MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rhizobium etli CIAT 652 plasmid pA

Total Repeats: 835

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010998	ACGCA	2	10	261465	261474	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
502	NC_010998	GGA	2	6	261477	261482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
503	NC_010998	CG	4	8	262382	262389	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
504	NC_010998	AGG	2	6	262394	262399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
505	NC_010998	CGC	2	6	262402	262407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
506	NC_010998	GCG	2	6	262521	262526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_010998	GAAAG	2	10	262585	262594	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
508	NC_010998	ACCG	2	8	263815	263822	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
509	NC_010998	GTC	2	6	264712	264717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_010998	GCG	2	6	264764	264769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_010998	GAG	2	6	264800	264805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
512	NC_010998	GTC	2	6	264825	264830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_010998	AAT	2	6	264854	264859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_010998	AAC	2	6	264891	264896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_010998	AGG	2	6	264928	264933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
516	NC_010998	GATC	2	8	265859	265866	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
517	NC_010998	CCG	2	6	265908	265913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
518	NC_010998	GT	3	6	266637	266642	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
519	NC_010998	GTAA	2	8	266653	266660	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
520	NC_010998	GTT	2	6	266668	266673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_010998	CTG	2	6	268011	268016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_010998	AGC	2	6	268425	268430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_010998	CAT	2	6	268481	268486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_010998	GT	3	6	268487	268492	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
525	NC_010998	A	6	6	268538	268543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_010998	AATG	2	8	268551	268558	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
527	NC_010998	GGA	2	6	270059	270064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
528	NC_010998	TAT	2	6	272503	272508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_010998	T	6	6	272527	272532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_010998	GCT	2	6	272538	272543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_010998	ACCT	2	8	272567	272574	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
532	NC_010998	GCCGC	2	10	273464	273473	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
533	NC_010998	CGG	2	6	273492	273497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_010998	GAAA	2	8	274395	274402	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
535	NC_010998	GC	3	6	274417	274422	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
536	NC_010998	GCG	2	6	274558	274563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_010998	CAT	2	6	274592	274597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_010998	TCG	2	6	274645	274650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_010998	TGAT	2	8	274671	274678	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
540	NC_010998	TCAT	2	8	274697	274704	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
541	NC_010998	A	6	6	274769	274774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_010998	TTC	2	6	274831	274836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_010998	AG	3	6	274886	274891	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
544	NC_010998	CGG	2	6	274906	274911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_010998	TCC	2	6	274922	274927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
546	NC_010998	CGA	2	6	274967	274972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_010998	CAG	2	6	274986	274991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_010998	CAC	2	6	275002	275007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
549	NC_010998	GGC	2	6	275090	275095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_010998	GCT	2	6	275306	275311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_010998	GGC	2	6	275319	275324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_010998	GGC	2	6	275337	275342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_010998	GAG	2	6	275353	275358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
554	NC_010998	GAA	2	6	276862	276867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_010998	CAGG	2	8	276882	276889	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
556	NC_010998	CGT	2	6	280475	280480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_010998	GCG	2	6	280488	280493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_010998	GGATGA	2	12	280499	280510	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
559	NC_010998	CGC	2	6	280553	280558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
560	NC_010998	CTT	2	6	282233	282238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_010998	GA	3	6	282247	282252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
562	NC_010998	TCC	2	6	283798	283803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
563	NC_010998	GTT	2	6	283813	283818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_010998	AT	3	6	283824	283829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_010998	GCTG	2	8	283910	283917	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
566	NC_010998	CGCT	2	8	283918	283925	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
567	NC_010998	CGGC	2	8	283934	283941	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
568	NC_010998	TCG	2	6	283989	283994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_010998	TTC	2	6	287121	287126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_010998	GGC	2	6	287157	287162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_010998	CCG	2	6	287191	287196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
572	NC_010998	CGCTTG	2	12	287227	287238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_010998	GGT	2	6	288855	288860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
574	NC_010998	GC	3	6	288903	288908	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
575	NC_010998	GGA	2	6	288925	288930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
576	NC_010998	CTT	2	6	288931	288936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_010998	CCG	2	6	290877	290882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
578	NC_010998	AGC	2	6	291477	291482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_010998	CCG	2	6	292726	292731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
580	NC_010998	CCG	2	6	292739	292744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
581	NC_010998	CGG	2	6	294624	294629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_010998	CCTG	2	8	294653	294660	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
583	NC_010998	GC	3	6	295515	295520	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
584	NC_010998	CGC	2	6	297096	297101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
585	NC_010998	GCC	2	6	297121	297126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
586	NC_010998	GGT	2	6	297171	297176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
587	NC_010998	CGG	2	6	298780	298785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_010998	CGC	2	6	298793	298798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
589	NC_010998	GA	4	8	298817	298824	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
590	NC_010998	GCG	2	6	301462	301467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_010998	GAA	2	6	302453	302458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
592	NC_010998	AAT	2	6	302565	302570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_010998	GGC	2	6	302631	302636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_010998	TTC	2	6	302646	302651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_010998	CGG	2	6	302663	302668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_010998	ACG	2	6	303141	303146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_010998	GC	4	8	303153	303160	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
598	NC_010998	ACTA	2	8	303277	303284	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
599	NC_010998	ATC	2	6	303863	303868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_010998	GTC	2	6	303870	303875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_010998	CTC	2	6	305090	305095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
602	NC_010998	GCG	2	6	305166	305171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_010998	CCT	2	6	305185	305190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
604	NC_010998	TAA	2	6	305202	305207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_010998	CAAAA	2	10	305303	305312	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
606	NC_010998	AGG	2	6	305324	305329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
607	NC_010998	GC	3	6	305361	305366	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
608	NC_010998	TTC	2	6	305396	305401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_010998	GC	3	6	305522	305527	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
610	NC_010998	GCC	2	6	305536	305541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
611	NC_010998	GC	3	6	305570	305575	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
612	NC_010998	TCA	2	6	305854	305859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_010998	CTG	2	6	305962	305967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_010998	TCCG	2	8	305971	305978	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
615	NC_010998	GCA	2	6	305988	305993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_010998	GCC	2	6	306097	306102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
617	NC_010998	TCT	2	6	306114	306119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_010998	CTA	2	6	306165	306170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_010998	GCC	2	6	306217	306222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
620	NC_010998	CTT	2	6	307529	307534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_010998	CCT	2	6	309492	309497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
622	NC_010998	GCC	2	6	309520	309525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
623	NC_010998	TCG	2	6	309567	309572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_010998	CGCC	2	8	309600	309607	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
625	NC_010998	ATT	2	6	309710	309715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_010998	GT	3	6	309778	309783	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
627	NC_010998	GCC	2	6	309828	309833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
628	NC_010998	CTC	2	6	310076	310081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
629	NC_010998	T	6	6	310141	310146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_010998	CGT	2	6	310196	310201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_010998	GGC	2	6	310221	310226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_010998	CGG	2	6	311334	311339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_010998	CGC	2	6	311354	311359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
634	NC_010998	CTC	2	6	312270	312275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
635	NC_010998	GC	3	6	312312	312317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
636	NC_010998	GC	3	6	312414	312419	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
637	NC_010998	GCC	2	6	312442	312447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
638	NC_010998	GCA	2	6	312452	312457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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