MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 chromosome

Total Repeats: 11442

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_011369	CACC	2	8	2438437	2438444	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6502	NC_011369	GGT	2	6	2438454	2438459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6503	NC_011369	TCG	2	6	2438468	2438473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6504	NC_011369	GGC	2	6	2438496	2438501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6505	NC_011369	CGG	3	9	2438514	2438522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6506	NC_011369	GTT	2	6	2438557	2438562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6507	NC_011369	GCC	2	6	2438603	2438608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6508	NC_011369	AG	3	6	2439308	2439313	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6509	NC_011369	TC	3	6	2440378	2440383	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6510	NC_011369	GCA	2	6	2440389	2440394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6511	NC_011369	A	6	6	2440399	2440404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6512	NC_011369	GCT	2	6	2440406	2440411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6513	NC_011369	CA	3	6	2440480	2440485	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6514	NC_011369	TTC	2	6	2440487	2440492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6515	NC_011369	CGT	2	6	2440526	2440531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6516	NC_011369	GGT	2	6	2440536	2440541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6517	NC_011369	GGC	2	6	2440553	2440558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6518	NC_011369	ACG	2	6	2440562	2440567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6519	NC_011369	TTA	2	6	2441201	2441206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6520	NC_011369	TAT	2	6	2441233	2441238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6521	NC_011369	TTC	2	6	2441267	2441272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6522	NC_011369	GTT	2	6	2441283	2441288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_011369	ATCG	2	8	2442835	2442842	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6524	NC_011369	GCA	2	6	2442843	2442848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6525	NC_011369	CGC	3	9	2442892	2442900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6526	NC_011369	TCC	2	6	2442921	2442926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6527	NC_011369	GATAG	2	10	2442998	2443007	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6528	NC_011369	TAA	2	6	2445211	2445216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6529	NC_011369	T	6	6	2446361	2446366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6530	NC_011369	GCC	2	6	2447669	2447674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6531	NC_011369	TAT	2	6	2447750	2447755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6532	NC_011369	GCC	2	6	2447856	2447861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6533	NC_011369	CTT	2	6	2447983	2447988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6534	NC_011369	GGC	2	6	2448034	2448039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6535	NC_011369	GCC	2	6	2448044	2448049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6536	NC_011369	CTC	2	6	2448050	2448055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6537	NC_011369	CCA	2	6	2448060	2448065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6538	NC_011369	TTAAA	2	10	2448459	2448468	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6539	NC_011369	TTAGA	2	10	2448512	2448521	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6540	NC_011369	CGG	2	6	2448564	2448569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6541	NC_011369	CG	3	6	2448636	2448641	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6542	NC_011369	CGT	2	6	2448669	2448674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6543	NC_011369	ATG	2	6	2448691	2448696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6544	NC_011369	GAC	2	6	2449144	2449149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6545	NC_011369	GCA	2	6	2450605	2450610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6546	NC_011369	A	6	6	2450629	2450634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6547	NC_011369	TCC	2	6	2452885	2452890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6548	NC_011369	TTC	2	6	2452915	2452920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6549	NC_011369	GAT	2	6	2452938	2452943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6550	NC_011369	CCG	2	6	2452979	2452984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6551	NC_011369	GCC	3	9	2453035	2453043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6552	NC_011369	ATT	2	6	2453105	2453110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6553	NC_011369	CTG	2	6	2453452	2453457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6554	NC_011369	CG	3	6	2453501	2453506	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6555	NC_011369	T	6	6	2453635	2453640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6556	NC_011369	CAG	2	6	2453663	2453668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6557	NC_011369	CGA	2	6	2454390	2454395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6558	NC_011369	GCC	2	6	2454405	2454410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6559	NC_011369	AAT	2	6	2454458	2454463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6560	NC_011369	TGG	2	6	2454483	2454488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6561	NC_011369	AATC	2	8	2454548	2454555	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6562	NC_011369	TCG	2	6	2454649	2454654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6563	NC_011369	AG	3	6	2455358	2455363	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6564	NC_011369	TGG	3	9	2455424	2455432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6565	NC_011369	CGAG	2	8	2455481	2455488	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6566	NC_011369	TCA	2	6	2456555	2456560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6567	NC_011369	ATT	2	6	2456593	2456598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6568	NC_011369	ATA	2	6	2456620	2456625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6569	NC_011369	GCC	2	6	2456643	2456648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6570	NC_011369	AGC	2	6	2456687	2456692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6571	NC_011369	CCT	2	6	2456775	2456780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6572	NC_011369	GGC	2	6	2456855	2456860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6573	NC_011369	CA	3	6	2457511	2457516	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6574	NC_011369	CTG	2	6	2457599	2457604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6575	NC_011369	ACG	2	6	2457707	2457712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6576	NC_011369	CCGTA	2	10	2457718	2457727	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6577	NC_011369	GCC	2	6	2457744	2457749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6578	NC_011369	CGA	2	6	2457765	2457770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6579	NC_011369	CA	3	6	2458328	2458333	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6580	NC_011369	CAG	2	6	2458372	2458377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6581	NC_011369	AGC	3	9	2459465	2459473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6582	NC_011369	GGC	2	6	2459474	2459479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6583	NC_011369	CAGG	2	8	2459500	2459507	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6584	NC_011369	ACGG	2	8	2459587	2459594	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6585	NC_011369	CGGG	2	8	2459647	2459654	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6586	NC_011369	GCCC	2	8	2459676	2459683	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6587	NC_011369	GCT	2	6	2459706	2459711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6588	NC_011369	GCT	2	6	2459820	2459825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6589	NC_011369	CG	3	6	2459838	2459843	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6590	NC_011369	AGC	2	6	2459858	2459863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6591	NC_011369	TGG	2	6	2459907	2459912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6593	NC_011369	GCC	2	6	2460093	2460098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6594	NC_011369	CGC	2	6	2460220	2460225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6595	NC_011369	GAA	2	6	2460238	2460243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6596	NC_011369	CGA	2	6	2460252	2460257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6597	NC_011369	ATT	2	6	2460264	2460269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6598	NC_011369	TAA	2	6	2460276	2460281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6599	NC_011369	CGT	2	6	2460305	2460310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6600	NC_011369	ACC	2	6	2460331	2460336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6601	NC_011369	CCG	2	6	2460459	2460464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6602	NC_011369	TCG	2	6	2460491	2460496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6603	NC_011369	CTGT	2	8	2460510	2460517	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6604	NC_011369	CG	3	6	2460549	2460554	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6605	NC_011369	CTGCC	2	10	2460645	2460654	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6606	NC_011369	CGG	2	6	2460656	2460661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6607	NC_011369	T	8	8	2460665	2460672	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6608	NC_011369	TAG	2	6	2460678	2460683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6609	NC_011369	GAGG	2	8	2460721	2460728	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6610	NC_011369	CAG	2	6	2460753	2460758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6611	NC_011369	GAC	2	6	2460761	2460766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6612	NC_011369	GCG	2	6	2460852	2460857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6613	NC_011369	GGCG	2	8	2460924	2460931	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6614	NC_011369	GGAC	2	8	2460947	2460954	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6615	NC_011369	ATA	2	6	2461523	2461528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6616	NC_011369	CCTTGC	2	12	2461625	2461636	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6617	NC_011369	TCG	2	6	2461671	2461676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6618	NC_011369	TGC	2	6	2461695	2461700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6619	NC_011369	TCGA	2	8	2461712	2461719	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6620	NC_011369	AGC	2	6	2461818	2461823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6621	NC_011369	GGC	2	6	2462966	2462971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6622	NC_011369	AGG	2	6	2463050	2463055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6623	NC_011369	GGC	2	6	2463341	2463346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6624	NC_011369	CCG	2	6	2463389	2463394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6625	NC_011369	CTC	2	6	2464289	2464294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6626	NC_011369	AAG	2	6	2464319	2464324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6627	NC_011369	CCG	2	6	2464325	2464330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6628	NC_011369	CAA	2	6	2464334	2464339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6630	NC_011369	TTTC	2	8	2474000	2474007	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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