MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 plasmid pRLG204

Total Repeats: 297

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011371	CGA	2	6	7469	7474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011371	GCC	2	6	11016	11021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_011371	CGG	2	6	11612	11617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011371	CAC	2	6	11712	11717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_011371	TTC	2	6	12594	12599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011371	GGC	2	6	12626	12631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_011371	GCG	2	6	13361	13366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011371	CCG	2	6	14332	14337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_011371	TGC	2	6	14363	14368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011371	TCG	2	6	19420	19425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_011371	AAG	2	6	20423	20428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011371	GCC	2	6	20458	20463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_011371	GCC	2	6	21279	21284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_011371	CGG	2	6	23242	23247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_011371	GCA	2	6	23292	23297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011371	TTC	2	6	23310	23315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_011371	GAT	2	6	23322	23327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011371	AGC	2	6	23419	23424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_011371	GCT	2	6	23527	23532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_011371	CAG	2	6	23563	23568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_011371	GCG	2	6	23587	23592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011371	GAT	2	6	28380	28385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011371	GCG	2	6	28463	28468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011371	CTG	2	6	28548	28553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011371	TGC	2	6	28557	28562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_011371	CGC	2	6	28585	28590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_011371	GCA	2	6	30318	30323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_011371	CTC	2	6	32178	32183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_011371	GAC	2	6	32219	32224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_011371	CGG	2	6	33350	33355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_011371	TCG	2	6	33444	33449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_011371	CAG	2	6	33452	33457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011371	GTC	2	6	33458	33463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011371	CCG	2	6	33508	33513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_011371	TCG	2	6	35085	35090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_011371	CCG	2	6	38231	38236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_011371	TCC	3	9	39901	39909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_011371	GCC	2	6	39925	39930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_011371	CTC	2	6	40038	40043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_011371	GGA	2	6	40108	40113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011371	CGA	2	6	40118	40123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_011371	GCC	2	6	41322	41327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_011371	TTC	2	6	41371	41376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011371	CTG	2	6	42035	42040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011371	TGT	2	6	42058	42063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011371	CAT	2	6	42168	42173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_011371	CGG	2	6	46613	46618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_011371	GCG	2	6	47144	47149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011371	TCC	2	6	47150	47155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_011371	GGC	2	6	47296	47301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_011371	CAG	2	6	47309	47314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_011371	CGG	2	6	47326	47331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_011371	GCA	2	6	48205	48210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_011371	TGA	2	6	48284	48289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011371	GCC	2	6	48291	48296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_011371	CCG	2	6	48312	48317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_011371	CTT	2	6	48380	48385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_011371	GCT	2	6	48405	48410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_011371	GCA	2	6	48416	48421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011371	CTG	2	6	50478	50483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_011371	AGC	2	6	50565	50570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011371	CGG	2	6	50576	50581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_011371	GGC	2	6	50621	50626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011371	TCT	2	6	50696	50701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_011371	ATG	2	6	61429	61434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011371	CGC	2	6	62795	62800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_011371	CGT	2	6	62813	62818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_011371	AGA	2	6	69955	69960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011371	GGC	2	6	69987	69992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_011371	GGC	2	6	70005	70010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_011371	CGC	2	6	70107	70112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_011371	TGA	2	6	70175	70180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011371	TCA	2	6	70242	70247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_011371	ATG	2	6	70251	70256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011371	CGG	2	6	70334	70339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_011371	TCA	2	6	71761	71766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_011371	GCC	2	6	71777	71782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_011371	CGA	2	6	73374	73379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_011371	TTC	2	6	79080	79085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_011371	GGA	2	6	79511	79516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011371	TTG	2	6	80308	80313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011371	TGG	2	6	80359	80364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011371	GCA	2	6	80406	80411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_011371	GTT	2	6	83378	83383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011371	GAT	2	6	83384	83389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011371	TGA	2	6	85950	85955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011371	CGC	2	6	85995	86000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_011371	GGA	2	6	86001	86006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011371	CCG	2	6	86039	86044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_011371	ATT	2	6	86142	86147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011371	ATG	2	6	86190	86195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011371	CAT	2	6	86224	86229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_011371	CGG	2	6	86297	86302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_011371	TCG	2	6	86336	86341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_011371	TGG	2	6	89868	89873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011371	GCT	2	6	89878	89883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_011371	ATC	2	6	89892	89897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_011371	TGC	2	6	89974	89979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_011371	GTG	2	6	90101	90106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011371	CAA	2	6	90135	90140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_011371	GGA	2	6	95802	95807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011371	CTC	2	6	97965	97970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_011371	AGC	2	6	98285	98290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_011371	CGT	2	6	98298	98303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_011371	AGC	2	6	99767	99772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_011371	GAG	2	6	99806	99811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011371	TTC	2	6	100096	100101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_011371	GAG	2	6	100118	100123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011371	AGT	2	6	100140	100145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011371	GTT	2	6	100290	100295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011371	TGG	2	6	100336	100341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011371	AAG	2	6	102026	102031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011371	TCC	2	6	102057	102062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_011371	CAC	2	6	102087	102092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_011371	AAC	2	6	102119	102124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_011371	GCG	2	6	102143	102148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_011371	TCG	2	6	104149	104154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_011371	TGT	2	6	109999	110004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011371	TCT	2	6	110045	110050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_011371	GCA	2	6	111802	111807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_011371	CAA	2	6	111848	111853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_011371	TGC	2	6	111868	111873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_011371	ATG	2	6	111884	111889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011371	TAA	3	9	111900	111908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011371	TCT	2	6	111948	111953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_011371	TGC	2	6	111963	111968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_011371	GAG	2	6	112066	112071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011371	ACG	2	6	114177	114182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_011371	GGC	2	6	114184	114189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_011371	ACC	2	6	114236	114241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_011371	CGA	2	6	114486	114491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_011371	TTG	2	6	114494	114499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011371	GGA	2	6	114516	114521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011371	CGA	2	6	117881	117886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_011371	CGC	2	6	120677	120682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_011371	GAG	2	6	120721	120726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011371	TGG	2	6	120738	120743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011371	CCG	2	6	120810	120815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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272	NC_011371	TTG	2	6	238922	238927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
273	NC_011371	CGG	2	6	240013	240018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
274	NC_011371	ATC	2	6	240038	240043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
275	NC_011371	AGA	2	6	242776	242781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
276	NC_011371	TAG	2	6	243431	243436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
277	NC_011371	TAC	2	6	243444	243449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
278	NC_011371	CGG	2	6	243628	243633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
279	NC_011371	TCA	2	6	244725	244730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
280	NC_011371	GGA	2	6	244833	244838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
281	NC_011371	AGG	2	6	246809	246814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
282	NC_011371	AGG	2	6	246842	246847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
283	NC_011371	CGT	2	6	248091	248096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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285	NC_011371	GAG	2	6	248199	248204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_011371	GCC	2	6	248245	248250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
289	NC_011371	CCA	2	6	248258	248263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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294	NC_011371	CAT	2	6	251227	251232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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296	NC_011371	CGG	2	6	256356	256361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
297	NC_011371	ACG	2	6	256934	256939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.