MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 plasmid pRLG201

Total Repeats: 3648

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011368	TTC	2	6	379405	379410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_011368	TTG	2	6	379423	379428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_011368	CG	3	6	379430	379435	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1004	NC_011368	CCA	2	6	379481	379486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1005	NC_011368	CCG	2	6	379525	379530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1006	NC_011368	GGC	2	6	379535	379540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_011368	GTAG	2	8	379689	379696	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_011368	GCG	2	6	379703	379708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_011368	TGC	2	6	380860	380865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_011368	G	6	6	380923	380928	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_011368	TCG	2	6	381103	381108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_011368	CCG	2	6	383192	383197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1013	NC_011368	ACGAA	2	10	383200	383209	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1014	NC_011368	GCG	2	6	383335	383340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_011368	CCG	2	6	383372	383377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1016	NC_011368	CG	3	6	383456	383461	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1017	NC_011368	CGC	2	6	383582	383587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1018	NC_011368	TCG	2	6	383690	383695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_011368	CG	3	6	383764	383769	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1020	NC_011368	AGCC	2	8	383796	383803	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1021	NC_011368	CCG	2	6	383851	383856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1022	NC_011368	GCC	2	6	383861	383866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1023	NC_011368	TCG	2	6	383868	383873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_011368	CGTC	2	8	383964	383971	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1025	NC_011368	CGG	2	6	385949	385954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_011368	T	7	7	386877	386883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_011368	GAA	2	6	386895	386900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_011368	CTT	2	6	388301	388306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_011368	AAG	2	6	390192	390197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_011368	GCC	2	6	395509	395514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1031	NC_011368	CGT	2	6	396622	396627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_011368	ACCT	2	8	396696	396703	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1033	NC_011368	CACCG	2	10	396725	396734	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1034	NC_011368	GAG	2	6	396814	396819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_011368	ACGTC	2	10	396831	396840	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1036	NC_011368	ACT	2	6	396855	396860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_011368	GCG	2	6	396864	396869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_011368	ATT	2	6	396893	396898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_011368	CGG	2	6	396977	396982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_011368	GAT	2	6	396984	396989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_011368	CGC	3	9	397015	397023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1042	NC_011368	CGG	2	6	397071	397076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_011368	TCC	2	6	397145	397150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1044	NC_011368	GCC	2	6	397186	397191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1045	NC_011368	ACG	2	6	397277	397282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_011368	TCA	2	6	397310	397315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_011368	GGC	2	6	397488	397493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_011368	AC	3	6	397522	397527	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1049	NC_011368	CGG	2	6	397874	397879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_011368	CAA	2	6	399519	399524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_011368	CGG	2	6	399551	399556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_011368	GA	3	6	399574	399579	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_011368	GTC	2	6	399581	399586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_011368	CGG	2	6	399588	399593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_011368	CGC	2	6	399596	399601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1056	NC_011368	CTC	2	6	399619	399624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1057	NC_011368	GCA	2	6	399713	399718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_011368	GCG	2	6	399743	399748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_011368	CG	3	6	399747	399752	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1060	NC_011368	CGG	2	6	399755	399760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_011368	CGA	2	6	399776	399781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_011368	CGC	3	9	399799	399807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1063	NC_011368	GCG	2	6	399833	399838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_011368	TCG	2	6	399860	399865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_011368	CGGCT	2	10	399893	399902	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1066	NC_011368	CCG	2	6	399907	399912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1067	NC_011368	ACG	2	6	399962	399967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_011368	CGG	2	6	399982	399987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_011368	ATCG	2	8	400031	400038	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1070	NC_011368	AGT	2	6	400048	400053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_011368	GAC	2	6	400058	400063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_011368	CGA	2	6	400203	400208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_011368	AAG	2	6	400234	400239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_011368	CGG	2	6	400307	400312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_011368	GCC	2	6	400343	400348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1076	NC_011368	TGG	2	6	400353	400358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_011368	GCC	2	6	400362	400367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1078	NC_011368	CAG	2	6	401319	401324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_011368	TA	3	6	401389	401394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_011368	ACG	2	6	401428	401433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_011368	ACCA	2	8	401464	401471	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1082	NC_011368	CGC	2	6	403821	403826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1083	NC_011368	GTG	2	6	406463	406468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_011368	ATC	2	6	406475	406480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_011368	ATC	2	6	406482	406487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_011368	ATC	2	6	406566	406571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_011368	CGT	2	6	406574	406579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_011368	CGAT	2	8	406585	406592	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1089	NC_011368	TGA	2	6	406638	406643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_011368	AAG	2	6	406647	406652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_011368	AAACC	2	10	406740	406749	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
1092	NC_011368	CGC	2	6	406764	406769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1093	NC_011368	GTCCA	2	10	406896	406905	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1094	NC_011368	ATG	2	6	406935	406940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_011368	GCA	2	6	409504	409509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_011368	GGC	2	6	409602	409607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_011368	GATT	2	8	409675	409682	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_011368	CCT	2	6	409688	409693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1099	NC_011368	GA	3	6	409703	409708	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_011368	AGG	2	6	409716	409721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_011368	AGGC	2	8	409735	409742	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1102	NC_011368	CCGA	2	8	409783	409790	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1103	NC_011368	CCG	2	6	409819	409824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1104	NC_011368	AGC	2	6	409912	409917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_011368	GCC	2	6	409982	409987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_011368	GTCT	2	8	414040	414047	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1107	NC_011368	GTC	2	6	414074	414079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_011368	GGA	2	6	414092	414097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_011368	GCA	2	6	414124	414129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_011368	GCG	2	6	414134	414139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_011368	TCC	2	6	415275	415280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1112	NC_011368	TCC	2	6	416133	416138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1113	NC_011368	AAC	2	6	416159	416164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_011368	AT	4	8	416189	416196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_011368	TGT	2	6	416240	416245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_011368	CGA	2	6	416281	416286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_011368	AAGG	2	8	416294	416301	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_011368	GAC	2	6	418701	418706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_011368	CAG	2	6	418760	418765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_011368	ACGA	2	8	418800	418807	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1121	NC_011368	GGGGC	2	10	418917	418926	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1122	NC_011368	GGCA	2	8	418927	418934	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1123	NC_011368	CTT	2	6	418936	418941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_011368	CGA	2	6	418957	418962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_011368	CTG	2	6	418988	418993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_011368	GCT	2	6	419066	419071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_011368	AAG	2	6	419080	419085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_011368	AGC	2	6	419090	419095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_011368	CCT	2	6	419141	419146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1130	NC_011368	CGA	2	6	419196	419201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_011368	GGCC	2	8	419203	419210	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1132	NC_011368	TTC	2	6	419212	419217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_011368	GTC	2	6	419266	419271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_011368	CGC	2	6	419350	419355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1261	NC_011368	GCG	2	6	492397	492402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1393	NC_011368	CGGGA	2	10	532462	532471	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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1396	NC_011368	GTCG	2	8	534445	534452	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1397	NC_011368	CG	3	6	534451	534456	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1398	NC_011368	CTG	2	6	534469	534474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1399	NC_011368	CCG	3	9	534475	534483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1400	NC_011368	AGCT	2	8	534534	534541	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1401	NC_011368	CTG	2	6	535535	535540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1402	NC_011368	TTCAC	2	10	535544	535553	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1403	NC_011368	CGG	2	6	537008	537013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1404	NC_011368	ACG	2	6	537014	537019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1405	NC_011368	AAGCGG	2	12	537089	537100	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1406	NC_011368	CTGC	2	8	537759	537766	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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1410	NC_011368	CCG	2	6	540265	540270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1411	NC_011368	CG	3	6	540276	540281	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1412	NC_011368	ATC	2	6	540287	540292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1421	NC_011368	GTC	2	6	548877	548882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1423	NC_011368	GCA	2	6	548942	548947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1424	NC_011368	GCC	2	6	549148	549153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1425	NC_011368	TGA	2	6	549163	549168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1429	NC_011368	GTAT	2	8	549384	549391	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1430	NC_011368	GATG	2	8	549417	549424	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1431	NC_011368	GGCTT	2	10	549429	549438	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1432	NC_011368	CAT	2	6	549452	549457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1433	NC_011368	ATC	2	6	549472	549477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1435	NC_011368	CGC	2	6	549604	549609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1437	NC_011368	GCCCG	2	10	549802	549811	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1438	NC_011368	TGT	2	6	549812	549817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1439	NC_011368	AAG	2	6	549833	549838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1440	NC_011368	GCG	2	6	549864	549869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1441	NC_011368	GCC	2	6	549925	549930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1442	NC_011368	TTC	2	6	551912	551917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1443	NC_011368	TGTCG	2	10	553021	553030	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1444	NC_011368	GCCC	2	8	553047	553054	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1445	NC_011368	CG	3	6	556696	556701	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1448	NC_011368	CGG	2	6	557338	557343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1450	NC_011368	AGG	2	6	561891	561896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1451	NC_011368	GCGCC	2	10	562495	562504	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1452	NC_011368	CAA	2	6	562617	562622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1453	NC_011368	CTG	2	6	562657	562662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1454	NC_011368	CTG	2	6	562804	562809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1457	NC_011368	GCT	2	6	563196	563201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1481	NC_011368	AGAGGA	2	12	564261	564272	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1482	NC_011368	GGGAA	2	10	564273	564282	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
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1486	NC_011368	CGGG	2	8	568554	568561	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1487	NC_011368	GGC	2	6	568583	568588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1496	NC_011368	TCG	2	6	570605	570610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1498	NC_011368	TCA	3	9	570656	570664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1499	NC_011368	GCG	2	6	570687	570692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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