MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides KD131 chromosome 2

Total Repeats: 202

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011958	GCCGG	2	10	27048	27057	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2	NC_011958	TCCTC	2	10	27075	27084	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
3	NC_011958	CTGCC	2	10	29531	29540	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4	NC_011958	CGCAG	2	10	40018	40027	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_011958	CGGGC	2	10	53975	53984	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6	NC_011958	CCCTG	2	10	54166	54175	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
7	NC_011958	TCGTG	2	10	59547	59556	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_011958	GATCA	2	10	60804	60813	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_011958	CTCAT	2	10	63351	63360	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_011958	ATCCC	2	10	63859	63868	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
11	NC_011958	CAGCG	2	10	66915	66924	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_011958	GTCAT	2	10	81223	81232	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_011958	AGCCC	2	10	84642	84651	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
14	NC_011958	GAGGC	2	10	87936	87945	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
15	NC_011958	CGCGG	2	10	92969	92978	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
16	NC_011958	GGGAG	2	10	103326	103335	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011958	CCGGC	2	10	111214	111223	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
18	NC_011958	GGCGA	2	10	115290	115299	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
19	NC_011958	CCCGG	2	10	115360	115369	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
20	NC_011958	TCCGG	2	10	128170	128179	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_011958	AGCGG	2	10	134635	134644	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
22	NC_011958	TCGGG	2	10	136947	136956	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
23	NC_011958	TCCCG	2	10	138760	138769	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
24	NC_011958	GTCCC	2	10	142976	142985	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
25	NC_011958	TGCGG	2	10	159054	159063	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
26	NC_011958	CGCGG	2	10	165516	165525	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
27	NC_011958	GCCCG	2	10	166302	166311	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
28	NC_011958	GTGGC	2	10	168321	168330	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
29	NC_011958	GCCGT	2	10	175324	175333	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
30	NC_011958	AAAGG	2	10	175404	175413	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011958	CCATG	2	10	181725	181734	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
32	NC_011958	GCACC	2	10	186302	186311	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
33	NC_011958	GCTCT	2	10	191837	191846	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_011958	GCGCC	2	10	192308	192317	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
35	NC_011958	GCTCC	2	10	192919	192928	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
36	NC_011958	TCGAG	2	10	202996	203005	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_011958	GTGCG	2	10	203027	203036	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
38	NC_011958	CATAT	2	10	203320	203329	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_011958	CCCTG	2	10	206646	206655	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
40	NC_011958	GCCGC	2	10	209923	209932	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
41	NC_011958	ACCGA	2	10	209970	209979	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_011958	GGAGG	2	10	210084	210093	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011958	GCGGG	2	10	214871	214880	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
44	NC_011958	CGCCC	2	10	214895	214904	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
45	NC_011958	GGCCC	2	10	229102	229111	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
46	NC_011958	CCCCG	2	10	229189	229198	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
47	NC_011958	CTAAT	2	10	232705	232714	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_011958	GCGTC	2	10	242210	242219	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
49	NC_011958	GCCCG	2	10	242303	242312	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
50	NC_011958	GGCGC	2	10	242327	242336	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
51	NC_011958	GGCCG	2	10	256693	256702	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
52	NC_011958	GTGCC	2	10	265275	265284	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
53	NC_011958	GCGAT	2	10	270225	270234	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_011958	CCGGC	2	10	273965	273974	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
55	NC_011958	GGGAC	2	10	274209	274218	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
56	NC_011958	CTCCC	2	10	274333	274342	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
57	NC_011958	CGGGC	2	10	279863	279872	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
58	NC_011958	TCCTT	2	10	283412	283421	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
59	NC_011958	CCGGT	2	10	296472	296481	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
60	NC_011958	CGCGG	2	10	298455	298464	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
61	NC_011958	CGGAT	2	10	298497	298506	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_011958	TCGGT	2	10	306567	306576	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_011958	ATCTG	2	10	316208	316217	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_011958	CGGGG	2	10	333039	333048	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
65	NC_011958	CCCGA	2	10	351367	351376	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
66	NC_011958	TCGGG	2	10	351970	351979	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
67	NC_011958	GCCTC	2	10	396942	396951	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
68	NC_011958	CGGCG	2	10	399862	399871	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
69	NC_011958	CGAGC	2	10	402737	402746	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
70	NC_011958	GCCCC	2	10	412320	412329	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
71	NC_011958	CCCCT	2	10	412466	412475	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
72	NC_011958	GCAGA	2	10	416605	416614	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_011958	CGGCG	2	10	416620	416629	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
74	NC_011958	CTCCA	2	10	417732	417741	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
75	NC_011958	CGCCA	2	10	419326	419335	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
76	NC_011958	GCCCG	2	10	429209	429218	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
77	NC_011958	GGGGC	2	10	430943	430952	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
78	NC_011958	GACAG	2	10	431000	431009	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_011958	CGGCG	2	10	431690	431699	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
80	NC_011958	GCCGG	2	10	453601	453610	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
81	NC_011958	CCGGG	2	10	466233	466242	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
82	NC_011958	GAGGC	2	10	475634	475643	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
83	NC_011958	CCTGC	2	10	482433	482442	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
84	NC_011958	CCCGG	2	10	500144	500153	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
85	NC_011958	CCCGC	2	10	501276	501285	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
86	NC_011958	CGGGC	2	10	504830	504839	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
87	NC_011958	CCGGC	2	10	505012	505021	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
88	NC_011958	ACGCT	2	10	512519	512528	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
89	NC_011958	GTCGC	2	10	522687	522696	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
90	NC_011958	GCCGA	2	10	522881	522890	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
91	NC_011958	GCCCC	2	10	530344	530353	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
92	NC_011958	CCCCG	2	10	543865	543874	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
93	NC_011958	CCCCA	2	10	545281	545290	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
94	NC_011958	CCGTC	2	10	552118	552127	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
95	NC_011958	GGGAC	2	10	573820	573829	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
96	NC_011958	TCCTC	2	10	603895	603904	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
97	NC_011958	GGCCA	2	10	604091	604100	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
98	NC_011958	CCCCG	2	10	609940	609949	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
99	NC_011958	CACCG	2	10	650183	650192	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
100	NC_011958	CCCGG	2	10	671544	671553	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
101	NC_011958	CCCCT	2	10	671681	671690	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
102	NC_011958	AAGGC	2	10	671786	671795	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_011958	GCCGC	2	10	675237	675246	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
104	NC_011958	CCGAG	2	10	685846	685855	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
105	NC_011958	GGGCC	2	10	693462	693471	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
106	NC_011958	GGTCC	2	10	700569	700578	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
107	NC_011958	CGGGA	2	10	705251	705260	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
108	NC_011958	AAGAG	2	10	707908	707917	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011958	CCGAG	2	10	709343	709352	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
110	NC_011958	CCGTC	2	10	713992	714001	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
111	NC_011958	GATCA	2	10	724588	724597	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_011958	TGGGT	2	10	724847	724856	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011958	AGACA	2	10	727249	727258	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_011958	GTCGG	2	10	731655	731664	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
115	NC_011958	GGCGG	2	10	731938	731947	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
116	NC_011958	CTGTG	2	10	735013	735022	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_011958	GCCAC	2	10	735095	735104	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
118	NC_011958	TGCTC	2	10	746190	746199	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_011958	AAAGG	2	10	746373	746382	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011958	TTCGC	2	10	747021	747030	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
121	NC_011958	CCCTG	2	10	750144	750153	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
122	NC_011958	GGGAC	2	10	750309	750318	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
123	NC_011958	GCCGC	2	10	754965	754974	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
124	NC_011958	TCCTC	2	10	761450	761459	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
125	NC_011958	CGGCG	2	10	767995	768004	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
126	NC_011958	TCTGC	2	10	774251	774260	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_011958	GCTCC	2	10	779181	779190	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
128	NC_011958	ACGGC	2	10	782374	782383	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
129	NC_011958	GGTCC	2	10	795697	795706	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
130	NC_011958	GGAAG	2	10	818595	818604	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011958	CGCGG	2	10	838406	838415	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
132	NC_011958	GGACC	2	10	880683	880692	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
133	NC_011958	CGCAG	2	10	890621	890630	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
134	NC_011958	CCGAC	2	10	901985	901994	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
135	NC_011958	GCGCC	2	10	910100	910109	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
136	NC_011958	CGGCG	2	10	910167	910176	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
137	NC_011958	CGGAG	2	10	922796	922805	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
138	NC_011958	GCAAA	2	10	922914	922923	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_011958	ACGTA	2	10	931545	931554	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_011958	GGCCG	2	10	934948	934957	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
141	NC_011958	CGGGG	2	10	935125	935134	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
142	NC_011958	TCGCC	3	15	935197	935211	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
143	NC_011958	TGCGC	2	10	935842	935851	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
144	NC_011958	CAGCC	2	10	936103	936112	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
145	NC_011958	CAAGC	2	10	936915	936924	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
146	NC_011958	TTCAG	2	10	937492	937501	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_011958	GGGCG	2	10	941980	941989	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
148	NC_011958	TGTCT	2	10	964362	964371	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
149	NC_011958	TGTCT	2	10	964373	964382	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
150	NC_011958	AAGGA	2	10	966633	966642	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011958	GCGCA	2	10	976246	976255	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
152	NC_011958	GCTGC	2	10	977262	977271	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
153	NC_011958	GCGAC	2	10	977310	977319	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
154	NC_011958	CACCT	2	10	985816	985825	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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156	NC_011958	CGGCG	2	10	1008620	1008629	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
157	NC_011958	CCCGC	2	10	1016345	1016354	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
158	NC_011958	CGCCC	2	10	1032557	1032566	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
159	NC_011958	GGGAT	2	10	1052943	1052952	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
160	NC_011958	GATGA	2	10	1053450	1053459	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_011958	TGATC	2	10	1055998	1056007	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
163	NC_011958	CACGA	2	10	1057255	1057264	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
164	NC_011958	CTCCG	2	10	1068416	1068425	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
165	NC_011958	CAATT	2	10	1070570	1070579	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
166	NC_011958	ACAGA	2	10	1086091	1086100	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
167	NC_011958	ACGGA	2	10	1094224	1094233	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
168	NC_011958	CGGCC	2	10	1097044	1097053	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
169	NC_011958	CGGCC	2	10	1115483	1115492	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
170	NC_011958	GGGGC	2	10	1119246	1119255	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
171	NC_011958	CGGAC	2	10	1119451	1119460	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
172	NC_011958	TCGTG	2	10	1130131	1130140	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
173	NC_011958	GATCA	2	10	1131388	1131397	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
174	NC_011958	CTCAT	2	10	1133935	1133944	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
175	NC_011958	ATCCC	2	10	1134443	1134452	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
176	NC_011958	TCGAC	2	10	1137286	1137295	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
177	NC_011958	ACGGG	2	10	1137542	1137551	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
178	NC_011958	GCGAT	2	10	1138274	1138283	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
179	NC_011958	CGTCC	2	10	1157857	1157866	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
180	NC_011958	GACAG	2	10	1157983	1157992	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
181	NC_011958	TCCGC	2	10	1161063	1161072	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
182	NC_011958	CCCGT	2	10	1171077	1171086	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
183	NC_011958	CGCGC	2	10	1174155	1174164	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
184	NC_011958	TCCCC	2	10	1174294	1174303	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
185	NC_011958	GGCAG	2	10	1194339	1194348	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
186	NC_011958	GGCAG	2	10	1195503	1195512	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
187	NC_011958	CTCCG	2	10	1208442	1208451	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
188	NC_011958	TCCGG	2	10	1208487	1208496	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
189	NC_011958	GGCCG	2	10	1218357	1218366	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
190	NC_011958	CGCAG	2	10	1226387	1226396	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
191	NC_011958	TGCCA	2	10	1245703	1245712	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
192	NC_011958	CGCAT	2	10	1250812	1250821	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
193	NC_011958	ACACG	2	10	1251810	1251819	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
194	NC_011958	GCGCG	2	10	1251870	1251879	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
195	NC_011958	CGCTT	2	10	1256333	1256342	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
196	NC_011958	CCGCA	2	10	1263292	1263301	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
197	NC_011958	CGCAG	2	10	1263510	1263519	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
198	NC_011958	TCCGG	2	10	1263577	1263586	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
199	NC_011958	AGGCG	2	10	1264018	1264027	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
200	NC_011958	CTCGG	2	10	1281485	1281494	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
201	NC_011958	CCTCC	2	10	1289268	1289277	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
202	NC_011958	CGGCC	2	10	1292023	1292032	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.