MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 11180

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011004	TCC	2	6	45	50	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_011004	GCT	2	6	98	103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011004	GCG	2	6	113	118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011004	GCT	2	6	211	216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_011004	TCC	2	6	1716	1721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_011004	CAT	2	6	1816	1821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_011004	TCA	2	6	1833	1838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011004	GAT	2	6	3030	3035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011004	GGA	2	6	3124	3129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011004	CGT	2	6	3226	3231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_011004	GAC	2	6	4507	4512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011004	AAG	2	6	4530	4535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011004	TCT	2	6	7079	7084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011004	TCG	2	6	7119	7124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_011004	GAA	2	6	7164	7169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011004	CTC	2	6	8338	8343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_011004	GTA	2	6	8363	8368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011004	GGC	2	6	8947	8952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_011004	CAC	2	6	12418	12423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_011004	CGG	2	6	12528	12533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_011004	GCG	2	6	12583	12588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011004	TCG	2	6	12749	12754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011004	GCC	2	6	12787	12792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_011004	TTC	2	6	13331	13336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011004	CAT	2	6	13356	13361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_011004	GCC	2	6	13421	13426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_011004	GGC	2	6	13668	13673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_011004	GTC	2	6	13683	13688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_011004	CTG	2	6	13780	13785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_011004	CCG	2	6	13799	13804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_011004	CTT	2	6	18461	18466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_011004	TCG	2	6	18470	18475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011004	GTC	2	6	19442	19447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011004	CGC	2	6	19615	19620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_011004	CGG	2	6	22033	22038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_011004	ACG	3	9	22110	22118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_011004	TGC	2	6	22146	22151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011004	AAT	2	6	22278	22283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011004	TCC	2	6	23251	23256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_011004	TGC	2	6	23286	23291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_011004	CGG	2	6	24118	24123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_011004	TCG	2	6	24136	24141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_011004	TCC	2	6	24783	24788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_011004	GCG	2	6	24793	24798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011004	GTC	2	6	24817	24822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011004	CCG	2	6	24846	24851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_011004	CGC	2	6	24909	24914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_011004	ATC	2	6	26725	26730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011004	GCG	2	6	26763	26768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_011004	ACG	2	6	26913	26918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_011004	GCG	2	6	28678	28683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_011004	GGC	2	6	30262	30267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_011004	GGA	2	6	30269	30274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011004	GCA	2	6	30295	30300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_011004	GCC	2	6	30315	30320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_011004	GGC	2	6	30327	30332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011004	TCG	2	6	31516	31521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_011004	TCT	2	6	33131	33136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_011004	TGC	2	6	35099	35104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011004	GCT	2	6	35320	35325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_011004	GAA	2	6	35354	35359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011004	CAG	2	6	36728	36733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_011004	GAG	2	6	36734	36739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011004	CGC	2	6	36743	36748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_011004	GAA	2	6	36847	36852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011004	CCG	2	6	36859	36864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_011004	TCA	2	6	37105	37110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_011004	ATT	2	6	37130	37135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011004	TGC	2	6	38654	38659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_011004	GAT	2	6	38683	38688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011004	CAC	2	6	38748	38753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_011004	CCG	2	6	38815	38820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_011004	CGG	2	6	38828	38833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_011004	ACG	2	6	38834	38839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_011004	CGC	2	6	38909	38914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_011004	GCC	2	6	38951	38956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_011004	GTT	2	6	42858	42863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011004	TCG	2	6	42903	42908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_011004	GCG	2	6	43548	43553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_011004	ATC	2	6	43568	43573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_011004	ATC	2	6	43584	43589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_011004	GCC	2	6	44795	44800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_011004	AAG	2	6	44810	44815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011004	GCC	2	6	44910	44915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_011004	GCG	2	6	45366	45371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_011004	GCG	3	9	45625	45633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_011004	CCG	2	6	45794	45799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_011004	CGT	2	6	45803	45808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_011004	GAC	2	6	45813	45818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_011004	CCG	2	6	45907	45912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_011004	GCT	2	6	46509	46514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_011004	GAA	2	6	46619	46624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011004	CCG	2	6	46625	46630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_011004	GCA	2	6	46676	46681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_011004	CAC	2	6	46688	46693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_011004	CGC	3	9	46695	46703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_011004	GTT	2	6	46762	46767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011004	CAT	2	6	47589	47594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_011004	CCG	2	6	48860	48865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_011004	GGC	2	6	49633	49638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_011004	CGC	2	6	50605	50610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_011004	GGA	2	6	51606	51611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011004	CTT	2	6	51843	51848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_011004	GCC	2	6	51906	51911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_011004	CTC	2	6	51971	51976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_011004	CGG	2	6	52633	52638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_011004	CGC	2	6	52663	52668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_011004	CTC	2	6	52681	52686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_011004	GGA	2	6	52790	52795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011004	AGC	2	6	52837	52842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_011004	TGG	2	6	54377	54382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011004	GCC	2	6	55363	55368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_011004	ACC	2	6	57882	57887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_011004	CCG	2	6	57941	57946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_011004	CGG	2	6	57952	57957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_011004	GCC	2	6	57978	57983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_011004	CCG	2	6	58088	58093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_011004	TGA	2	6	58736	58741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011004	TGA	2	6	58756	58761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011004	CGA	2	6	58828	58833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_011004	GAG	2	6	58862	58867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011004	GAT	2	6	58917	58922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011004	CTC	2	6	58939	58944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_011004	TCA	2	6	58981	58986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_011004	CGT	3	9	59031	59039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_011004	GTT	2	6	59058	59063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011004	CTG	2	6	59106	59111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_011004	CAG	2	6	59142	59147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_011004	CTC	2	6	59478	59483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_011004	AAG	2	6	60056	60061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011004	CCA	2	6	60078	60083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_011004	CGG	2	6	62946	62951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_011004	CAA	2	6	62955	62960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_011004	CCG	2	6	62966	62971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_011004	GTG	2	6	64445	64450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011004	AGC	2	6	64460	64465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_011004	GCG	2	6	64517	64522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_011004	GCC	2	6	64531	64536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_011004	CGC	2	6	64563	64568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_011004	CTG	2	6	64585	64590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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