MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 17518

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_011004	CGGC	2	8	3782085	3782092	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11002	NC_011004	A	6	6	3782096	3782101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11003	NC_011004	GCCC	2	8	3782159	3782166	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11004	NC_011004	CTC	2	6	3782276	3782281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11005	NC_011004	GAA	2	6	3782301	3782306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11006	NC_011004	CAA	2	6	3782602	3782607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11007	NC_011004	GCC	2	6	3782683	3782688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11008	NC_011004	AGC	2	6	3782695	3782700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11009	NC_011004	CAC	2	6	3782720	3782725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11010	NC_011004	CAA	3	9	3788337	3788345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11011	NC_011004	ACA	3	9	3788346	3788354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11012	NC_011004	CAA	2	6	3788356	3788361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11013	NC_011004	G	6	6	3790422	3790427	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11014	NC_011004	GGGC	2	8	3790447	3790454	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11015	NC_011004	GGC	2	6	3790550	3790555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11016	NC_011004	GGC	2	6	3790640	3790645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11017	NC_011004	CTGA	2	8	3790897	3790904	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11018	NC_011004	TTCC	2	8	3790910	3790917	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11019	NC_011004	GGCG	2	8	3790998	3791005	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11020	NC_011004	CAG	2	6	3791080	3791085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11021	NC_011004	ACT	2	6	3792881	3792886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11022	NC_011004	CGG	2	6	3792906	3792911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11023	NC_011004	CGAT	2	8	3794591	3794598	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11024	NC_011004	GAGCG	2	10	3794617	3794626	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
11025	NC_011004	CAG	2	6	3794635	3794640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11030	NC_011004	TGA	2	6	3795600	3795605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11031	NC_011004	GGT	2	6	3795611	3795616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11032	NC_011004	CGC	2	6	3795626	3795631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11033	NC_011004	CGG	2	6	3795710	3795715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11034	NC_011004	GCTT	2	8	3795759	3795766	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11035	NC_011004	CGA	2	6	3795828	3795833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11036	NC_011004	CGC	2	6	3798432	3798437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11038	NC_011004	CAC	2	6	3800589	3800594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11039	NC_011004	AGG	2	6	3800624	3800629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11042	NC_011004	GCA	2	6	3802202	3802207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11043	NC_011004	CG	3	6	3802291	3802296	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11044	NC_011004	GAC	3	9	3802336	3802344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11047	NC_011004	AAG	3	9	3802379	3802387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11052	NC_011004	GCC	2	6	3802543	3802548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11053	NC_011004	CG	3	6	3802678	3802683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11054	NC_011004	CG	3	6	3802695	3802700	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11055	NC_011004	CTG	2	6	3802721	3802726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11058	NC_011004	CGC	2	6	3807023	3807028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11059	NC_011004	CAA	3	9	3807041	3807049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11061	NC_011004	ACGC	2	8	3807173	3807180	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11062	NC_011004	GCCG	2	8	3807539	3807546	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11063	NC_011004	GCA	2	6	3807577	3807582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11064	NC_011004	GC	3	6	3807644	3807649	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11065	NC_011004	CAGCG	2	10	3807668	3807677	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11066	NC_011004	ACG	2	6	3807687	3807692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11069	NC_011004	GC	3	6	3807757	3807762	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11070	NC_011004	CGC	2	6	3807771	3807776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11083	NC_011004	CG	3	6	3811648	3811653	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11084	NC_011004	GCG	2	6	3811721	3811726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11099	NC_011004	GAA	2	6	3817022	3817027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11100	NC_011004	GCC	2	6	3817029	3817034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11105	NC_011004	TGGC	2	8	3818569	3818576	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11106	NC_011004	GGC	2	6	3818608	3818613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11123	NC_011004	TGA	2	6	3826967	3826972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11125	NC_011004	ACCAC	2	10	3827273	3827282	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
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11129	NC_011004	ATC	2	6	3828115	3828120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11130	NC_011004	GCT	2	6	3828121	3828126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11131	NC_011004	CGC	2	6	3830928	3830933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11132	NC_011004	CTC	2	6	3831389	3831394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11133	NC_011004	GAT	2	6	3831398	3831403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11134	NC_011004	CGC	2	6	3831407	3831412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11135	NC_011004	TGA	3	9	3831478	3831486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11137	NC_011004	CGGG	2	8	3835580	3835587	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11138	NC_011004	CGC	2	6	3837550	3837555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11139	NC_011004	ATCG	2	8	3838242	3838249	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11140	NC_011004	GCA	2	6	3838291	3838296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11141	NC_011004	CGG	3	9	3838329	3838337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11142	NC_011004	GGC	2	6	3838349	3838354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11143	NC_011004	GGC	2	6	3838381	3838386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11151	NC_011004	CCG	2	6	3840931	3840936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11153	NC_011004	TCG	2	6	3841914	3841919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11154	NC_011004	GCC	2	6	3841934	3841939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11156	NC_011004	GCTC	2	8	3842905	3842912	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11157	NC_011004	CGGC	2	8	3843429	3843436	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11158	NC_011004	GTTTG	2	10	3843454	3843463	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
11159	NC_011004	CTCCC	2	10	3843503	3843512	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
11160	NC_011004	CCG	2	6	3843552	3843557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11161	NC_011004	GGC	2	6	3843558	3843563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11163	NC_011004	CCA	2	6	3843740	3843745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11167	NC_011004	C	7	7	3843988	3843994	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11168	NC_011004	CGC	2	6	3844058	3844063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11169	NC_011004	C	8	8	3844070	3844077	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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11171	NC_011004	GCC	2	6	3844304	3844309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11175	NC_011004	AG	3	6	3845849	3845854	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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11180	NC_011004	TACA	2	8	3846110	3846117	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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11187	NC_011004	ACG	2	6	3846344	3846349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11223	NC_011004	CTT	2	6	3847719	3847724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11239	NC_011004	CCATC	2	10	3849268	3849277	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
11240	NC_011004	TCGG	2	8	3849309	3849316	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11241	NC_011004	CGACC	2	10	3849384	3849393	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
11242	NC_011004	CAC	2	6	3849592	3849597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11246	NC_011004	CGG	2	6	3851841	3851846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11247	NC_011004	TCC	2	6	3854974	3854979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11248	NC_011004	CAA	2	6	3855019	3855024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11249	NC_011004	GCTG	2	8	3855047	3855054	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11250	NC_011004	TGA	2	6	3855072	3855077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11251	NC_011004	AAGC	2	8	3855078	3855085	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11252	NC_011004	GCC	2	6	3855086	3855091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11253	NC_011004	GCG	2	6	3855105	3855110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11254	NC_011004	GTC	2	6	3855115	3855120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11255	NC_011004	GC	3	6	3857347	3857352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11256	NC_011004	GATGCA	2	12	3857385	3857396	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11257	NC_011004	TTA	2	6	3857398	3857403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11258	NC_011004	TGCAA	2	10	3857407	3857416	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11259	NC_011004	CGC	2	6	3859265	3859270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11260	NC_011004	CGG	2	6	3859283	3859288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11261	NC_011004	CGC	2	6	3859289	3859294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11262	NC_011004	TCC	2	6	3860189	3860194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11263	NC_011004	GTT	2	6	3860196	3860201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11264	NC_011004	GC	3	6	3860206	3860211	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11265	NC_011004	TGT	2	6	3860222	3860227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11266	NC_011004	GATG	2	8	3860271	3860278	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11267	NC_011004	CAT	2	6	3860302	3860307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11268	NC_011004	CTT	2	6	3861194	3861199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11269	NC_011004	TTG	2	6	3861203	3861208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11270	NC_011004	C	6	6	3861315	3861320	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11271	NC_011004	C	6	6	3861345	3861350	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11272	NC_011004	AC	3	6	3863058	3863063	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11273	NC_011004	GCGA	2	8	3863073	3863080	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11274	NC_011004	CGGA	2	8	3863143	3863150	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11275	NC_011004	CTC	2	6	3863171	3863176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11280	NC_011004	GCG	2	6	3866878	3866883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11281	NC_011004	ACGA	2	8	3866888	3866895	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11282	NC_011004	CACCG	2	10	3866903	3866912	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
11283	NC_011004	CTGA	2	8	3866929	3866936	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11284	NC_011004	GCCG	2	8	3866961	3866968	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11285	NC_011004	GGAT	2	8	3866974	3866981	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11286	NC_011004	TGG	2	6	3866993	3866998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11287	NC_011004	GTC	2	6	3867426	3867431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11288	NC_011004	TTGCAG	2	12	3867437	3867448	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11289	NC_011004	CGC	2	6	3867482	3867487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11290	NC_011004	CG	3	6	3867513	3867518	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11291	NC_011004	GC	4	8	3867579	3867586	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11292	NC_011004	AGC	2	6	3867612	3867617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11293	NC_011004	GAT	2	6	3867621	3867626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11295	NC_011004	CGAT	2	8	3867967	3867974	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11296	NC_011004	CG	3	6	3867988	3867993	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11297	NC_011004	T	7	7	3867998	3868004	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11298	NC_011004	CGA	2	6	3868875	3868880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11299	NC_011004	CAGC	2	8	3868918	3868925	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11300	NC_011004	CGG	2	6	3869509	3869514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11301	NC_011004	ACC	2	6	3869531	3869536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11305	NC_011004	GGGC	2	8	3871344	3871351	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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11307	NC_011004	CAA	2	6	3872273	3872278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11308	NC_011004	CGA	2	6	3872292	3872297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11315	NC_011004	ACAT	2	8	3872548	3872555	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11316	NC_011004	GTCGC	2	10	3873256	3873265	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11317	NC_011004	ACC	2	6	3873297	3873302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11328	NC_011004	CGC	3	9	3879990	3879998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11329	NC_011004	GGC	2	6	3880005	3880010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11333	NC_011004	GCC	2	6	3881566	3881571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11334	NC_011004	TCGC	2	8	3881579	3881586	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11335	NC_011004	CG	3	6	3882231	3882236	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11336	NC_011004	GGC	2	6	3882268	3882273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11343	NC_011004	CGGC	2	8	3882668	3882675	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11344	NC_011004	TCC	2	6	3883598	3883603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11374	NC_011004	GCGTC	2	10	3897458	3897467	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11375	NC_011004	GCA	2	6	3898898	3898903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11377	NC_011004	CCAG	2	8	3898920	3898927	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11378	NC_011004	C	6	6	3899451	3899456	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11379	NC_011004	CT	3	6	3900515	3900520	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11380	NC_011004	CGAA	2	8	3900540	3900547	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11381	NC_011004	CGC	2	6	3900578	3900583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11382	NC_011004	ATC	2	6	3901509	3901514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11383	NC_011004	TGA	2	6	3901520	3901525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11385	NC_011004	GGCG	2	8	3901610	3901617	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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