MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 chromosome

Total Repeats: 11442

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_011369	AT	3	6	1747393	1747398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_011369	CGT	2	6	1748059	1748064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4503	NC_011369	TCG	2	6	1748921	1748926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4504	NC_011369	CATTC	2	10	1748979	1748988	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4505	NC_011369	TGT	2	6	1749062	1749067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_011369	GCG	2	6	1749108	1749113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4507	NC_011369	ACA	2	6	1749153	1749158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4508	NC_011369	CAG	2	6	1750996	1751001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4509	NC_011369	GCC	2	6	1755732	1755737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4510	NC_011369	T	7	7	1755778	1755784	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_011369	GCTGC	2	10	1755785	1755794	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4512	NC_011369	T	6	6	1755833	1755838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_011369	GGA	2	6	1755865	1755870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_011369	ATG	2	6	1756890	1756895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_011369	CAT	2	6	1756928	1756933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4516	NC_011369	GCC	2	6	1756955	1756960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4517	NC_011369	CGCGG	2	10	1756980	1756989	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4518	NC_011369	GCG	2	6	1761337	1761342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4519	NC_011369	GC	3	6	1761359	1761364	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4520	NC_011369	CCGCG	2	10	1761389	1761398	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4521	NC_011369	CAA	2	6	1761446	1761451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4522	NC_011369	GCC	2	6	1761453	1761458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4523	NC_011369	CGG	2	6	1762863	1762868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4524	NC_011369	CCG	2	6	1762882	1762887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4525	NC_011369	TGAT	2	8	1762891	1762898	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_011369	GAA	2	6	1762992	1762997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_011369	AGA	2	6	1763001	1763006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_011369	CGG	2	6	1764936	1764941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4529	NC_011369	TCA	2	6	1764991	1764996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4530	NC_011369	GC	3	6	1765726	1765731	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4531	NC_011369	GC	3	6	1765736	1765741	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4532	NC_011369	CGT	2	6	1772239	1772244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4533	NC_011369	CG	3	6	1772972	1772977	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4534	NC_011369	GCT	2	6	1772983	1772988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4535	NC_011369	GCG	2	6	1774871	1774876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4536	NC_011369	CGA	2	6	1774892	1774897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4537	NC_011369	T	7	7	1774991	1774997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_011369	GGTG	2	8	1775002	1775009	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_011369	GGC	2	6	1775030	1775035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4540	NC_011369	CTG	2	6	1775746	1775751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4541	NC_011369	T	6	6	1775785	1775790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_011369	CGGT	2	8	1775990	1775997	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4543	NC_011369	GGC	2	6	1775998	1776003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4544	NC_011369	AAAAG	2	10	1776090	1776099	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_011369	GAGGC	2	10	1776112	1776121	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4546	NC_011369	TCA	2	6	1776492	1776497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4547	NC_011369	TCC	2	6	1776564	1776569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4548	NC_011369	TCC	2	6	1778055	1778060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4549	NC_011369	GC	3	6	1778106	1778111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4550	NC_011369	TC	3	6	1778473	1778478	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4551	NC_011369	ATG	2	6	1778520	1778525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_011369	A	7	7	1778559	1778565	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_011369	CCG	2	6	1778585	1778590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4554	NC_011369	A	6	6	1778674	1778679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_011369	TTCTT	2	10	1778748	1778757	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4556	NC_011369	GTT	2	6	1778772	1778777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_011369	T	6	6	1778776	1778781	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_011369	CGGT	2	8	1780282	1780289	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4559	NC_011369	GTC	2	6	1781125	1781130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4560	NC_011369	GATG	2	8	1784677	1784684	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_011369	GCG	2	6	1784688	1784693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4562	NC_011369	GCC	2	6	1784722	1784727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4563	NC_011369	CGG	2	6	1784737	1784742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4564	NC_011369	CGC	2	6	1784774	1784779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4565	NC_011369	GGCA	2	8	1784790	1784797	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4566	NC_011369	ATG	2	6	1785354	1785359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_011369	GCG	2	6	1786110	1786115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4568	NC_011369	CGG	2	6	1786139	1786144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4569	NC_011369	CGG	2	6	1786149	1786154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4570	NC_011369	CG	3	6	1786171	1786176	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4571	NC_011369	AGA	2	6	1786279	1786284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_011369	GGC	2	6	1789137	1789142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4573	NC_011369	GCC	2	6	1789148	1789153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4574	NC_011369	CTTTT	2	10	1789154	1789163	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4575	NC_011369	AGG	2	6	1789286	1789291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_011369	AAGG	2	8	1789307	1789314	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_011369	TCCT	2	8	1789648	1789655	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4578	NC_011369	TGAA	2	8	1789684	1789691	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_011369	CCG	2	6	1789713	1789718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4580	NC_011369	CCT	2	6	1789755	1789760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4581	NC_011369	CCG	2	6	1790063	1790068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4582	NC_011369	GAT	2	6	1790082	1790087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_011369	GCA	2	6	1790125	1790130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4584	NC_011369	CGC	2	6	1790734	1790739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4585	NC_011369	GA	3	6	1791330	1791335	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_011369	CTG	2	6	1791872	1791877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4587	NC_011369	CTG	2	6	1795303	1795308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4588	NC_011369	TAGT	2	8	1795339	1795346	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_011369	ATAGA	2	10	1795861	1795870	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_011369	T	6	6	1795882	1795887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_011369	CAG	2	6	1797705	1797710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4592	NC_011369	ATC	2	6	1797716	1797721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4593	NC_011369	GGA	2	6	1797737	1797742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_011369	TTC	2	6	1798311	1798316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4595	NC_011369	CCTG	2	8	1798318	1798325	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4596	NC_011369	CGC	2	6	1798394	1798399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4597	NC_011369	TGA	2	6	1802639	1802644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_011369	TCC	2	6	1803735	1803740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4599	NC_011369	TTGC	2	8	1803743	1803750	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4600	NC_011369	GGGT	2	8	1803761	1803768	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_011369	CAGC	2	8	1804907	1804914	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4602	NC_011369	GAA	2	6	1804942	1804947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_011369	CCG	2	6	1804965	1804970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4604	NC_011369	ACG	2	6	1804977	1804982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4605	NC_011369	CATT	2	8	1804986	1804993	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4606	NC_011369	TCA	3	9	1805010	1805018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4607	NC_011369	GGC	3	9	1805036	1805044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4608	NC_011369	G	6	6	1805059	1805064	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_011369	AGG	2	6	1807928	1807933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_011369	CCA	2	6	1807936	1807941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4611	NC_011369	TGA	2	6	1808250	1808255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_011369	GGA	2	6	1808267	1808272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_011369	GCGAT	2	10	1808282	1808291	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4614	NC_011369	GTG	2	6	1808319	1808324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_011369	CGC	2	6	1808333	1808338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4616	NC_011369	GCG	2	6	1808345	1808350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4617	NC_011369	TGAAG	2	10	1808383	1808392	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_011369	TGCC	2	8	1808431	1808438	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4619	NC_011369	GA	3	6	1808460	1808465	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_011369	GCG	2	6	1808562	1808567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4621	NC_011369	AGC	3	9	1808583	1808591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4622	NC_011369	GTC	2	6	1808594	1808599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4623	NC_011369	CGC	2	6	1808600	1808605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4624	NC_011369	GGA	2	6	1808606	1808611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4625	NC_011369	AAT	2	6	1808639	1808644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_011369	AT	3	6	1808708	1808713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_011369	TGC	2	6	1808721	1808726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4628	NC_011369	TGG	2	6	1808750	1808755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_011369	TGT	2	6	1808786	1808791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4630	NC_011369	TTGC	2	8	1808844	1808851	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4631	NC_011369	GCC	2	6	1808865	1808870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4632	NC_011369	GGC	2	6	1808884	1808889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4633	NC_011369	TCC	2	6	1809197	1809202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4634	NC_011369	GCG	2	6	1809203	1809208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4635	NC_011369	ATT	2	6	1809257	1809262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4639	NC_011369	AG	3	6	1809933	1809938	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4643	NC_011369	AGG	2	6	1816168	1816173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4644	NC_011369	CA	3	6	1816240	1816245	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4645	NC_011369	CGT	2	6	1819190	1819195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4647	NC_011369	GCG	2	6	1820554	1820559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4651	NC_011369	AAAG	2	8	1827719	1827726	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4652	NC_011369	GTGA	2	8	1827739	1827746	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4653	NC_011369	AAT	2	6	1828663	1828668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4654	NC_011369	CGAA	2	8	1828672	1828679	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4655	NC_011369	ACT	2	6	1828682	1828687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4657	NC_011369	CT	3	6	1829417	1829422	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4658	NC_011369	AGG	2	6	1829436	1829441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4664	NC_011369	CAG	2	6	1832874	1832879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4665	NC_011369	CGCC	2	8	1832884	1832891	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4666	NC_011369	GCG	2	6	1832990	1832995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4667	NC_011369	CAT	2	6	1833021	1833026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4669	NC_011369	CTGG	2	8	1835472	1835479	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4670	NC_011369	TGG	2	6	1835556	1835561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4672	NC_011369	CGG	2	6	1835680	1835685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4677	NC_011369	TCATC	2	10	1835864	1835873	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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4688	NC_011369	CTG	2	6	1837767	1837772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4692	NC_011369	GTCA	2	8	1841504	1841511	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4693	NC_011369	TGT	2	6	1841528	1841533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4714	NC_011369	CAT	2	6	1848167	1848172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4727	NC_011369	ACGA	2	8	1856829	1856836	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4728	NC_011369	GCCCT	2	10	1856900	1856909	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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4730	NC_011369	CGC	2	6	1857006	1857011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4734	NC_011369	GACT	2	8	1858709	1858716	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4743	NC_011369	ATC	2	6	1859306	1859311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4744	NC_011369	ATG	2	6	1859318	1859323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4746	NC_011369	GCA	2	6	1861011	1861016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4748	NC_011369	CCCG	2	8	1862019	1862026	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4749	NC_011369	ATC	2	6	1862029	1862034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4750	NC_011369	TGC	2	6	1863161	1863166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4751	NC_011369	CGC	2	6	1863190	1863195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4752	NC_011369	GC	3	6	1864106	1864111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4753	NC_011369	GCT	2	6	1864365	1864370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4754	NC_011369	TTA	2	6	1864428	1864433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4755	NC_011369	T	6	6	1864498	1864503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4756	NC_011369	CTT	2	6	1864531	1864536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4757	NC_011369	GAT	2	6	1864738	1864743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4758	NC_011369	AATC	2	8	1864758	1864765	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4760	NC_011369	TCG	2	6	1864892	1864897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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