MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 17518

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_011004	CTC	2	6	1545987	1545992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4502	NC_011004	AGG	2	6	1545998	1546003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_011004	GCA	2	6	1546026	1546031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4504	NC_011004	GCGCGA	2	12	1546062	1546073	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4505	NC_011004	TCAC	2	8	1546104	1546111	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4506	NC_011004	TCA	2	6	1546183	1546188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4507	NC_011004	CGC	2	6	1546209	1546214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4508	NC_011004	CGGC	2	8	1546241	1546248	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4509	NC_011004	GAG	2	6	1546269	1546274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_011004	TCC	2	6	1546451	1546456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4511	NC_011004	GCGG	2	8	1546794	1546801	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4512	NC_011004	CG	3	6	1546804	1546809	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4513	NC_011004	CCT	2	6	1547087	1547092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4514	NC_011004	ATC	2	6	1547110	1547115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4515	NC_011004	GAT	2	6	1547137	1547142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_011004	GCT	2	6	1547144	1547149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4517	NC_011004	TGC	2	6	1547152	1547157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4518	NC_011004	TCG	2	6	1547186	1547191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4519	NC_011004	AGC	2	6	1547252	1547257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4520	NC_011004	CGC	2	6	1548230	1548235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4521	NC_011004	CCGC	2	8	1548240	1548247	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4522	NC_011004	CCGC	2	8	1548253	1548260	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4523	NC_011004	CT	3	6	1549396	1549401	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4524	NC_011004	CCG	2	6	1550182	1550187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4525	NC_011004	CTG	2	6	1550231	1550236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4526	NC_011004	TGA	2	6	1550285	1550290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_011004	GCC	2	6	1550382	1550387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4528	NC_011004	GA	3	6	1551015	1551020	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_011004	GGGGT	2	10	1551068	1551077	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_011004	CTGCG	2	10	1551095	1551104	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4531	NC_011004	TGC	2	6	1551159	1551164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4532	NC_011004	CG	4	8	1551182	1551189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4533	NC_011004	CG	3	6	1551204	1551209	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4534	NC_011004	ATC	2	6	1551784	1551789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4535	NC_011004	CGC	2	6	1551810	1551815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4536	NC_011004	GC	3	6	1551864	1551869	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4537	NC_011004	GAT	2	6	1551965	1551970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_011004	GCC	2	6	1551980	1551985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4539	NC_011004	GGCG	2	8	1553292	1553299	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4540	NC_011004	CGTG	2	8	1553312	1553319	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4541	NC_011004	TCG	2	6	1554145	1554150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4542	NC_011004	CTC	2	6	1554156	1554161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4543	NC_011004	CG	3	6	1554651	1554656	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4544	NC_011004	CG	3	6	1554665	1554670	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4545	NC_011004	CGTC	2	8	1554678	1554685	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4546	NC_011004	GCG	2	6	1554704	1554709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4547	NC_011004	GCC	2	6	1554742	1554747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4548	NC_011004	TTC	2	6	1554766	1554771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4549	NC_011004	TCGC	2	8	1554801	1554808	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4550	NC_011004	GGAG	2	8	1554861	1554868	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_011004	CGA	2	6	1554909	1554914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4552	NC_011004	CAA	2	6	1554930	1554935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4553	NC_011004	ACG	2	6	1554968	1554973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4554	NC_011004	AAC	2	6	1555002	1555007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4555	NC_011004	GCG	2	6	1555077	1555082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4556	NC_011004	GCG	2	6	1555100	1555105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4557	NC_011004	TTGA	2	8	1555152	1555159	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_011004	TAA	2	6	1555194	1555199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_011004	GAG	2	6	1555223	1555228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_011004	CTAG	2	8	1556086	1556093	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4561	NC_011004	ACG	2	6	1556124	1556129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4562	NC_011004	GGC	2	6	1556977	1556982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4563	NC_011004	ATA	2	6	1556984	1556989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_011004	GTC	2	6	1557043	1557048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4565	NC_011004	CGA	2	6	1557758	1557763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4566	NC_011004	AG	3	6	1557827	1557832	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_011004	CCG	2	6	1558682	1558687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4568	NC_011004	CGGCG	2	10	1558706	1558715	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4569	NC_011004	CCG	2	6	1558759	1558764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4570	NC_011004	GCA	2	6	1559615	1559620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4571	NC_011004	TGA	2	6	1559707	1559712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_011004	GA	3	6	1559762	1559767	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_011004	CGC	2	6	1559908	1559913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4574	NC_011004	CGGG	2	8	1561959	1561966	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4575	NC_011004	GTCGA	2	10	1561968	1561977	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4576	NC_011004	AGCG	2	8	1562077	1562084	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4577	NC_011004	GGCG	2	8	1562105	1562112	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4578	NC_011004	TC	3	6	1562127	1562132	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4579	NC_011004	GGC	2	6	1562153	1562158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4580	NC_011004	TGA	2	6	1564346	1564351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_011004	TTC	2	6	1564715	1564720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4582	NC_011004	ATC	3	9	1564724	1564732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4583	NC_011004	GC	3	6	1564770	1564775	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4584	NC_011004	GCC	2	6	1564805	1564810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4585	NC_011004	G	9	9	1564823	1564831	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_011004	TGGG	2	8	1564855	1564862	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4587	NC_011004	TTC	2	6	1564870	1564875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4588	NC_011004	CGT	2	6	1564898	1564903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4589	NC_011004	AGC	2	6	1564930	1564935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4590	NC_011004	GTC	2	6	1565696	1565701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4591	NC_011004	GCC	2	6	1565743	1565748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4592	NC_011004	GTC	2	6	1565756	1565761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4593	NC_011004	ATG	2	6	1565775	1565780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_011004	GGTCGA	2	12	1565849	1565860	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4595	NC_011004	GGT	2	6	1566021	1566026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_011004	GTA	2	6	1566041	1566046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_011004	GCGGG	2	10	1566147	1566156	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
4598	NC_011004	CCT	2	6	1566190	1566195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4599	NC_011004	CTT	2	6	1566239	1566244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4600	NC_011004	ATAG	2	8	1566287	1566294	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_011004	CCG	2	6	1566364	1566369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4602	NC_011004	CTGC	2	8	1566414	1566421	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4603	NC_011004	GTC	2	6	1566425	1566430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4604	NC_011004	TAA	2	6	1566434	1566439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_011004	AAG	2	6	1566467	1566472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_011004	TGT	2	6	1566551	1566556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_011004	CGA	2	6	1566604	1566609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4608	NC_011004	AG	3	6	1566631	1566636	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_011004	GGC	2	6	1566768	1566773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4610	NC_011004	GTA	2	6	1566792	1566797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_011004	TA	3	6	1566796	1566801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_011004	GTAG	2	8	1566862	1566869	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_011004	TCA	2	6	1566879	1566884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4614	NC_011004	AGA	2	6	1566885	1566890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_011004	A	6	6	1566950	1566955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_011004	GCG	2	6	1567088	1567093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4617	NC_011004	CGC	2	6	1567153	1567158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4618	NC_011004	GTC	2	6	1567217	1567222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4619	NC_011004	GCT	2	6	1567252	1567257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4620	NC_011004	TCT	2	6	1567395	1567400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4621	NC_011004	ATC	2	6	1567427	1567432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4622	NC_011004	GCG	2	6	1567446	1567451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4623	NC_011004	CTC	2	6	1567574	1567579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4624	NC_011004	TCT	2	6	1567636	1567641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4625	NC_011004	CT	3	6	1567659	1567664	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4626	NC_011004	AGT	2	6	1567735	1567740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_011004	CCA	2	6	1567776	1567781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4628	NC_011004	GAC	2	6	1567788	1567793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4629	NC_011004	TGT	2	6	1567799	1567804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4630	NC_011004	CG	3	6	1567860	1567865	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4890	NC_011004	GATCG	2	10	1622536	1622545	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4891	NC_011004	CGTGG	2	10	1622553	1622562	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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