MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 17518

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011004	GCG	2	6	534279	534284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_011004	CCTG	2	8	535174	535181	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1503	NC_011004	CTGCG	2	10	535340	535349	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1504	NC_011004	ATG	2	6	535408	535413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_011004	CTG	2	6	535425	535430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_011004	CGG	2	6	535437	535442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_011004	CGC	2	6	535772	535777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1508	NC_011004	TTGA	2	8	535792	535799	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_011004	CGG	2	6	535805	535810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_011004	CGTG	2	8	535838	535845	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1511	NC_011004	CTGGC	2	10	535846	535855	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1512	NC_011004	TTCG	2	8	535935	535942	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1513	NC_011004	TCG	2	6	535997	536002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_011004	GCA	2	6	536030	536035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_011004	GCC	3	9	536039	536047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1516	NC_011004	CGG	2	6	539342	539347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_011004	TCC	2	6	543837	543842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1518	NC_011004	TGG	2	6	543877	543882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_011004	AG	3	6	543912	543917	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_011004	CGC	2	6	543936	543941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1521	NC_011004	CCGA	2	8	544081	544088	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1522	NC_011004	GAG	2	6	544096	544101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_011004	TCAA	2	8	544733	544740	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1524	NC_011004	ACG	2	6	544746	544751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_011004	GCC	2	6	544781	544786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1526	NC_011004	GGAC	2	8	545440	545447	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1527	NC_011004	AGC	2	6	545490	545495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_011004	CGG	2	6	547247	547252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_011004	TAC	2	6	549048	549053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_011004	CG	3	6	549111	549116	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1531	NC_011004	CGC	2	6	549118	549123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1532	NC_011004	CTGCCG	2	12	549131	549142	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1533	NC_011004	GCC	2	6	550336	550341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1534	NC_011004	CCG	2	6	551034	551039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1535	NC_011004	GCCG	2	8	551058	551065	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1536	NC_011004	GGC	2	6	551135	551140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_011004	TCC	2	6	551158	551163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1538	NC_011004	GCCCC	2	10	552147	552156	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
1539	NC_011004	GGC	2	6	552165	552170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_011004	CGC	2	6	552235	552240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1541	NC_011004	CCGCC	2	10	552280	552289	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
1542	NC_011004	CCG	2	6	552407	552412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1543	NC_011004	CG	3	6	552443	552448	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1544	NC_011004	GTC	2	6	552495	552500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_011004	GGC	2	6	553953	553958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_011004	GC	3	6	553957	553962	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1547	NC_011004	TCT	2	6	553963	553968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_011004	CAC	2	6	554042	554047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1549	NC_011004	CAA	2	6	554057	554062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_011004	TGT	2	6	557044	557049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_011004	GC	4	8	557136	557143	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1552	NC_011004	CGA	2	6	557198	557203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_011004	CCCGA	2	10	557207	557216	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1554	NC_011004	GGC	2	6	557223	557228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_011004	CGCC	2	8	557261	557268	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1556	NC_011004	TCA	2	6	557280	557285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_011004	CAC	2	6	557314	557319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1558	NC_011004	CCG	2	6	557335	557340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1559	NC_011004	CGG	2	6	561183	561188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_011004	CTG	2	6	561241	561246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_011004	GC	3	6	562593	562598	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1562	NC_011004	CG	4	8	562601	562608	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1563	NC_011004	CGC	2	6	562638	562643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1564	NC_011004	GGC	2	6	562651	562656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_011004	GA	3	6	562690	562695	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_011004	CCT	2	6	565927	565932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1567	NC_011004	ATAAG	2	10	565942	565951	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_011004	TTA	2	6	565957	565962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_011004	GATC	2	8	565988	565995	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1570	NC_011004	CGC	2	6	566043	566048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1571	NC_011004	CCGGT	2	10	566079	566088	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1572	NC_011004	GTG	2	6	566103	566108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_011004	GAG	2	6	566631	566636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_011004	GC	3	6	566641	566646	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1575	NC_011004	CG	3	6	566723	566728	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1576	NC_011004	GATC	2	8	569043	569050	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1577	NC_011004	TC	3	6	569112	569117	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1578	NC_011004	CGA	2	6	569191	569196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_011004	CCGT	2	8	570989	570996	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1580	NC_011004	GGC	2	6	571026	571031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_011004	TGG	2	6	571033	571038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_011004	TCA	2	6	571098	571103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_011004	CGCAC	2	10	571173	571182	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1584	NC_011004	GCTCA	2	10	571184	571193	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1585	NC_011004	GGC	2	6	571198	571203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_011004	CCG	2	6	572803	572808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1587	NC_011004	GCG	2	6	573257	573262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1588	NC_011004	TCA	2	6	574919	574924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_011004	CGG	2	6	574945	574950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_011004	GGCCA	2	10	574960	574969	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1591	NC_011004	GC	3	6	575717	575722	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1592	NC_011004	GC	3	6	575783	575788	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1593	NC_011004	CTCG	2	8	576043	576050	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1594	NC_011004	CGC	2	6	576104	576109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1595	NC_011004	CG	3	6	576148	576153	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1596	NC_011004	CGTCCG	2	12	576222	576233	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1597	NC_011004	TAG	2	6	577325	577330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_011004	TAT	2	6	577392	577397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_011004	GA	3	6	579225	579230	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_011004	GGCC	2	8	579253	579260	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1601	NC_011004	GTC	2	6	579282	579287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_011004	AGC	2	6	579331	579336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_011004	CA	4	8	579945	579952	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1604	NC_011004	GGA	2	6	579954	579959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_011004	CGC	2	6	579969	579974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1606	NC_011004	CAG	2	6	579982	579987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_011004	GCAAT	2	10	579996	580005	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1608	NC_011004	GCG	2	6	580045	580050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_011004	CGC	2	6	580053	580058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1610	NC_011004	GTG	2	6	580062	580067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_011004	CGC	2	6	580089	580094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1612	NC_011004	CGC	3	9	580121	580129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1613	NC_011004	CCG	2	6	580175	580180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1614	NC_011004	GT	3	6	581404	581409	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_011004	CGA	2	6	581412	581417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_011004	CGAG	2	8	581506	581513	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1617	NC_011004	A	6	6	581552	581557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_011004	GAG	2	6	581568	581573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_011004	GT	3	6	582340	582345	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_011004	GGCG	2	8	582370	582377	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1621	NC_011004	CA	3	6	583801	583806	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1622	NC_011004	CGC	2	6	583813	583818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1623	NC_011004	CG	3	6	583832	583837	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1624	NC_011004	AAC	2	6	586439	586444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_011004	CCCA	2	8	586462	586469	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1626	NC_011004	GAT	2	6	586536	586541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_011004	AAC	2	6	586565	586570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_011004	GAG	2	6	587649	587654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_011004	CGA	2	6	587660	587665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_011004	TCGCT	2	10	587701	587710	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1631	NC_011004	AGG	2	6	589391	589396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_011004	ATG	2	6	589415	589420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_011004	TCAA	2	8	589482	589489	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1634	NC_011004	CG	3	6	589531	589536	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1635	NC_011004	GCAGG	2	10	589564	589573	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1636	NC_011004	CGA	2	6	589592	589597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1770	NC_011004	GA	3	6	629382	629387	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1771	NC_011004	GGGGT	2	10	629388	629397	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
1772	NC_011004	CTA	2	6	629424	629429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1775	NC_011004	GCG	2	6	631821	631826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1793	NC_011004	GCC	2	6	637928	637933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1898	NC_011004	GTC	2	6	688738	688743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1899	NC_011004	GTG	2	6	691164	691169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1901	NC_011004	GAG	2	6	691433	691438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1902	NC_011004	CG	3	6	692977	692982	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1903	NC_011004	CGT	2	6	693044	693049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1905	NC_011004	GCTA	2	8	693101	693108	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1906	NC_011004	CGG	2	6	693145	693150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1907	NC_011004	GC	3	6	693256	693261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1908	NC_011004	GGC	2	6	693296	693301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1909	NC_011004	TCGCGC	2	12	693309	693320	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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1911	NC_011004	GAC	2	6	693393	693398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1913	NC_011004	AGT	2	6	693437	693442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1927	NC_011004	CGG	2	6	702691	702696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1935	NC_011004	GGCA	2	8	714399	714406	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1939	NC_011004	CGG	2	6	716007	716012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1940	NC_011004	AGC	2	6	716018	716023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1942	NC_011004	AGG	2	6	716049	716054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1943	NC_011004	CGC	2	6	716095	716100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1946	NC_011004	CG	3	6	717429	717434	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1999	NC_011004	GC	3	6	745834	745839	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2000	NC_011004	GAGG	2	8	745851	745858	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding

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