GGGTAT	2	12	191764	191775	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011958	GCCGCG	2	12	193658	193669	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_011958	TGCCCG	2	12	207199	207210	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
17	NC_011958	CCGACC	2	12	213064	213075	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_011958	CCCGCC	2	12	254491	254502	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
19	NC_011958	CTTGGG	2	12	256168	256179	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_011958	GGGGAA	2	12	265214	265225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011958	CTGTCC	2	12	298291	298302	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
22	NC_011958	GGCGCA	2	12	320072	320083	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011958	GGGTCC	2	12	421604	421615	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011958	AGCCGC	2	12	425940	425951	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
25	NC_011958	GGGCAG	2	12	431091	431102	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_011958	GGCACG	2	12	442456	442467	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_011958	GCCCCT	2	12	459403	459414	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_011958	CGGCCG	2	12	464033	464044	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_011958	CGGCCC	2	12	467375	467386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_011958	TCATTT	2	12	512571	512582	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_011958	GCGGCT	2	12	588921	588932	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_011958	CGGCCG	2	12	611310	611321	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_011958	GCAGCC	2	12	638526	638537	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
34	NC_011958	TTGCCG	2	12	685864	685875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_011958	GGGCGA	2	12	732731	732742	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_011958	GATCCG	2	12	735244	735255	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_011958	ATGCTC	2	12	748187	748198	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011958	TCGACC	2	12	761928	761939	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
39	NC_011958	ACGAGA	2	12	773586	773597	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_011958	AGGCCA	2	12	774291	774302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_011958	GCAATC	2	12	778955	778966	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_011958	GCCGCA	2	12	810654	810665	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
43	NC_011958	CGGCAG	2	12	848284	848295	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011958	GCCCGA	2	12	857143	857154	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
45	NC_011958	ACCTCA	2	12	857294	857305	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_011958	CTGACC	2	12	859436	859447	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
47	NC_011958	TCGGGA	2	12	859617	859628	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_011958	GCCATC	2	12	867287	867298	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
49	NC_011958	GCCGCT	2	12	873047	873058	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
50	NC_011958	CGGCAG	2	12	910082	910093	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_011958	GCCAGA	2	12	977220	977231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_011958	TTGCCT	2	12	985713	985724	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_011958	GCCCCG	2	12	990739	990750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_011958	GGGCGC	2	12	1018837	1018848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_011958	CCCGGA	2	12	1053746	1053757	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
56	NC_011958	CGGCCG	2	12	1093990	1094001	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_011958	TCCGGG	2	12	1133638	1133649	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_011958	GCAGGG	2	12	1152494	1152505	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_011958	ACCGGC	2	12	1170405	1170416	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
60	NC_011958	CCAGCG	2	12	1170664	1170675	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
61	NC_011958	TGGGGG	2	12	1171104	1171115	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011958	GGCCGC	2	12	1174127	1174138	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_011958	AAGCGG	2	12	1175173	1175184	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_011958	GCGGTC	2	12	1215128	1215139	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_011958	GCTCGA	2	12	1232238	1232249	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011958	GGGGTC	2	12	1234434	1234445	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_011958	CAGCCG	2	12	1292081	1292092	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.