MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rhizobium etli CIAT 652 plasmid pC

Total Repeats: 2834

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_010997	GAT	2	6	813748	813753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2002	NC_010997	CGT	2	6	813769	813774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2003	NC_010997	CCA	2	6	813775	813780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2004	NC_010997	GCG	2	6	813789	813794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2005	NC_010997	GCA	2	6	813851	813856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2006	NC_010997	GGT	2	6	813865	813870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2007	NC_010997	CCG	2	6	813890	813895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2008	NC_010997	CAT	2	6	815400	815405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2009	NC_010997	CTG	2	6	816372	816377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2010	NC_010997	TCC	3	9	817419	817427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2011	NC_010997	GTT	2	6	817449	817454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2012	NC_010997	CCCAG	2	10	821273	821282	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2013	NC_010997	CCA	2	6	821411	821416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2014	NC_010997	GGC	2	6	821445	821450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2015	NC_010997	ATG	2	6	821470	821475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2016	NC_010997	CGT	2	6	821481	821486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2017	NC_010997	GCCC	2	8	821534	821541	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2018	NC_010997	ATG	2	6	821554	821559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2019	NC_010997	GAT	2	6	821568	821573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2020	NC_010997	CGCT	2	8	821624	821631	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2021	NC_010997	ACG	2	6	821647	821652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2022	NC_010997	ACC	2	6	821665	821670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2023	NC_010997	GAT	2	6	821691	821696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2024	NC_010997	GAT	2	6	821718	821723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2025	NC_010997	GAG	2	6	821781	821786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2026	NC_010997	GCT	2	6	821802	821807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2028	NC_010997	GACG	2	8	821858	821865	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2029	NC_010997	CGT	2	6	821884	821889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2030	NC_010997	CGG	2	6	821911	821916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2031	NC_010997	TTC	2	6	821919	821924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2032	NC_010997	CCT	2	6	821986	821991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2033	NC_010997	CGC	2	6	821993	821998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2034	NC_010997	TTG	2	6	822099	822104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2035	NC_010997	CTG	2	6	822167	822172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2036	NC_010997	ATCGG	2	10	822246	822255	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2037	NC_010997	CCA	2	6	822341	822346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2038	NC_010997	GCG	2	6	822377	822382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2041	NC_010997	TCT	2	6	822607	822612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2042	NC_010997	GCG	2	6	822666	822671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2043	NC_010997	AGGGTC	2	12	822681	822692	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2044	NC_010997	GGC	2	6	822695	822700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2047	NC_010997	CGGC	2	8	822825	822832	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2048	NC_010997	TC	3	6	824738	824743	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2049	NC_010997	TCC	2	6	825522	825527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2050	NC_010997	GGTG	2	8	825629	825636	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2051	NC_010997	TCC	2	6	826540	826545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2052	NC_010997	TCA	2	6	826577	826582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2053	NC_010997	CGT	2	6	826589	826594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2054	NC_010997	TTG	2	6	827669	827674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2055	NC_010997	CCG	2	6	827774	827779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2056	NC_010997	GTCC	2	8	827792	827799	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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2058	NC_010997	CCT	2	6	828610	828615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2059	NC_010997	ATC	2	6	828655	828660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2061	NC_010997	GAT	2	6	829385	829390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2062	NC_010997	CGC	2	6	829456	829461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2063	NC_010997	GAA	2	6	829517	829522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2064	NC_010997	GCT	2	6	829584	829589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2065	NC_010997	AAACC	2	10	829625	829634	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
2066	NC_010997	GCT	2	6	829668	829673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2068	NC_010997	CGG	2	6	829818	829823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2069	NC_010997	GAAA	2	8	829829	829836	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2070	NC_010997	TCGG	2	8	829856	829863	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2071	NC_010997	TGC	2	6	829912	829917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2089	NC_010997	CGACA	2	10	838669	838678	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2090	NC_010997	GACT	2	8	838774	838781	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2091	NC_010997	AAT	2	6	838800	838805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2092	NC_010997	GAC	2	6	838818	838823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2095	NC_010997	TGGG	2	8	841212	841219	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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2099	NC_010997	GAACG	2	10	841335	841344	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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2101	NC_010997	ATCGG	2	10	842591	842600	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2102	NC_010997	GCTC	2	8	842666	842673	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2103	NC_010997	GGGC	2	8	842699	842706	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2104	NC_010997	AC	3	6	843388	843393	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2105	NC_010997	CGCTG	2	10	843821	843830	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2106	NC_010997	TA	3	6	843838	843843	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2107	NC_010997	CGT	2	6	843856	843861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2108	NC_010997	CGTC	2	8	843868	843875	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2109	NC_010997	CGA	2	6	843882	843887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2110	NC_010997	TCG	2	6	843888	843893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2111	NC_010997	GCC	2	6	844048	844053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2112	NC_010997	GCC	2	6	844226	844231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2113	NC_010997	GATCGC	2	12	844260	844271	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2114	NC_010997	CTC	2	6	844311	844316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2115	NC_010997	TGC	2	6	844351	844356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2116	NC_010997	GCA	2	6	844376	844381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2117	NC_010997	T	7	7	844383	844389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2118	NC_010997	TC	3	6	846977	846982	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2119	NC_010997	CAT	2	6	847022	847027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2122	NC_010997	CAA	2	6	849390	849395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2123	NC_010997	ATTT	2	8	849522	849529	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2124	NC_010997	GC	3	6	849531	849536	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2125	NC_010997	ATC	2	6	849555	849560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2126	NC_010997	CAT	2	6	849563	849568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2127	NC_010997	CGA	2	6	850275	850280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2129	NC_010997	GCT	2	6	852294	852299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2130	NC_010997	CAT	2	6	852316	852321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2131	NC_010997	CGG	2	6	853227	853232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2133	NC_010997	TGG	2	6	854556	854561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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