MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 17518

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011004	GTCG	2	8	1178365	1178372	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3502	NC_011004	GCCC	2	8	1178376	1178383	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3503	NC_011004	GGCA	2	8	1178433	1178440	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3504	NC_011004	GCG	2	6	1178449	1178454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_011004	TCGC	2	8	1178494	1178501	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3506	NC_011004	TGG	2	6	1178531	1178536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_011004	TCG	2	6	1178555	1178560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_011004	GCG	2	6	1178592	1178597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_011004	CAA	2	6	1178599	1178604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_011004	GCG	2	6	1178617	1178622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3511	NC_011004	GGC	2	6	1178626	1178631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_011004	GCC	2	6	1178657	1178662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3513	NC_011004	CAC	2	6	1178676	1178681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3514	NC_011004	AGC	2	6	1178714	1178719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_011004	TCC	2	6	1178726	1178731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3516	NC_011004	CGGCG	2	10	1178742	1178751	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3517	NC_011004	TGA	2	6	1178778	1178783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_011004	CG	3	6	1178795	1178800	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3519	NC_011004	GC	4	8	1178801	1178808	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3520	NC_011004	CAGC	2	8	1178814	1178821	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3521	NC_011004	CCG	2	6	1178862	1178867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3522	NC_011004	TCG	2	6	1178868	1178873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3523	NC_011004	CATG	2	8	1178919	1178926	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3524	NC_011004	GATC	2	8	1179770	1179777	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3525	NC_011004	CG	3	6	1179968	1179973	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3526	NC_011004	CGC	2	6	1179976	1179981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3527	NC_011004	TGAAC	2	10	1180011	1180020	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3528	NC_011004	TTGA	2	8	1183643	1183650	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_011004	AGT	2	6	1183781	1183786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_011004	GAA	2	6	1183819	1183824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_011004	GCC	2	6	1183911	1183916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3532	NC_011004	TCC	2	6	1183975	1183980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3533	NC_011004	TGAG	2	8	1184149	1184156	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_011004	ATA	2	6	1184253	1184258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_011004	TGG	2	6	1184268	1184273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_011004	GGCT	2	8	1184366	1184373	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3537	NC_011004	AGG	2	6	1184410	1184415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_011004	GTC	2	6	1184433	1184438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_011004	GCG	2	6	1184439	1184444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3540	NC_011004	TTG	2	6	1184447	1184452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_011004	ATG	2	6	1184466	1184471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_011004	GCG	2	6	1184542	1184547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_011004	GCA	2	6	1184587	1184592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3544	NC_011004	TTTC	2	8	1184613	1184620	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3545	NC_011004	GACG	2	8	1184738	1184745	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3546	NC_011004	CTGG	2	8	1184853	1184860	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3547	NC_011004	GCC	2	6	1184864	1184869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3548	NC_011004	CCAGA	2	10	1184877	1184886	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3549	NC_011004	CTCA	2	8	1185584	1185591	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3550	NC_011004	CAAT	2	8	1185602	1185609	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3551	NC_011004	TAT	2	6	1185702	1185707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_011004	CGA	2	6	1185841	1185846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_011004	CG	3	6	1185864	1185869	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3554	NC_011004	CG	3	6	1201122	1201127	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3555	NC_011004	GT	3	6	1203999	1204004	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_011004	GACC	2	8	1204121	1204128	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3557	NC_011004	CGT	2	6	1204184	1204189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_011004	CGG	2	6	1204210	1204215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3559	NC_011004	GCC	2	6	1204235	1204240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3560	NC_011004	TGG	2	6	1204261	1204266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_011004	CTG	2	6	1204314	1204319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_011004	GCA	2	6	1204369	1204374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3563	NC_011004	GAA	2	6	1204433	1204438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_011004	TGCT	2	8	1204449	1204456	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3565	NC_011004	GCT	2	6	1204501	1204506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_011004	CGT	2	6	1204510	1204515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3567	NC_011004	A	6	6	1205758	1205763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_011004	GAC	2	6	1207897	1207902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3569	NC_011004	GCGA	2	8	1207949	1207956	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3570	NC_011004	TCG	2	6	1207995	1208000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3571	NC_011004	TCC	2	6	1209824	1209829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3572	NC_011004	TCC	2	6	1209849	1209854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3573	NC_011004	AAAT	2	8	1209946	1209953	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_011004	GC	3	6	1209983	1209988	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3575	NC_011004	ATT	2	6	1209992	1209997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_011004	CAT	2	6	1210071	1210076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3577	NC_011004	AGG	2	6	1210169	1210174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_011004	TGG	2	6	1211608	1211613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_011004	CGA	2	6	1211693	1211698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3580	NC_011004	GC	3	6	1211735	1211740	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3581	NC_011004	GTT	2	6	1211778	1211783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_011004	GATAC	2	10	1213710	1213719	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3583	NC_011004	CTG	2	6	1213769	1213774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3584	NC_011004	CGA	2	6	1213816	1213821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3585	NC_011004	CGCC	2	8	1213828	1213835	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3586	NC_011004	GGT	2	6	1213899	1213904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_011004	GGT	2	6	1213912	1213917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_011004	CCG	2	6	1213927	1213932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3589	NC_011004	TCCC	2	8	1213995	1214002	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3590	NC_011004	T	6	6	1214046	1214051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_011004	GGTG	2	8	1214063	1214070	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_011004	GGC	2	6	1214079	1214084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3593	NC_011004	ATG	2	6	1214094	1214099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_011004	CAG	2	6	1214101	1214106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3595	NC_011004	AGA	2	6	1214116	1214121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_011004	AG	3	6	1214134	1214139	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_011004	CGT	2	6	1214166	1214171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3598	NC_011004	CGC	2	6	1214178	1214183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3599	NC_011004	GC	3	6	1214210	1214215	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3600	NC_011004	CAA	2	6	1214236	1214241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3601	NC_011004	AAT	2	6	1214263	1214268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_011004	CGG	2	6	1214288	1214293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_011004	A	6	6	1215073	1215078	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_011004	CGT	2	6	1215101	1215106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3605	NC_011004	AC	3	6	1215153	1215158	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3606	NC_011004	CCG	2	6	1215199	1215204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3607	NC_011004	GAG	2	6	1215218	1215223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_011004	TC	3	6	1215267	1215272	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3609	NC_011004	GCC	2	6	1215298	1215303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3610	NC_011004	GAC	2	6	1215321	1215326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3611	NC_011004	GAG	2	6	1215349	1215354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_011004	CGC	2	6	1215607	1215612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3613	NC_011004	GCCA	2	8	1215616	1215623	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3614	NC_011004	TGC	2	6	1215675	1215680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NC_011004	GCT	2	6	1219124	1219129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3616	NC_011004	GTC	2	6	1219146	1219151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3617	NC_011004	ACC	2	6	1219153	1219158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3618	NC_011004	A	6	6	1219201	1219206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_011004	CGG	2	6	1219281	1219286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3620	NC_011004	GGA	2	6	1219325	1219330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_011004	TCG	2	6	1219371	1219376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3622	NC_011004	TGC	2	6	1219467	1219472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3623	NC_011004	GCC	2	6	1219506	1219511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3624	NC_011004	CTCGAT	2	12	1219558	1219569	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3625	NC_011004	GCG	2	6	1219794	1219799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3626	NC_011004	TCGA	2	8	1219822	1219829	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3627	NC_011004	GGC	2	6	1219851	1219856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3628	NC_011004	CGC	2	6	1219892	1219897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3629	NC_011004	TCT	2	6	1219951	1219956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3630	NC_011004	CAA	2	6	1219974	1219979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3631	NC_011004	TCG	2	6	1220036	1220041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3632	NC_011004	ACG	2	6	1220069	1220074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3633	NC_011004	GTC	2	6	1220077	1220082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3634	NC_011004	GAT	2	6	1220094	1220099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3635	NC_011004	CGC	2	6	1220207	1220212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3636	NC_011004	TGTC	2	8	1220298	1220305	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3637	NC_011004	CAC	2	6	1220325	1220330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3638	NC_011004	ATG	2	6	1220350	1220355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3639	NC_011004	CGCC	2	8	1220423	1220430	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3640	NC_011004	CG	3	6	1220441	1220446	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3641	NC_011004	CG	3	6	1220472	1220477	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3642	NC_011004	GAC	2	6	1220487	1220492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3643	NC_011004	CCA	2	6	1220559	1220564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3644	NC_011004	CGA	2	6	1220607	1220612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3645	NC_011004	CGC	2	6	1220622	1220627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3646	NC_011004	GCT	2	6	1220661	1220666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3647	NC_011004	GCC	2	6	1220670	1220675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3648	NC_011004	GCGTCA	2	12	1220718	1220729	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3649	NC_011004	CAGC	2	8	1220730	1220737	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3650	NC_011004	CCGG	2	8	1220740	1220747	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3651	NC_011004	GCA	2	6	1220749	1220754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3652	NC_011004	TCAA	2	8	1220760	1220767	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3653	NC_011004	ACCAG	2	10	1220787	1220796	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3654	NC_011004	CG	3	6	1220809	1220814	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3655	NC_011004	CGT	2	6	1220894	1220899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3656	NC_011004	CGAC	2	8	1220902	1220909	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3657	NC_011004	GT	3	6	1220934	1220939	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3658	NC_011004	G	6	6	1221109	1221114	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3659	NC_011004	CG	3	6	1221167	1221172	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3660	NC_011004	GC	3	6	1221202	1221207	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3662	NC_011004	TGT	2	6	1221357	1221362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3663	NC_011004	CG	3	6	1221415	1221420	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3664	NC_011004	GC	3	6	1221450	1221455	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3665	NC_011004	GAG	2	6	1221526	1221531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3666	NC_011004	TGT	2	6	1221605	1221610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3667	NC_011004	ATCGAG	2	12	1221631	1221642	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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3670	NC_011004	AAT	2	6	1221769	1221774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3672	NC_011004	CGG	2	6	1221951	1221956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3692	NC_011004	ATG	2	6	1245628	1245633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3712	NC_011004	TTGC	2	8	1258394	1258401	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3713	NC_011004	CGGTG	2	10	1258471	1258480	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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3717	NC_011004	CG	3	6	1258682	1258687	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3753	NC_011004	CTT	2	6	1265589	1265594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3759	NC_011004	TG	3	6	1267449	1267454	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3761	NC_011004	CGG	2	6	1267514	1267519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3879	NC_011004	GC	4	8	1304281	1304288	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3881	NC_011004	GCG	2	6	1305437	1305442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3884	NC_011004	CGAT	2	8	1305555	1305562	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3885	NC_011004	GAC	2	6	1305597	1305602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3888	NC_011004	CAA	2	6	1306720	1306725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3891	NC_011004	TACC	2	8	1306813	1306820	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3892	NC_011004	GTG	2	6	1306823	1306828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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