MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodospirillum centenum SW chromosome

Total Repeats: 14364

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011420	CCG	2	6	371760	371765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1002	NC_011420	GGC	3	9	372971	372979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_011420	AGG	2	6	376088	376093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_011420	GCCC	2	8	376124	376131	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1005	NC_011420	GCT	2	6	376211	376216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_011420	A	6	6	378049	378054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_011420	TCG	2	6	378096	378101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_011420	GAA	2	6	378959	378964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_011420	CGC	2	6	379017	379022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1010	NC_011420	CGATC	2	10	379030	379039	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1011	NC_011420	GC	3	6	379062	379067	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1012	NC_011420	TCC	2	6	379103	379108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1013	NC_011420	TGC	2	6	379177	379182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_011420	GCA	2	6	385772	385777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_011420	ATC	2	6	385780	385785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_011420	CGGG	2	8	385789	385796	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1017	NC_011420	TCCCTG	2	12	386258	386269	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1018	NC_011420	CGGCG	2	10	386275	386284	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1019	NC_011420	GCG	2	6	386345	386350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_011420	AGA	2	6	386362	386367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_011420	TCA	2	6	386412	386417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_011420	GAG	2	6	386477	386482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_011420	TCTGGT	2	12	386525	386536	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1024	NC_011420	GCT	2	6	386594	386599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_011420	TGA	2	6	386634	386639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_011420	GGC	2	6	386664	386669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_011420	GGGAT	2	10	386734	386743	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_011420	CCA	2	6	386768	386773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1029	NC_011420	GC	3	6	386880	386885	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1030	NC_011420	GGA	2	6	386892	386897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_011420	TAG	2	6	386916	386921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_011420	CG	3	6	386932	386937	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1033	NC_011420	GTG	2	6	386968	386973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_011420	ACG	2	6	387185	387190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_011420	TGA	2	6	387265	387270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_011420	ACC	2	6	387380	387385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1037	NC_011420	GGCT	2	8	387438	387445	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1038	NC_011420	CG	3	6	387495	387500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1039	NC_011420	GGT	2	6	387603	387608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_011420	GCC	2	6	387873	387878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1041	NC_011420	CCT	2	6	387911	387916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1042	NC_011420	TG	3	6	387963	387968	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_011420	C	6	6	388021	388026	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1044	NC_011420	TC	3	6	388103	388108	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1045	NC_011420	TCAC	2	8	388237	388244	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1046	NC_011420	GGTG	2	8	388499	388506	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_011420	CTTT	2	8	388567	388574	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1048	NC_011420	GCT	2	6	388583	388588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_011420	CCT	2	6	388599	388604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1050	NC_011420	CCA	2	6	388641	388646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1051	NC_011420	ACCG	2	8	388703	388710	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1052	NC_011420	CTGC	2	8	388712	388719	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1053	NC_011420	C	6	6	388772	388777	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1054	NC_011420	ACGCG	2	10	388811	388820	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1055	NC_011420	ACA	2	6	388988	388993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_011420	TCGCTT	2	12	389018	389029	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_011420	GCA	2	6	389055	389060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_011420	AGG	2	6	389110	389115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_011420	TCG	2	6	389163	389168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_011420	GAG	2	6	389217	389222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_011420	C	6	6	389244	389249	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1062	NC_011420	GATC	2	8	389289	389296	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1063	NC_011420	TCGC	2	8	389388	389395	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1064	NC_011420	ACT	2	6	389397	389402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_011420	TCC	2	6	389427	389432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1066	NC_011420	CCA	2	6	389609	389614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1067	NC_011420	TCCT	2	8	389635	389642	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1068	NC_011420	CAC	2	6	389672	389677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1069	NC_011420	CCT	2	6	389773	389778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1070	NC_011420	GCT	2	6	389806	389811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_011420	GCGGG	2	10	389832	389841	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1072	NC_011420	GGC	2	6	389849	389854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_011420	GGGAT	2	10	389919	389928	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_011420	CCA	2	6	389953	389958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1075	NC_011420	GCCC	2	8	389964	389971	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1076	NC_011420	GCG	2	6	390015	390020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_011420	AGG	2	6	390054	390059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_011420	ACCGT	2	10	390117	390126	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1079	NC_011420	CCT	2	6	390136	390141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1080	NC_011420	GT	3	6	390195	390200	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_011420	CAC	2	6	390346	390351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1082	NC_011420	GT	3	6	390363	390368	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_011420	TCC	2	6	390414	390419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1084	NC_011420	ATG	2	6	390458	390463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_011420	CACGA	2	10	390513	390522	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1086	NC_011420	GAC	2	6	390526	390531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_011420	GCA	2	6	390538	390543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_011420	GGC	2	6	390583	390588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_011420	GCC	2	6	390857	390862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1090	NC_011420	TTC	2	6	390876	390881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_011420	CCAC	2	8	390918	390925	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1092	NC_011420	GCC	2	6	391003	391008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1093	NC_011420	AAC	2	6	391037	391042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_011420	GCT	2	6	391067	391072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_011420	CTT	2	6	391092	391097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_011420	TCA	2	6	391110	391115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_011420	TCG	2	6	391116	391121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_011420	TCA	2	6	391153	391158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_011420	CTG	2	6	391210	391215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_011420	ATC	2	6	391260	391265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_011420	TCG	2	6	391285	391290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_011420	CCA	2	6	391309	391314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1103	NC_011420	CTC	2	6	391338	391343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1104	NC_011420	TTCG	2	8	391465	391472	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1105	NC_011420	GCC	2	6	391492	391497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_011420	CGTT	2	8	391500	391507	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1107	NC_011420	CGA	2	6	391678	391683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_011420	CGC	2	6	391720	391725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1109	NC_011420	TC	4	8	391738	391745	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1110	NC_011420	CCT	2	6	391779	391784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1111	NC_011420	AGG	2	6	391786	391791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_011420	AAC	2	6	391798	391803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_011420	CGC	2	6	391951	391956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1114	NC_011420	A	7	7	392028	392034	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_011420	G	6	6	392085	392090	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_011420	CGGAA	2	10	392566	392575	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1117	NC_011420	CGG	2	6	392598	392603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_011420	TTCCC	2	10	393977	393986	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
1119	NC_011420	CGC	2	6	394038	394043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1120	NC_011420	TCC	2	6	395234	395239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1121	NC_011420	GTC	2	6	395251	395256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_011420	GCCCG	2	10	395314	395323	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1123	NC_011420	GGCCGG	2	12	395383	395394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_011420	AGG	2	6	395406	395411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_011420	CTG	2	6	395886	395891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_011420	CGA	2	6	395897	395902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_011420	CGC	2	6	395932	395937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1128	NC_011420	CTC	2	6	397983	397988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1129	NC_011420	ATC	2	6	397993	397998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_011420	CGG	2	6	398016	398021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_011420	TCCG	2	8	398066	398073	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1132	NC_011420	CCG	2	6	398191	398196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1133	NC_011420	CAC	2	6	398312	398317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1134	NC_011420	ACGGAA	2	12	398351	398362	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1135	NC_011420	AAC	2	6	398410	398415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_011420	CGGG	2	8	398451	398458	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1137	NC_011420	GCA	2	6	398503	398508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1138	NC_011420	CCG	2	6	398545	398550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1139	NC_011420	TCC	2	6	400607	400612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1140	NC_011420	GTG	2	6	402441	402446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1141	NC_011420	CG	3	6	404212	404217	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1142	NC_011420	C	6	6	404308	404313	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1143	NC_011420	TGCA	2	8	404317	404324	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1144	NC_011420	GCG	2	6	404357	404362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1145	NC_011420	CCG	2	6	404382	404387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1146	NC_011420	CAG	2	6	404404	404409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1148	NC_011420	CGC	2	6	404451	404456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1150	NC_011420	GCC	2	6	405485	405490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1151	NC_011420	GCA	2	6	405507	405512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1154	NC_011420	CGGG	2	8	406377	406384	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1155	NC_011420	GCG	2	6	406405	406410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1156	NC_011420	C	7	7	406460	406466	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1157	NC_011420	CCGG	2	8	407086	407093	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1158	NC_011420	GGC	2	6	407943	407948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1159	NC_011420	GCC	2	6	407961	407966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1160	NC_011420	CGG	3	9	407981	407989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1161	NC_011420	CGCC	2	8	408416	408423	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1162	NC_011420	CGGGC	2	10	408426	408435	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1163	NC_011420	GC	3	6	408513	408518	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1164	NC_011420	C	6	6	408526	408531	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1165	NC_011420	GCA	2	6	408543	408548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1166	NC_011420	CCT	2	6	412322	412327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1167	NC_011420	CTGGG	2	10	412338	412347	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1168	NC_011420	GCCG	2	8	412352	412359	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1169	NC_011420	GCG	2	6	412397	412402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1172	NC_011420	GGACA	2	10	413391	413400	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1173	NC_011420	GCCCC	2	10	413420	413429	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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1175	NC_011420	CGGG	2	8	415525	415532	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1176	NC_011420	GCC	2	6	415572	415577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1178	NC_011420	TCG	2	6	417302	417307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1179	NC_011420	GCG	3	9	417327	417335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1180	NC_011420	CTC	2	6	418082	418087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1197	NC_011420	GC	3	6	420575	420580	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1198	NC_011420	GGCA	2	8	420581	420588	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1254	NC_011420	CGGAAA	2	12	443931	443942	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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1268	NC_011420	CGG	3	9	450131	450139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1269	NC_011420	GCCCG	2	10	450253	450262	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1270	NC_011420	GCG	2	6	450307	450312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1273	NC_011420	CCG	2	6	450425	450430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1408	NC_011420	GC	3	6	489457	489462	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1409	NC_011420	GGC	2	6	489472	489477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1410	NC_011420	GCC	2	6	489512	489517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1411	NC_011420	GCC	2	6	489557	489562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1412	NC_011420	TGC	2	6	489594	489599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1431	NC_011420	GGCG	2	8	490138	490145	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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