MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rhizobium etli CIAT 652 plasmid pB

Total Repeats: 2583

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_010996	TCC	2	6	275990	275995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1502	NC_010996	CTG	2	6	276014	276019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_010996	TCG	2	6	276745	276750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_010996	TGA	2	6	276772	276777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_010996	GCC	2	6	276783	276788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1506	NC_010996	GCA	2	6	276790	276795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_010996	CGG	2	6	276801	276806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_010996	GCTG	2	8	276835	276842	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1509	NC_010996	CCT	2	6	276963	276968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1510	NC_010996	CAA	2	6	277039	277044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_010996	GAT	2	6	277392	277397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_010996	GCATC	2	10	277457	277466	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1513	NC_010996	TGGC	2	8	277490	277497	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1514	NC_010996	GAT	2	6	277579	277584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_010996	ATC	2	6	277592	277597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_010996	CGT	2	6	277603	277608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_010996	GCGGT	2	10	277661	277670	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1518	NC_010996	TCTT	2	8	277697	277704	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1519	NC_010996	CCATC	2	10	277710	277719	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1520	NC_010996	GCTT	2	8	277742	277749	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1521	NC_010996	AG	3	6	277811	277816	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_010996	GTG	2	6	277836	277841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_010996	CTG	2	6	277893	277898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_010996	CAT	2	6	277912	277917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_010996	TTG	2	6	278009	278014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_010996	GCG	2	6	278027	278032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_010996	GAT	2	6	278121	278126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_010996	AGC	2	6	278168	278173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_010996	CAT	2	6	278311	278316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_010996	AGC	2	6	278332	278337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_010996	CGA	2	6	278374	278379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_010996	GCCG	2	8	278593	278600	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1533	NC_010996	GTC	2	6	278628	278633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_010996	GGC	3	9	278636	278644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_010996	ATC	2	6	278655	278660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_010996	ACGC	2	8	278752	278759	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1537	NC_010996	ATGG	2	8	278795	278802	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_010996	AAG	2	6	278856	278861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_010996	CGA	2	6	278879	278884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_010996	GT	3	6	279026	279031	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_010996	GAG	2	6	279243	279248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_010996	CT	3	6	279328	279333	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1543	NC_010996	CGAG	2	8	279464	279471	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1544	NC_010996	GGC	2	6	279528	279533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_010996	ATGG	2	8	279631	279638	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_010996	CAG	2	6	279641	279646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_010996	CGC	2	6	279677	279682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1548	NC_010996	TGG	2	6	279720	279725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_010996	A	6	6	279730	279735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_010996	GCA	2	6	281568	281573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_010996	GTC	2	6	281576	281581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_010996	TTC	2	6	281604	281609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_010996	GGC	2	6	281611	281616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_010996	CCG	2	6	281619	281624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1555	NC_010996	GCG	3	9	281706	281714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_010996	CTT	2	6	281735	281740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_010996	GCT	2	6	281743	281748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_010996	GGCC	2	8	285655	285662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1559	NC_010996	CCG	2	6	285675	285680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1560	NC_010996	CTTT	2	8	287237	287244	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1561	NC_010996	CGC	2	6	287251	287256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1562	NC_010996	GGC	2	6	287263	287268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_010996	GCCTG	2	10	287316	287325	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1564	NC_010996	CAGGC	2	10	287339	287348	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1565	NC_010996	GTC	3	9	288886	288894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_010996	CCTT	2	8	289859	289866	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1567	NC_010996	TCCA	2	8	289874	289881	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1568	NC_010996	AGGC	2	8	289894	289901	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1569	NC_010996	CGC	2	6	289908	289913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1570	NC_010996	TTG	2	6	289976	289981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_010996	ACC	2	6	290003	290008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1572	NC_010996	CAAA	2	8	290021	290028	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1573	NC_010996	CAG	2	6	290108	290113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_010996	CGG	2	6	290213	290218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_010996	ACC	2	6	290243	290248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1576	NC_010996	TTCA	2	8	290269	290276	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1577	NC_010996	TTG	2	6	290326	290331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_010996	GTA	2	6	290361	290366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_010996	TCC	2	6	290377	290382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1580	NC_010996	CAGC	2	8	290777	290784	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1581	NC_010996	CCCT	2	8	290815	290822	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1582	NC_010996	GCAT	2	8	290831	290838	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1583	NC_010996	AAC	2	6	290842	290847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_010996	GTTGC	2	10	290922	290931	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1585	NC_010996	TCC	2	6	291195	291200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1586	NC_010996	TCC	2	6	292708	292713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1587	NC_010996	GCC	2	6	292754	292759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1588	NC_010996	AAG	2	6	292764	292769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_010996	TGAT	2	8	292792	292799	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_010996	GAAA	2	8	292807	292814	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_010996	T	6	6	292937	292942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_010996	CCA	2	6	292947	292952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1593	NC_010996	CGA	2	6	292975	292980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_010996	GGGT	2	8	293025	293032	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_010996	GCG	2	6	293058	293063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1596	NC_010996	CGA	2	6	293125	293130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1597	NC_010996	CAC	2	6	293131	293136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1598	NC_010996	CGG	2	6	293146	293151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_010996	TGG	2	6	293190	293195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_010996	CCG	2	6	293204	293209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1601	NC_010996	GCG	2	6	293245	293250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_010996	CTGCC	2	10	293284	293293	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1603	NC_010996	GAA	2	6	293379	293384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_010996	GTC	2	6	293417	293422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_010996	ACC	2	6	294184	294189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1606	NC_010996	GGC	2	6	294215	294220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_010996	GACG	2	8	294235	294242	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1608	NC_010996	GCC	2	6	294296	294301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1609	NC_010996	GCC	2	6	294320	294325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1610	NC_010996	GGTG	2	8	294331	294338	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_010996	GTG	2	6	294392	294397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_010996	CAA	2	6	294438	294443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_010996	CGAT	2	8	294498	294505	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1614	NC_010996	GGC	2	6	294509	294514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_010996	TCG	2	6	294554	294559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_010996	TCT	2	6	294560	294565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_010996	CGC	2	6	294738	294743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1618	NC_010996	GGC	2	6	294780	294785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_010996	TCGC	2	8	294865	294872	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1620	NC_010996	AGC	2	6	294880	294885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_010996	GCG	2	6	294894	294899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_010996	GCTT	2	8	294954	294961	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1623	NC_010996	AAAT	2	8	295016	295023	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_010996	CAG	2	6	295602	295607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_010996	GGA	2	6	297194	297199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_010996	GTT	2	6	297250	297255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_010996	GA	3	6	297972	297977	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_010996	ATT	2	6	297988	297993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_010996	GAA	2	6	298025	298030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_010996	CGT	2	6	298141	298146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_010996	CCG	2	6	298210	298215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1632	NC_010996	CGTC	2	8	298229	298236	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1633	NC_010996	CAG	2	6	298243	298248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1634	NC_010996	TGC	2	6	298264	298269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1635	NC_010996	TCA	2	6	298286	298291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1655	NC_010996	TC	3	6	300296	300301	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1661	NC_010996	TA	4	8	304724	304731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1666	NC_010996	ATGGC	2	10	306694	306703	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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1668	NC_010996	TGC	2	6	309067	309072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1750	NC_010996	GCCTG	2	10	317213	317222	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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1765	NC_010996	ATC	2	6	317718	317723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2000	NC_010996	GATTG	2	10	347231	347240	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding

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