MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 chromosome

Total Repeats: 11442

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_011369	GA	3	6	2655813	2655818	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7002	NC_011369	ACGC	2	8	2655827	2655834	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7003	NC_011369	GAA	2	6	2655854	2655859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7004	NC_011369	AGG	2	6	2655885	2655890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7005	NC_011369	TC	3	6	2655895	2655900	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7006	NC_011369	TCA	2	6	2655927	2655932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7007	NC_011369	GC	3	6	2655946	2655951	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7008	NC_011369	T	6	6	2657921	2657926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7009	NC_011369	ACG	2	6	2658013	2658018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7010	NC_011369	ATG	2	6	2658834	2658839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7011	NC_011369	TCG	2	6	2660123	2660128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7012	NC_011369	A	6	6	2660156	2660161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7013	NC_011369	GGA	2	6	2660243	2660248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7014	NC_011369	A	7	7	2661271	2661277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7015	NC_011369	GCAGC	2	10	2661347	2661356	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
7016	NC_011369	GAG	2	6	2661412	2661417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7017	NC_011369	GCTG	2	8	2661502	2661509	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7018	NC_011369	GTA	2	6	2661528	2661533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7019	NC_011369	CCCG	2	8	2661576	2661583	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7020	NC_011369	CGATC	2	10	2663551	2663560	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7021	NC_011369	CAGGC	2	10	2663647	2663656	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
7022	NC_011369	GCT	2	6	2665365	2665370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7023	NC_011369	CGGG	2	8	2665372	2665379	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7024	NC_011369	GCA	2	6	2666267	2666272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7025	NC_011369	AGG	2	6	2666345	2666350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7026	NC_011369	AG	3	6	2667305	2667310	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7027	NC_011369	CGA	2	6	2668280	2668285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7028	NC_011369	TGC	2	6	2671201	2671206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7029	NC_011369	CGA	2	6	2671209	2671214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7030	NC_011369	GGC	2	6	2671586	2671591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7031	NC_011369	TGG	2	6	2671990	2671995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7032	NC_011369	ACG	2	6	2672007	2672012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7033	NC_011369	CAA	2	6	2672028	2672033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7034	NC_011369	CT	3	6	2672956	2672961	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7035	NC_011369	GT	4	8	2673100	2673107	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7036	NC_011369	GCC	2	6	2674556	2674561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7037	NC_011369	CGG	2	6	2674571	2674576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7038	NC_011369	GGAA	2	8	2675312	2675319	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7039	NC_011369	ATCC	2	8	2675373	2675380	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7040	NC_011369	CG	3	6	2675411	2675416	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7041	NC_011369	TCG	2	6	2678096	2678101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7042	NC_011369	AGG	2	6	2678156	2678161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7043	NC_011369	TCT	2	6	2681484	2681489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7044	NC_011369	TAA	2	6	2682285	2682290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7045	NC_011369	AAGAA	2	10	2682300	2682309	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
7046	NC_011369	TTC	2	6	2682310	2682315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7047	NC_011369	AGT	2	6	2682363	2682368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7049	NC_011369	GGAC	2	8	2683346	2683353	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7050	NC_011369	GTCGT	2	10	2683368	2683377	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
7051	NC_011369	CA	3	6	2683441	2683446	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7052	NC_011369	AAC	2	6	2683500	2683505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7053	NC_011369	CGC	2	6	2684629	2684634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7054	NC_011369	ACC	2	6	2687445	2687450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7055	NC_011369	A	6	6	2687468	2687473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7056	NC_011369	GCA	2	6	2688594	2688599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7057	NC_011369	GAA	2	6	2688632	2688637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7058	NC_011369	A	6	6	2688723	2688728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7059	NC_011369	CCT	2	6	2688747	2688752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7060	NC_011369	GC	3	6	2691707	2691712	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7061	NC_011369	GCGCA	2	10	2692697	2692706	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
7062	NC_011369	AG	3	6	2692750	2692755	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7063	NC_011369	CGC	2	6	2692857	2692862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7064	NC_011369	CTC	2	6	2692865	2692870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7065	NC_011369	GCC	2	6	2694227	2694232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7066	NC_011369	GATG	2	8	2694344	2694351	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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7068	NC_011369	GGC	2	6	2694376	2694381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7069	NC_011369	TC	3	6	2694389	2694394	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7070	NC_011369	ATC	2	6	2694396	2694401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7071	NC_011369	GGCTT	2	10	2694416	2694425	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
7072	NC_011369	TGC	2	6	2694426	2694431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7074	NC_011369	A	6	6	2694536	2694541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7075	NC_011369	GATT	2	8	2694572	2694579	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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7078	NC_011369	GTATT	2	10	2694618	2694627	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7079	NC_011369	TC	3	6	2697126	2697131	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7080	NC_011369	AGA	2	6	2697154	2697159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7082	NC_011369	AT	3	6	2701006	2701011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7083	NC_011369	TA	3	6	2701067	2701072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7084	NC_011369	GGA	2	6	2701102	2701107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7087	NC_011369	CTC	2	6	2702907	2702912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7088	NC_011369	TGA	2	6	2702918	2702923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7090	NC_011369	GTGC	2	8	2706118	2706125	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7091	NC_011369	GCGGA	2	10	2706324	2706333	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
7092	NC_011369	TTG	2	6	2707698	2707703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7099	NC_011369	TGC	2	6	2710871	2710876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7101	NC_011369	A	6	6	2711073	2711078	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7102	NC_011369	TTTGT	2	10	2711112	2711121	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
7103	NC_011369	ATAG	2	8	2711400	2711407	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7104	NC_011369	GGCC	2	8	2711662	2711669	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7105	NC_011369	GGAG	2	8	2711711	2711718	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
7106	NC_011369	CAGCC	2	10	2711782	2711791	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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7110	NC_011369	GGAG	2	8	2711936	2711943	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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7114	NC_011369	GAG	2	6	2712056	2712061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7117	NC_011369	CCA	2	6	2712252	2712257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7118	NC_011369	CAA	2	6	2712269	2712274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7119	NC_011369	GAG	2	6	2712289	2712294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7120	NC_011369	GCC	2	6	2712357	2712362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7121	NC_011369	CGCT	2	8	2712363	2712370	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7122	NC_011369	CCT	2	6	2712382	2712387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7123	NC_011369	GGCAC	2	10	2712838	2712847	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
7124	NC_011369	GCC	2	6	2712862	2712867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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7127	NC_011369	GAG	2	6	2713022	2713027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7128	NC_011369	GA	3	6	2713086	2713091	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7129	NC_011369	GC	3	6	2713135	2713140	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7130	NC_011369	GGCAC	2	10	2713148	2713157	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
7131	NC_011369	ATCG	2	8	2713186	2713193	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7132	NC_011369	CCA	2	6	2713221	2713226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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7134	NC_011369	GGA	2	6	2713326	2713331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7396	NC_011369	ATC	2	6	2791559	2791564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7399	NC_011369	TCA	2	6	2792103	2792108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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