MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 plasmid pRLG202

Total Repeats: 116

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011366	GA	3	6	1337	1342	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011366	AG	3	6	1565	1570	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011366	AG	3	6	1787	1792	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011366	GC	3	6	2585	2590	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_011366	GA	3	6	15526	15531	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011366	CG	3	6	15897	15902	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_011366	GA	3	6	18931	18936	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011366	TA	3	6	32406	32411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011366	CG	3	6	39350	39355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_011366	GA	4	8	39408	39415	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011366	CG	3	6	41305	41310	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_011366	CG	4	8	49235	49242	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_011366	TA	3	6	50369	50374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011366	CG	3	6	52855	52860	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_011366	GA	3	6	57079	57084	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011366	GC	4	8	58678	58685	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_011366	GC	3	6	59980	59985	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_011366	GC	3	6	67676	67681	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_011366	GA	3	6	68442	68447	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011366	AG	3	6	85740	85745	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011366	GT	3	6	90201	90206	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011366	GA	3	6	112102	112107	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011366	AG	3	6	118277	118282	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011366	CT	3	6	118844	118849	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_011366	GC	3	6	119531	119536	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_011366	CG	3	6	119635	119640	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_011366	TC	3	6	122026	122031	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_011366	GC	3	6	122100	122105	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_011366	CG	3	6	122171	122176	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_011366	TC	3	6	124435	124440	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_011366	AG	3	6	126416	126421	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011366	GC	3	6	132143	132148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_011366	CG	3	6	133611	133616	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_011366	CG	3	6	138016	138021	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_011366	CG	3	6	138034	138039	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_011366	GC	3	6	146207	146212	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_011366	GA	3	6	147586	147591	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011366	CA	3	6	154235	154240	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_011366	CG	3	6	155412	155417	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_011366	TC	4	8	158142	158149	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_011366	GC	3	6	169525	169530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_011366	CT	3	6	171249	171254	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_011366	GC	3	6	171361	171366	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_011366	GA	3	6	182451	182456	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011366	TC	3	6	186528	186533	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_011366	GA	3	6	186603	186608	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011366	AT	3	6	189189	189194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011366	GC	3	6	190758	190763	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_011366	TC	3	6	190766	190771	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_011366	AC	3	6	203564	203569	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_011366	GA	3	6	203623	203628	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011366	CG	3	6	203990	203995	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_011366	TC	3	6	205756	205761	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_011366	GC	3	6	213616	213621	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_011366	GC	3	6	213631	213636	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_011366	AT	3	6	214641	214646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011366	GC	3	6	218816	218821	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_011366	TC	3	6	235072	235077	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_011366	GC	3	6	239117	239122	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_011366	AG	3	6	244218	244223	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011366	GC	3	6	244358	244363	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_011366	GA	3	6	244943	244948	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011366	AC	3	6	245111	245116	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_011366	GA	3	6	245140	245145	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011366	GA	3	6	264458	264463	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011366	AT	3	6	274412	274417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011366	AC	3	6	276770	276775	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_011366	GT	3	6	276876	276881	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011366	CT	3	6	279479	279484	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_011366	GC	3	6	287244	287249	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_011366	AG	3	6	288674	288679	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011366	TC	3	6	288760	288765	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_011366	CG	3	6	288865	288870	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_011366	GC	3	6	290100	290105	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_011366	TG	3	6	290187	290192	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011366	GC	3	6	291543	291548	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_011366	AT	3	6	294825	294830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011366	AG	3	6	303642	303647	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011366	GC	3	6	307486	307491	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_011366	GA	3	6	309579	309584	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011366	TG	3	6	312148	312153	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011366	GA	3	6	318553	318558	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011366	GC	3	6	318661	318666	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_011366	CA	5	10	318842	318851	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_011366	CG	3	6	324203	324208	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_011366	CG	3	6	324212	324217	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_011366	CG	3	6	330116	330121	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_011366	GC	3	6	343965	343970	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_011366	TA	3	6	344000	344005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011366	CG	3	6	350913	350918	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_011366	TA	3	6	351862	351867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011366	AG	4	8	354244	354251	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011366	AT	3	6	369020	369025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011366	CG	3	6	369241	369246	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_011366	GC	3	6	376355	376360	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_011366	GC	3	6	378394	378399	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_011366	GC	3	6	378483	378488	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_011366	GA	3	6	383281	383286	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011366	AT	3	6	402755	402760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011366	GT	3	6	412743	412748	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011366	TC	4	8	413632	413639	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_011366	GC	3	6	413683	413688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_011366	CA	3	6	413837	413842	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_011366	CG	3	6	413882	413887	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_011366	CG	3	6	423302	423307	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_011366	GC	3	6	426244	426249	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_011366	CG	3	6	433911	433916	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_011366	GA	3	6	456480	456485	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011366	TC	3	6	456549	456554	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_011366	AT	3	6	459252	459257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011366	GC	3	6	464828	464833	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_011366	GC	3	6	471893	471898	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_011366	GC	3	6	471957	471962	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_011366	CG	4	8	481317	481324	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_011366	GC	3	6	493949	493954	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_011366	TG	3	6	498651	498656	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.