MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 chromosome

Total Repeats: 11442

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011369	GGCGC	2	10	1139281	1139290	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3002	NC_011369	GAA	2	6	1139854	1139859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_011369	CAAA	2	8	1139871	1139878	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3004	NC_011369	GC	3	6	1140507	1140512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3005	NC_011369	GC	3	6	1140518	1140523	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3006	NC_011369	CTC	2	6	1141105	1141110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3007	NC_011369	GTC	2	6	1141126	1141131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_011369	GCC	2	6	1141160	1141165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3009	NC_011369	CA	3	6	1141560	1141565	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3010	NC_011369	GCC	2	6	1142179	1142184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3011	NC_011369	CG	3	6	1142230	1142235	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3012	NC_011369	GTC	2	6	1142612	1142617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_011369	A	6	6	1142940	1142945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_011369	G	6	6	1142972	1142977	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_011369	GGA	2	6	1143001	1143006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_011369	GAG	2	6	1143236	1143241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_011369	TTG	2	6	1143444	1143449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_011369	TGG	2	6	1143498	1143503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_011369	TGT	2	6	1144061	1144066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_011369	ATC	2	6	1144073	1144078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_011369	T	6	6	1144122	1144127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_011369	GCG	2	6	1144226	1144231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_011369	CGC	2	6	1144236	1144241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3024	NC_011369	TGT	2	6	1144244	1144249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_011369	CTT	2	6	1144766	1144771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_011369	CAC	2	6	1144811	1144816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3027	NC_011369	GCT	2	6	1144867	1144872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_011369	GGTC	2	8	1144911	1144918	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3029	NC_011369	GCT	2	6	1144944	1144949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_011369	ATAG	2	8	1144968	1144975	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_011369	CAG	2	6	1145040	1145045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_011369	CAG	2	6	1145085	1145090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_011369	AAC	2	6	1145117	1145122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_011369	ATA	2	6	1145128	1145133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_011369	CAG	2	6	1145227	1145232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_011369	CGG	2	6	1145333	1145338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_011369	GTC	2	6	1145380	1145385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_011369	GGC	2	6	1145409	1145414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_011369	GAC	2	6	1147424	1147429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3040	NC_011369	GC	3	6	1147818	1147823	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3041	NC_011369	CTCG	2	8	1147839	1147846	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3042	NC_011369	TTC	2	6	1147850	1147855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_011369	TTC	2	6	1147893	1147898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_011369	GGT	2	6	1147917	1147922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_011369	AATG	2	8	1147925	1147932	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_011369	CGG	2	6	1147946	1147951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_011369	CCA	2	6	1147972	1147977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3048	NC_011369	TTC	2	6	1148031	1148036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3049	NC_011369	CTG	2	6	1148093	1148098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_011369	GC	3	6	1148118	1148123	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3051	NC_011369	TTG	2	6	1149514	1149519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_011369	TTG	2	6	1149582	1149587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_011369	AT	3	6	1149609	1149614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_011369	TGA	2	6	1149618	1149623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_011369	CAA	2	6	1149633	1149638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_011369	AAC	2	6	1149644	1149649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_011369	GAG	2	6	1151525	1151530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_011369	GGA	2	6	1151557	1151562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_011369	TGG	2	6	1151584	1151589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_011369	TGG	2	6	1151596	1151601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_011369	GAA	2	6	1151710	1151715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_011369	GTC	2	6	1151717	1151722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_011369	AAGG	2	8	1151738	1151745	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_011369	TGA	2	6	1151894	1151899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_011369	GGGT	2	8	1151975	1151982	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_011369	AAC	2	6	1152034	1152039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3067	NC_011369	GAC	2	6	1152146	1152151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_011369	TCAAAT	2	12	1152303	1152314	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3069	NC_011369	TTCT	2	8	1153208	1153215	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3070	NC_011369	AGC	2	6	1153256	1153261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3071	NC_011369	AAC	2	6	1153271	1153276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3072	NC_011369	GCTT	2	8	1155573	1155580	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3073	NC_011369	GAT	2	6	1155593	1155598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_011369	AACA	2	8	1159532	1159539	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3075	NC_011369	GCG	2	6	1159555	1159560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3076	NC_011369	AAAG	2	8	1159579	1159586	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_011369	AAT	2	6	1167185	1167190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_011369	CTCCGA	2	12	1167225	1167236	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3079	NC_011369	GGC	2	6	1167265	1167270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3080	NC_011369	TTC	2	6	1172112	1172117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_011369	GGA	2	6	1172148	1172153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_011369	CTT	2	6	1172188	1172193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3083	NC_011369	GAC	2	6	1172789	1172794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3084	NC_011369	GAT	2	6	1172826	1172831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_011369	GTGGG	2	10	1172840	1172849	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_011369	GCT	2	6	1172920	1172925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3087	NC_011369	CT	3	6	1172928	1172933	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3088	NC_011369	GAA	2	6	1173002	1173007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_011369	TTGG	2	8	1173073	1173080	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_011369	GCA	2	6	1173111	1173116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3091	NC_011369	CAT	2	6	1173248	1173253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3092	NC_011369	GTAGCA	2	12	1173337	1173348	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3093	NC_011369	T	6	6	1173361	1173366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_011369	CTG	2	6	1173461	1173466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3095	NC_011369	CTTG	2	8	1173469	1173476	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3096	NC_011369	GGC	2	6	1173586	1173591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3097	NC_011369	ATC	2	6	1173607	1173612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3098	NC_011369	ATC	2	6	1174591	1174596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3099	NC_011369	ACT	2	6	1177591	1177596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_011369	TCA	2	6	1177630	1177635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_011369	TGC	2	6	1177638	1177643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_011369	CA	3	6	1177671	1177676	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3103	NC_011369	TCAA	2	8	1178549	1178556	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3104	NC_011369	CTC	2	6	1178573	1178578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3105	NC_011369	GGA	2	6	1178618	1178623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_011369	GCC	2	6	1179389	1179394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3107	NC_011369	TGG	2	6	1181220	1181225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_011369	T	6	6	1181237	1181242	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_011369	TGCT	2	8	1181815	1181822	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3110	NC_011369	CG	3	6	1181850	1181855	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3111	NC_011369	CGTT	2	8	1181891	1181898	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3112	NC_011369	GC	3	6	1181900	1181905	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3113	NC_011369	TGGC	2	8	1182012	1182019	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3114	NC_011369	GCGCG	2	10	1182033	1182042	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3115	NC_011369	GAG	2	6	1186443	1186448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_011369	GCA	2	6	1186582	1186587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_011369	CGC	2	6	1186600	1186605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3118	NC_011369	T	6	6	1186725	1186730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_011369	TTA	2	6	1186736	1186741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_011369	AAC	2	6	1186858	1186863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_011369	TCGCA	2	10	1186901	1186910	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3122	NC_011369	ACA	2	6	1186950	1186955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_011369	CGC	2	6	1187017	1187022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3124	NC_011369	CGG	2	6	1188343	1188348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3125	NC_011369	GCATC	2	10	1188354	1188363	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3126	NC_011369	T	7	7	1188389	1188395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_011369	GC	4	8	1188464	1188471	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3128	NC_011369	CGG	2	6	1188511	1188516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3129	NC_011369	GAG	2	6	1188545	1188550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_011369	GCC	2	6	1195634	1195639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3131	NC_011369	GTC	2	6	1197644	1197649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3132	NC_011369	CTA	2	6	1197692	1197697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3133	NC_011369	CTGG	2	8	1197748	1197755	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3134	NC_011369	AGCC	2	8	1197793	1197800	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3135	NC_011369	CTG	2	6	1197819	1197824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3137	NC_011369	GATG	2	8	1198700	1198707	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3138	NC_011369	GGCG	2	8	1198771	1198778	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3139	NC_011369	GAG	3	9	1198864	1198872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3140	NC_011369	GTC	2	6	1198893	1198898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3142	NC_011369	TCC	2	6	1199971	1199976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3151	NC_011369	CGG	2	6	1201944	1201949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3153	NC_011369	GTG	2	6	1204164	1204169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3164	NC_011369	CGG	2	6	1206211	1206216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3244	NC_011369	CGG	3	9	1253491	1253499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3246	NC_011369	GGAAC	2	10	1253639	1253648	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3247	NC_011369	ATG	2	6	1253709	1253714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3249	NC_011369	GC	3	6	1253809	1253814	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3250	NC_011369	GCG	2	6	1253846	1253851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3251	NC_011369	ATC	2	6	1254197	1254202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3253	NC_011369	A	7	7	1254262	1254268	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3254	NC_011369	CAA	2	6	1254865	1254870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3255	NC_011369	GGA	2	6	1254873	1254878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3256	NC_011369	CGC	2	6	1256550	1256555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3257	NC_011369	GAC	2	6	1256560	1256565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3258	NC_011369	GCG	2	6	1256582	1256587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3259	NC_011369	TGCG	2	8	1256611	1256618	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3260	NC_011369	ATG	2	6	1256710	1256715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3261	NC_011369	CG	3	6	1258898	1258903	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3262	NC_011369	CGG	2	6	1258906	1258911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3373	NC_011369	TGAC	2	8	1301047	1301054	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3380	NC_011369	ATC	2	6	1304785	1304790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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