MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhizobium etli CIAT 652 plasmid pB

Total Repeats: 2583

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_010996	CGA	2	6	414459	414464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2502	NC_010996	CGG	2	6	414502	414507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2503	NC_010996	GC	3	6	414579	414584	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2504	NC_010996	TAG	2	6	414616	414621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_010996	AG	3	6	414631	414636	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_010996	AG	3	6	414657	414662	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_010996	AT	3	6	414728	414733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_010996	TCG	2	6	414803	414808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2509	NC_010996	TCA	2	6	414918	414923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2510	NC_010996	ACG	2	6	414972	414977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2511	NC_010996	CGC	2	6	415076	415081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2512	NC_010996	CGT	2	6	415131	415136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2513	NC_010996	TCT	2	6	415142	415147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2514	NC_010996	GCT	2	6	415176	415181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2515	NC_010996	TTG	2	6	415200	415205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_010996	CCG	2	6	415377	415382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2517	NC_010996	CGC	2	6	415531	415536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2518	NC_010996	CGC	2	6	415547	415552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2519	NC_010996	GAC	2	6	415617	415622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2520	NC_010996	CTC	2	6	415723	415728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2521	NC_010996	GCC	2	6	416554	416559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2522	NC_010996	ATC	2	6	416584	416589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2523	NC_010996	CGA	2	6	416639	416644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2524	NC_010996	CGT	2	6	416694	416699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2525	NC_010996	TGA	2	6	416737	416742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_010996	AGGC	2	8	416780	416787	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2527	NC_010996	AGC	2	6	416838	416843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2528	NC_010996	AAC	2	6	416862	416867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2529	NC_010996	GGT	2	6	416894	416899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2530	NC_010996	TC	3	6	417119	417124	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2531	NC_010996	ATC	2	6	417174	417179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2532	NC_010996	ATG	2	6	417251	417256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2533	NC_010996	GAACG	2	10	417271	417280	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2534	NC_010996	GAG	2	6	417916	417921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2535	NC_010996	ACA	2	6	417922	417927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2536	NC_010996	AG	3	6	417990	417995	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_010996	GGA	2	6	418013	418018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2538	NC_010996	GCG	3	9	418030	418038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2539	NC_010996	GCC	2	6	418039	418044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2540	NC_010996	GCA	2	6	418704	418709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2541	NC_010996	AGG	2	6	418721	418726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_010996	AGG	2	6	420006	420011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_010996	TAA	2	6	420019	420024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_010996	CGA	2	6	420034	420039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2545	NC_010996	CAA	2	6	420056	420061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2546	NC_010996	GGA	2	6	420071	420076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2547	NC_010996	GCG	2	6	420104	420109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2548	NC_010996	AGA	2	6	420959	420964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2549	NC_010996	CCTA	2	8	420991	420998	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2550	NC_010996	AC	3	6	424063	424068	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2551	NC_010996	ACTT	2	8	424088	424095	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2552	NC_010996	CAA	2	6	424112	424117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2553	NC_010996	GGC	2	6	424123	424128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2554	NC_010996	TGA	2	6	424140	424145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_010996	GCTT	2	8	424167	424174	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2556	NC_010996	TCG	2	6	424208	424213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2557	NC_010996	CGA	2	6	424268	424273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2558	NC_010996	CCA	2	6	424315	424320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2559	NC_010996	TTC	2	6	424353	424358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2560	NC_010996	CG	3	6	424409	424414	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2561	NC_010996	CCT	2	6	424418	424423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2562	NC_010996	CGAAC	2	10	424476	424485	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2563	NC_010996	CAA	2	6	424490	424495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2564	NC_010996	GGC	2	6	424541	424546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2565	NC_010996	GGT	2	6	424597	424602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_010996	TCT	2	6	424611	424616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2567	NC_010996	ACC	2	6	424705	424710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2568	NC_010996	TCCCC	3	15	424774	424788	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
2569	NC_010996	GGC	2	6	424851	424856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2570	NC_010996	GGTC	2	8	424894	424901	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2571	NC_010996	TCG	2	6	425003	425008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2572	NC_010996	ACT	2	6	425009	425014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2573	NC_010996	AGC	2	6	425072	425077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2574	NC_010996	GTA	2	6	425086	425091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2575	NC_010996	CCG	3	9	425133	425141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2576	NC_010996	GAGT	2	8	425209	425216	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2577	NC_010996	TCT	2	6	425248	425253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2578	NC_010996	AC	3	6	425301	425306	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2579	NC_010996	AAAAG	2	10	427753	427762	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2580	NC_010996	CGT	2	6	427780	427785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2581	NC_010996	CTG	2	6	427883	427888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2582	NC_010996	GA	3	6	427895	427900	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2583	NC_010996	GCG	2	6	427935	427940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.