MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 375

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011004	G	6	6	47703	47708	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011004	G	6	6	58899	58904	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011004	G	6	6	92033	92038	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011004	C	6	6	119675	119680	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5	NC_011004	T	6	6	131545	131550	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011004	C	6	6	167520	167525	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7	NC_011004	A	6	6	168178	168183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011004	C	6	6	170985	170990	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9	NC_011004	A	6	6	189786	189791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011004	A	6	6	213395	213400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011004	A	8	8	213773	213780	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011004	G	7	7	214070	214076	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011004	C	6	6	217046	217051	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14	NC_011004	T	6	6	217119	217124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011004	T	6	6	230451	230456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011004	A	6	6	240487	240492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011004	A	6	6	259174	259179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011004	T	6	6	278906	278911	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011004	T	7	7	288019	288025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011004	G	6	6	294679	294684	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011004	G	6	6	307727	307732	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011004	C	6	6	313950	313955	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
23	NC_011004	C	6	6	326335	326340	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
24	NC_011004	C	6	6	329505	329510	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
25	NC_011004	G	7	7	351205	351211	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011004	C	7	7	354402	354408	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
27	NC_011004	G	6	6	362739	362744	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011004	C	6	6	371240	371245	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
29	NC_011004	G	6	6	417320	417325	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011004	T	6	6	421484	421489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011004	A	6	6	442721	442726	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011004	T	6	6	442975	442980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011004	A	6	6	458778	458783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011004	A	6	6	479181	479186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011004	T	6	6	479257	479262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011004	A	6	6	488767	488772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011004	A	6	6	581552	581557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011004	G	6	6	620073	620078	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011004	T	6	6	655895	655900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011004	A	6	6	666982	666987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011004	A	6	6	714430	714435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011004	C	9	9	714609	714617	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
43	NC_011004	A	6	6	741848	741853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011004	G	6	6	789181	789186	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011004	T	7	7	836868	836874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011004	T	7	7	840109	840115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011004	T	6	6	881101	881106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011004	G	7	7	881360	881366	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011004	C	6	6	946533	946538	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
50	NC_011004	C	7	7	985096	985102	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
51	NC_011004	T	6	6	986173	986178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011004	A	6	6	997833	997838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011004	T	8	8	998121	998128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011004	A	6	6	998688	998693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011004	G	12	12	1029334	1029345	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011004	A	6	6	1034738	1034743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011004	G	6	6	1036649	1036654	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011004	T	6	6	1040444	1040449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011004	T	6	6	1040591	1040596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011004	T	7	7	1040798	1040804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011004	G	6	6	1043234	1043239	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011004	T	6	6	1052584	1052589	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011004	A	6	6	1056560	1056565	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011004	T	6	6	1069712	1069717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011004	G	6	6	1074774	1074779	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011004	T	6	6	1090349	1090354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011004	G	6	6	1094148	1094153	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011004	C	7	7	1128563	1128569	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
69	NC_011004	T	6	6	1154451	1154456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011004	C	6	6	1155815	1155820	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
71	NC_011004	T	6	6	1162906	1162911	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011004	G	6	6	1163151	1163156	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011004	A	6	6	1170210	1170215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011004	T	6	6	1174347	1174352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011004	T	7	7	1174369	1174375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011004	A	6	6	1205758	1205763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011004	T	6	6	1214046	1214051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011004	A	6	6	1215073	1215078	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011004	A	6	6	1219201	1219206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011004	G	6	6	1221109	1221114	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011004	T	6	6	1261610	1261615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011004	A	6	6	1299539	1299544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011004	G	6	6	1303295	1303300	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011004	G	6	6	1332020	1332025	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011004	G	6	6	1360772	1360777	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011004	C	6	6	1361971	1361976	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
87	NC_011004	C	6	6	1361984	1361989	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
88	NC_011004	T	6	6	1372876	1372881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011004	T	6	6	1387029	1387034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011004	T	6	6	1388244	1388249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011004	C	6	6	1394448	1394453	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
92	NC_011004	T	6	6	1394682	1394687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011004	G	6	6	1395788	1395793	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011004	G	6	6	1395917	1395922	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011004	A	6	6	1398035	1398040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011004	C	6	6	1418043	1418048	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
97	NC_011004	T	6	6	1460547	1460552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011004	A	6	6	1463803	1463808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011004	G	6	6	1495977	1495982	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011004	C	6	6	1516707	1516712	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
101	NC_011004	G	9	9	1564823	1564831	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011004	A	6	6	1566950	1566955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011004	T	6	6	1568747	1568752	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011004	C	6	6	1587459	1587464	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
105	NC_011004	A	7	7	1595123	1595129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011004	C	6	6	1687518	1687523	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
107	NC_011004	G	6	6	1704949	1704954	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011004	G	6	6	1707783	1707788	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011004	A	6	6	1708862	1708867	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011004	A	6	6	1781684	1781689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011004	A	7	7	1802059	1802065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011004	G	7	7	1803641	1803647	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011004	C	6	6	1814583	1814588	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
114	NC_011004	T	6	6	1822699	1822704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011004	G	6	6	1870228	1870233	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011004	C	6	6	1870273	1870278	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
117	NC_011004	C	10	10	1890670	1890679	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
118	NC_011004	G	7	7	1898272	1898278	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011004	T	6	6	1899588	1899593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011004	T	6	6	1917017	1917022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011004	G	7	7	1937141	1937147	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011004	C	6	6	1944589	1944594	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
123	NC_011004	A	6	6	1956912	1956917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011004	G	6	6	1960067	1960072	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011004	G	6	6	1961763	1961768	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011004	C	6	6	1968322	1968327	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
127	NC_011004	G	6	6	1987212	1987217	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011004	C	6	6	1991389	1991394	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
129	NC_011004	T	6	6	2047534	2047539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011004	T	6	6	2117858	2117863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011004	G	6	6	2138805	2138810	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011004	G	6	6	2148150	2148155	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011004	A	6	6	2169261	2169266	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011004	G	7	7	2185718	2185724	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011004	A	6	6	2195831	2195836	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011004	C	6	6	2195975	2195980	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
137	NC_011004	T	6	6	2196166	2196171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011004	G	7	7	2199438	2199444	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011004	A	7	7	2207587	2207593	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011004	A	7	7	2232412	2232418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011004	T	6	6	2269110	2269115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011004	C	6	6	2311602	2311607	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
143	NC_011004	T	6	6	2320102	2320107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011004	T	6	6	2326668	2326673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011004	T	7	7	2370555	2370561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011004	T	6	6	2371753	2371758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011004	C	6	6	2373744	2373749	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
148	NC_011004	C	6	6	2392848	2392853	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
149	NC_011004	T	6	6	2432850	2432855	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.