MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium etli CIAT 652 plasmid pC

Total Repeats: 374

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010997	GGCC	2	8	3077	3084	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_010997	TAGA	2	8	3769	3776	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010997	CAGA	2	8	6822	6829	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_010997	AGAA	2	8	12458	12465	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010997	GGCT	2	8	19636	19643	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_010997	GGAA	2	8	19840	19847	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010997	TCAA	2	8	20339	20346	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_010997	GCCA	2	8	20399	20406	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_010997	GGCC	2	8	20689	20696	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_010997	GCCT	2	8	20765	20772	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_010997	CCTG	2	8	22096	22103	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_010997	CAAC	2	8	25339	25346	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_010997	GCAG	2	8	25671	25678	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_010997	GGAG	2	8	26002	26009	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010997	TGCG	2	8	26086	26093	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_010997	GCAT	2	8	26318	26325	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_010997	CTGA	2	8	26770	26777	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_010997	CCGG	2	8	26796	26803	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_010997	CGCA	2	8	27993	28000	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_010997	GTGC	2	8	29101	29108	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_010997	GATC	2	8	29287	29294	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_010997	CGGA	2	8	29632	29639	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_010997	CAAC	2	8	30062	30069	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_010997	CAGC	2	8	30115	30122	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_010997	TGAT	2	8	30702	30709	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010997	AACT	2	8	33555	33562	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_010997	CTCA	2	8	35010	35017	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_010997	TCGG	2	8	41584	41591	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_010997	GGCC	2	8	41657	41664	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_010997	CGGC	2	8	41718	41725	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_010997	GCGG	2	8	48501	48508	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
32	NC_010997	CTGT	2	8	48522	48529	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_010997	TGGA	2	8	48608	48615	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010997	CGGG	2	8	50988	50995	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
35	NC_010997	GGGA	2	8	52167	52174	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010997	GCAA	2	8	52879	52886	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_010997	CGTT	2	8	53083	53090	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_010997	GCCG	2	8	53833	53840	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_010997	CAAT	2	8	53866	53873	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_010997	CCCG	2	8	56695	56702	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
41	NC_010997	TCGA	2	8	63448	63455	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_010997	CTAC	2	8	64893	64900	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_010997	GACA	2	8	69098	69105	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_010997	TTGG	2	8	69119	69126	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010997	CAAG	2	8	70576	70583	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_010997	TTCA	2	8	71059	71066	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_010997	CTGA	2	8	74443	74450	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_010997	ATTC	2	8	75508	75515	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_010997	GGCC	2	8	81324	81331	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_010997	CGGC	2	8	94471	94478	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_010997	CAAA	2	8	107943	107950	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_010997	GTGA	2	8	109721	109728	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010997	GTTC	2	8	110520	110527	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_010997	TGCA	2	8	110788	110795	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_010997	TGGC	2	8	112826	112833	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_010997	GCCG	2	8	114055	114062	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_010997	GACG	2	8	114261	114268	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_010997	AGCA	2	8	117417	117424	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_010997	TAGC	2	8	117431	117438	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_010997	TTCG	2	8	124859	124866	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_010997	GACG	2	8	132875	132882	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_010997	GCTT	2	8	140848	140855	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_010997	GGCC	2	8	143680	143687	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_010997	CCAG	2	8	144626	144633	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_010997	CCCG	2	8	153124	153131	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
66	NC_010997	CGAT	2	8	154532	154539	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_010997	CTTC	2	8	154762	154769	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_010997	TCAG	2	8	154844	154851	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_010997	CGCT	2	8	156887	156894	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_010997	GGGA	2	8	169118	169125	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010997	CAGC	2	8	180474	180481	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_010997	ATCT	2	8	197001	197008	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_010997	GATC	2	8	198687	198694	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_010997	CGGG	2	8	201996	202003	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
75	NC_010997	TGAC	2	8	202010	202017	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_010997	GAAG	2	8	203377	203384	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010997	CATG	3	12	207921	207932	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_010997	GCAT	2	8	207948	207955	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_010997	GCCG	2	8	208757	208764	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_010997	GTTC	2	8	232751	232758	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_010997	CTCG	2	8	240036	240043	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_010997	CGAT	2	8	248273	248280	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_010997	GCCG	2	8	253308	253315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_010997	AGAA	2	8	253560	253567	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010997	GAAT	2	8	253610	253617	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010997	CAAA	2	8	255464	255471	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_010997	TCGA	2	8	255496	255503	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_010997	CAAC	2	8	255519	255526	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_010997	GATC	2	8	255534	255541	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_010997	TCGA	2	8	266329	266336	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_010997	ACGC	2	8	266465	266472	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_010997	GGCA	2	8	274119	274126	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_010997	AGCG	2	8	274418	274425	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_010997	ATTA	2	8	283619	283626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010997	CGAT	2	8	284660	284667	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_010997	TCGT	2	8	285730	285737	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_010997	GAAA	2	8	286793	286800	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010997	AAGT	2	8	290433	290440	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010997	TTGA	2	8	290589	290596	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010997	CCGG	2	8	294517	294524	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_010997	GGCT	2	8	309147	309154	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_010997	CTGG	2	8	309188	309195	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_010997	TCCG	2	8	320585	320592	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_010997	TGCC	2	8	322891	322898	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_010997	TGCC	2	8	328132	328139	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_010997	GATC	2	8	335067	335074	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_010997	GGCC	2	8	347377	347384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_010997	AATA	2	8	347589	347596	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010997	CCGG	2	8	349944	349951	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_010997	GAAA	2	8	359313	359320	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010997	AAAG	2	8	360152	360159	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010997	TGAT	2	8	363104	363111	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010997	CGAG	2	8	363169	363176	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_010997	ATCA	2	8	377298	377305	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_010997	TATC	2	8	377380	377387	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_010997	TCCC	2	8	380071	380078	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
117	NC_010997	ATTT	2	8	382263	382270	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010997	CAGG	2	8	383680	383687	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_010997	TGAG	2	8	383817	383824	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010997	CGGC	2	8	383834	383841	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_010997	GCGG	2	8	384367	384374	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
122	NC_010997	ACCG	2	8	388224	388231	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_010997	ATGG	2	8	391407	391414	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010997	GCTC	2	8	393480	393487	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_010997	GACG	2	8	393596	393603	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_010997	GTCC	2	8	393716	393723	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_010997	TCGG	2	8	394123	394130	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_010997	TCAG	2	8	394333	394340	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_010997	CCAG	2	8	394432	394439	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_010997	TTTC	2	8	406543	406550	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_010997	AAAG	2	8	406552	406559	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010997	CCCT	2	8	412263	412270	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
133	NC_010997	GCTT	2	8	416994	417001	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_010997	ATTG	2	8	429343	429350	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010997	CGGG	2	8	434399	434406	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
136	NC_010997	AGCC	2	8	436988	436995	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_010997	GCCG	2	8	453297	453304	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_010997	AGCG	2	8	455788	455795	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_010997	GCAA	2	8	456773	456780	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_010997	CAGC	2	8	462099	462106	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_010997	ATTC	2	8	469184	469191	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_010997	CGGG	2	8	469211	469218	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
143	NC_010997	TGTC	2	8	479628	479635	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_010997	GGTC	2	8	480665	480672	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_010997	CTGC	2	8	484739	484746	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_010997	CGCT	2	8	484768	484775	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
147	NC_010997	GCCG	2	8	492947	492954	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_010997	TCCC	2	8	514788	514795	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
149	NC_010997	TGAC	2	8	524930	524937	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_010997	TCGG	2	8	543940	543947	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_010997	CCTC	2	8	554374	554381	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.