MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 chromosome

Total Repeats: 11442

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011369	TCA	2	6	437259	437264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_011369	CGT	2	6	437322	437327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_011369	CAG	2	6	437348	437353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_011369	GCC	2	6	437356	437361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1005	NC_011369	TGGCT	2	10	437368	437377	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1006	NC_011369	GCG	2	6	437383	437388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_011369	GCGG	2	8	437402	437409	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1008	NC_011369	A	6	6	437429	437434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_011369	CT	3	6	437475	437480	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1010	NC_011369	A	6	6	437482	437487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_011369	GGCG	2	8	437503	437510	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1012	NC_011369	CGCAA	2	10	437524	437533	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1013	NC_011369	CTG	2	6	437549	437554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_011369	GCGCG	2	10	437571	437580	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1015	NC_011369	AAC	2	6	437588	437593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_011369	GAT	2	6	439905	439910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_011369	CTG	2	6	439930	439935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_011369	GC	3	6	440345	440350	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1019	NC_011369	GCA	2	6	440361	440366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_011369	CGC	2	6	441967	441972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1021	NC_011369	CGC	2	6	441984	441989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1022	NC_011369	A	6	6	441996	442001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_011369	CGG	2	6	442004	442009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_011369	GC	3	6	442023	442028	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1025	NC_011369	AC	3	6	442033	442038	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1026	NC_011369	AGGGA	2	10	442050	442059	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_011369	CGG	2	6	443209	443214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_011369	CCGG	2	8	443216	443223	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1029	NC_011369	TCCT	2	8	443237	443244	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1030	NC_011369	CCG	2	6	443296	443301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1031	NC_011369	GGC	2	6	445398	445403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_011369	TTCT	2	8	446349	446356	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1033	NC_011369	GAC	2	6	446408	446413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_011369	GCC	2	6	447204	447209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1035	NC_011369	CTC	2	6	447240	447245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1036	NC_011369	GC	3	6	447719	447724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1037	NC_011369	GCC	2	6	447754	447759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1038	NC_011369	ATGAT	2	10	447828	447837	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_011369	TGA	2	6	447900	447905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_011369	CCCG	2	8	447923	447930	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1041	NC_011369	ATG	2	6	447946	447951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_011369	CG	3	6	447958	447963	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1043	NC_011369	TGA	2	6	449625	449630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_011369	CCTG	2	8	449715	449722	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1045	NC_011369	CG	3	6	449734	449739	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1046	NC_011369	TGCAG	2	10	449823	449832	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1047	NC_011369	GTT	2	6	449877	449882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_011369	GGT	2	6	451287	451292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_011369	A	6	6	452713	452718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_011369	A	7	7	452803	452809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_011369	AGC	2	6	455140	455145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_011369	AGT	2	6	455710	455715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_011369	CGT	2	6	455845	455850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_011369	CGC	2	6	456877	456882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1055	NC_011369	TCGCT	2	10	456887	456896	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1056	NC_011369	GAT	2	6	458092	458097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_011369	GAC	2	6	458121	458126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_011369	CT	3	6	458138	458143	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1059	NC_011369	ATC	2	6	458186	458191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_011369	TTCG	2	8	459225	459232	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1061	NC_011369	GAA	2	6	459268	459273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_011369	AGA	2	6	459303	459308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_011369	GATG	2	8	459338	459345	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_011369	CGG	2	6	460206	460211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_011369	TTAG	2	8	460263	460270	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_011369	T	6	6	461187	461192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_011369	CGG	2	6	461255	461260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_011369	AGG	2	6	461262	461267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_011369	CGT	2	6	461285	461290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_011369	C	6	6	463977	463982	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1071	NC_011369	G	6	6	464011	464016	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_011369	GTT	2	6	464077	464082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_011369	C	6	6	464111	464116	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1074	NC_011369	G	6	6	464145	464150	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_011369	TCCG	2	8	465990	465997	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1076	NC_011369	A	6	6	466012	466017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_011369	CCG	2	6	466788	466793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1078	NC_011369	T	7	7	466838	466844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_011369	CGGCC	2	10	467604	467613	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1080	NC_011369	GCC	2	6	467639	467644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1081	NC_011369	CGGA	2	8	468429	468436	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1082	NC_011369	CT	3	6	468437	468442	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1083	NC_011369	CCCG	2	8	468493	468500	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1084	NC_011369	CCGG	2	8	468561	468568	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1085	NC_011369	GGCG	2	8	469828	469835	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1086	NC_011369	ATG	2	6	470564	470569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_011369	AAC	2	6	470593	470598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_011369	GACC	2	8	470642	470649	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1089	NC_011369	ATC	2	6	470659	470664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_011369	CGG	2	6	470680	470685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_011369	TCGC	2	8	470693	470700	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1092	NC_011369	GCG	2	6	470751	470756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_011369	CGC	3	9	470768	470776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1094	NC_011369	CAGC	2	8	470802	470809	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1095	NC_011369	CG	3	6	470827	470832	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1096	NC_011369	AAT	2	6	470839	470844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_011369	A	6	6	470846	470851	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_011369	T	6	6	470898	470903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_011369	CG	4	8	472004	472011	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1100	NC_011369	GAC	2	6	472021	472026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_011369	TC	3	6	472042	472047	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1102	NC_011369	TTCC	2	8	472543	472550	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1103	NC_011369	TCTG	2	8	472551	472558	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1104	NC_011369	GCC	2	6	472583	472588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1105	NC_011369	CGG	2	6	472999	473004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_011369	C	6	6	475457	475462	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1107	NC_011369	CTGCC	2	10	475464	475473	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1108	NC_011369	G	6	6	475491	475496	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_011369	ACGC	2	8	475557	475564	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1110	NC_011369	C	6	6	475601	475606	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1111	NC_011369	CGG	2	6	475623	475628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_011369	G	6	6	475635	475640	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_011369	TCAAT	2	10	477531	477540	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1114	NC_011369	CGG	2	6	477543	477548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_011369	GGA	2	6	477563	477568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_011369	CCT	2	6	478060	478065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1117	NC_011369	AACG	2	8	478098	478105	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1118	NC_011369	GTTC	2	8	478112	478119	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1119	NC_011369	AAT	2	6	478120	478125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_011369	TGG	2	6	478971	478976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_011369	CTC	2	6	479449	479454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1122	NC_011369	CGC	2	6	479455	479460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1123	NC_011369	GCA	2	6	479490	479495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_011369	ATG	2	6	479502	479507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_011369	GCG	2	6	479520	479525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_011369	GC	3	6	479546	479551	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1127	NC_011369	TC	3	6	479568	479573	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1128	NC_011369	GGCG	2	8	479584	479591	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1129	NC_011369	AACGGC	2	12	479632	479643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_011369	TCGGA	2	10	479658	479667	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1131	NC_011369	CGG	2	6	479808	479813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_011369	GAC	2	6	479866	479871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_011369	GC	3	6	479885	479890	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1134	NC_011369	GCC	2	6	479936	479941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1135	NC_011369	CTC	2	6	481642	481647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1136	NC_011369	TCGA	2	8	482012	482019	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1137	NC_011369	CGA	2	6	482086	482091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1138	NC_011369	GCC	2	6	482182	482187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1139	NC_011369	GAC	2	6	482207	482212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1140	NC_011369	AGCC	2	8	483151	483158	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1141	NC_011369	CAAA	2	8	484174	484181	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1142	NC_011369	TCGC	2	8	484185	484192	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1143	NC_011369	CGGCC	2	10	484299	484308	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1144	NC_011369	CG	4	8	484312	484319	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1145	NC_011369	GCC	2	6	484407	484412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1147	NC_011369	GCC	2	6	488122	488127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1149	NC_011369	ACC	2	6	488182	488187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1150	NC_011369	CGG	2	6	488263	488268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1152	NC_011369	AGGC	2	8	488799	488806	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1153	NC_011369	ACA	2	6	488809	488814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1170	NC_011369	GCG	2	6	495480	495485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1172	NC_011369	TTCGTC	2	12	495572	495583	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1174	NC_011369	GAAGA	2	10	495598	495607	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1175	NC_011369	CGATG	2	10	495618	495627	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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1191	NC_011369	TGC	2	6	496164	496169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1243	NC_011369	CGTC	2	8	520282	520289	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1244	NC_011369	CG	3	6	520394	520399	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1245	NC_011369	GA	3	6	520412	520417	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1252	NC_011369	TGC	2	6	521792	521797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1255	NC_011369	TCCGCT	2	12	521960	521971	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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1262	NC_011369	GA	3	6	526463	526468	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1263	NC_011369	TTTGA	2	10	527774	527783	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1264	NC_011369	ATT	2	6	527788	527793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1265	NC_011369	GC	3	6	527851	527856	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1266	NC_011369	GAG	2	6	527943	527948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1267	NC_011369	AG	4	8	528335	528342	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1268	NC_011369	AACGAC	2	12	529107	529118	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1269	NC_011369	GTCA	2	8	529130	529137	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1270	NC_011369	CGC	2	6	529140	529145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1271	NC_011369	AAC	2	6	529146	529151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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