MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 17518

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011004	GCGCG	2	10	212337	212346	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
502	NC_011004	CT	3	6	212356	212361	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
503	NC_011004	CCGT	2	8	212469	212476	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
504	NC_011004	GGC	2	6	212506	212511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_011004	TTC	2	6	212573	212578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_011004	GGCCG	2	10	212689	212698	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
507	NC_011004	GC	3	6	212736	212741	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
508	NC_011004	TGC	2	6	212747	212752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_011004	GGC	2	6	212796	212801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_011004	ACC	2	6	212827	212832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
511	NC_011004	GCC	2	6	212845	212850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
512	NC_011004	CGC	2	6	212930	212935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
513	NC_011004	GCT	2	6	212994	212999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_011004	GTC	2	6	213036	213041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_011004	TTC	2	6	213082	213087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_011004	CCG	3	9	213092	213100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
517	NC_011004	GATGAC	2	12	213216	213227	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
518	NC_011004	GC	3	6	213283	213288	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
519	NC_011004	AAC	2	6	213324	213329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_011004	A	6	6	213395	213400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_011004	CAG	2	6	213535	213540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_011004	GTAC	2	8	213556	213563	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
523	NC_011004	A	8	8	213773	213780	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_011004	AT	3	6	213783	213788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_011004	ACA	2	6	213825	213830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_011004	ATA	2	6	213974	213979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_011004	TTAA	2	8	214015	214022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_011004	G	7	7	214070	214076	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
529	NC_011004	AAT	2	6	214098	214103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_011004	GCT	2	6	214145	214150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_011004	GCAG	2	8	214260	214267	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
532	NC_011004	GCC	2	6	214398	214403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
533	NC_011004	GGC	2	6	215284	215289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_011004	ACC	2	6	215390	215395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
535	NC_011004	GTTC	2	8	215418	215425	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
536	NC_011004	CGT	2	6	215446	215451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_011004	TCG	2	6	215475	215480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_011004	TCG	2	6	215483	215488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_011004	TGC	2	6	215490	215495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_011004	GGT	2	6	215509	215514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
541	NC_011004	GAA	2	6	215563	215568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_011004	CTACGG	2	12	215578	215589	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_011004	GCG	2	6	215598	215603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_011004	GCC	2	6	215618	215623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
545	NC_011004	GC	3	6	215631	215636	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
546	NC_011004	TCA	2	6	215655	215660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_011004	GCT	3	9	215671	215679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_011004	GCT	2	6	215683	215688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_011004	TCC	2	6	215710	215715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
550	NC_011004	CGC	2	6	215836	215841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
551	NC_011004	GCAC	2	8	216410	216417	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
552	NC_011004	CCT	2	6	216823	216828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
553	NC_011004	ACG	2	6	216832	216837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_011004	AGC	2	6	216882	216887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_011004	GCC	2	6	216948	216953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_011004	GC	4	8	216967	216974	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
557	NC_011004	CTTCGG	2	12	217018	217029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_011004	C	6	6	217046	217051	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
559	NC_011004	CCT	2	6	217093	217098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
560	NC_011004	T	6	6	217119	217124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_011004	GCA	3	9	217178	217186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_011004	GCT	2	6	217190	217195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_011004	GCC	2	6	217990	217995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
564	NC_011004	CGG	2	6	218015	218020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_011004	CGC	2	6	218023	218028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
566	NC_011004	GAG	2	6	218037	218042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
567	NC_011004	GGC	2	6	218057	218062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_011004	GCC	2	6	218074	218079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
569	NC_011004	CACT	2	8	218094	218101	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
570	NC_011004	TGC	2	6	220954	220959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_011004	GCC	2	6	220994	220999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
572	NC_011004	CCG	2	6	222353	222358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
573	NC_011004	CGC	2	6	222377	222382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
574	NC_011004	CGTCA	2	10	222390	222399	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
575	NC_011004	ATC	2	6	223354	223359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_011004	AAAT	2	8	223989	223996	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_011004	GCG	2	6	224032	224037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_011004	AAC	2	6	224070	224075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_011004	TAC	2	6	224513	224518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_011004	CAA	2	6	224556	224561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_011004	AGC	2	6	224612	224617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_011004	CGC	2	6	227205	227210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
583	NC_011004	CGC	2	6	227225	227230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
584	NC_011004	GC	3	6	227263	227268	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
585	NC_011004	AAC	3	9	227337	227345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_011004	CGG	2	6	227437	227442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_011004	CGG	2	6	227501	227506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_011004	GGA	2	6	227531	227536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
589	NC_011004	GGC	2	6	229613	229618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_011004	CGAG	2	8	229667	229674	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
591	NC_011004	CGG	2	6	229699	229704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_011004	GTT	2	6	229707	229712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_011004	TTC	2	6	229743	229748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_011004	GTC	2	6	229773	229778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_011004	CA	3	6	229782	229787	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
596	NC_011004	GGTT	2	8	229790	229797	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
597	NC_011004	GA	3	6	229866	229871	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
598	NC_011004	CGGA	2	8	230435	230442	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
599	NC_011004	T	6	6	230451	230456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_011004	GC	3	6	231419	231424	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
601	NC_011004	GCGG	2	8	231463	231470	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
602	NC_011004	CGGC	2	8	231485	231492	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
603	NC_011004	CCG	2	6	232661	232666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
604	NC_011004	CGG	2	6	232684	232689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_011004	TCA	2	6	232693	232698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_011004	CG	3	6	232766	232771	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
607	NC_011004	GCG	2	6	233545	233550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_011004	CGA	2	6	233624	233629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_011004	CTTC	2	8	233643	233650	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
610	NC_011004	GCTTC	2	10	233664	233673	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
611	NC_011004	GA	3	6	233689	233694	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
612	NC_011004	CAAAA	2	10	233703	233712	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
613	NC_011004	GC	3	6	233754	233759	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
614	NC_011004	TC	3	6	234557	234562	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
615	NC_011004	GAA	2	6	234604	234609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_011004	GATG	2	8	234610	234617	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
617	NC_011004	GGC	2	6	237300	237305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_011004	ATTG	2	8	237361	237368	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
619	NC_011004	CCTC	2	8	237443	237450	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
620	NC_011004	CG	3	6	237515	237520	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
621	NC_011004	CGG	3	9	237528	237536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_011004	GCC	2	6	237594	237599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
623	NC_011004	GCA	2	6	237643	237648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_011004	CTC	2	6	238614	238619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
625	NC_011004	GCT	3	9	238629	238637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_011004	AGCG	2	8	238708	238715	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
627	NC_011004	CGATG	2	10	238728	238737	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
628	NC_011004	CAA	2	6	238754	238759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_011004	GC	4	8	238783	238790	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
630	NC_011004	GT	3	6	238805	238810	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
631	NC_011004	GGC	2	6	238827	238832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_011004	GC	4	8	238831	238838	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
633	NC_011004	GAAC	2	8	240451	240458	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
634	NC_011004	ACGAA	2	10	240460	240469	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
635	NC_011004	A	6	6	240487	240492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_011004	CGA	2	6	240535	240540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_011004	GCC	2	6	240564	240569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
638	NC_011004	GA	3	6	240617	240622	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
639	NC_011004	CGC	2	6	241219	241224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
640	NC_011004	CGGCG	2	10	241237	241246	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
641	NC_011004	CG	4	8	241318	241325	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
642	NC_011004	CGAT	2	8	241346	241353	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
643	NC_011004	CGC	2	6	242139	242144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
644	NC_011004	CTC	2	6	242149	242154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
645	NC_011004	CG	3	6	242997	243002	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
646	NC_011004	GCTC	2	8	243062	243069	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
647	NC_011004	CAA	2	6	243116	243121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
648	NC_011004	CGG	2	6	243171	243176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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650	NC_011004	CG	3	6	243781	243786	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
651	NC_011004	CCA	2	6	245045	245050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
652	NC_011004	GCG	2	6	245061	245066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
653	NC_011004	TTC	2	6	245125	245130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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655	NC_011004	GCC	2	6	246356	246361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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661	NC_011004	CGG	2	6	246445	246450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
662	NC_011004	GCC	3	9	246915	246923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
663	NC_011004	CAT	2	6	246996	247001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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671	NC_011004	CG	3	6	249752	249757	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
672	NC_011004	CCT	2	6	250495	250500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
673	NC_011004	CG	4	8	250549	250556	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
674	NC_011004	GAT	2	6	250612	250617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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683	NC_011004	GC	3	6	253716	253721	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
684	NC_011004	AAG	2	6	253846	253851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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689	NC_011004	CG	4	8	254836	254843	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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775	NC_011004	GA	3	6	278273	278278	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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778	NC_011004	GCCG	2	8	278516	278523	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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795	NC_011004	CGC	2	6	282914	282919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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908	NC_011004	CGA	2	6	324264	324269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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913	NC_011004	GGC	2	6	326268	326273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
914	NC_011004	CAA	2	6	326296	326301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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922	NC_011004	CT	3	6	326622	326627	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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945	NC_011004	CGG	2	6	342129	342134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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982	NC_011004	GAT	2	6	354278	354283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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984	NC_011004	GCCGC	2	10	354308	354317	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
985	NC_011004	TGCGC	2	10	354320	354329	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
986	NC_011004	CGC	2	6	354376	354381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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994	NC_011004	GCCG	2	8	356539	356546	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
995	NC_011004	CGG	2	6	356547	356552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
996	NC_011004	CAG	2	6	356620	356625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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