MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhizobium etli CIAT 652 chromosome

Total Repeats: 11760

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010994	GGT	2	6	216183	216188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
502	NC_010994	CAT	2	6	216190	216195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_010994	CAC	2	6	216199	216204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
504	NC_010994	CAC	2	6	216209	216214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
505	NC_010994	CGG	2	6	216281	216286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_010994	ATC	2	6	216328	216333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_010994	CCG	2	6	216374	216379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
508	NC_010994	GGC	2	6	221745	221750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_010994	CGCCC	2	10	222715	222724	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
510	NC_010994	GGC	2	6	222738	222743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_010994	GCC	2	6	222753	222758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
512	NC_010994	TC	3	6	223687	223692	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
513	NC_010994	GAA	2	6	223724	223729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_010994	GCC	2	6	223760	223765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
515	NC_010994	TCT	2	6	226060	226065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_010994	GC	5	10	230028	230037	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
517	NC_010994	ATGA	2	8	230088	230095	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
518	NC_010994	CG	3	6	234267	234272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
519	NC_010994	CG	3	6	234284	234289	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
520	NC_010994	GAT	2	6	236968	236973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_010994	GGGC	2	8	236979	236986	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
522	NC_010994	GCA	2	6	237001	237006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_010994	GCG	2	6	237007	237012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_010994	GAC	2	6	243973	243978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_010994	GAT	2	6	244031	244036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_010994	ATG	2	6	244087	244092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_010994	CAT	2	6	244121	244126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_010994	GAT	2	6	244518	244523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_010994	CGC	2	6	244533	244538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
530	NC_010994	CGG	2	6	244546	244551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_010994	ATGTTT	2	12	244553	244564	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
532	NC_010994	CCG	2	6	244579	244584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
533	NC_010994	AAG	2	6	244595	244600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_010994	GCA	2	6	244639	244644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_010994	CTGG	2	8	246384	246391	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
536	NC_010994	GCA	2	6	246433	246438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_010994	CCGG	2	8	246457	246464	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
538	NC_010994	CCAA	2	8	246471	246478	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
539	NC_010994	ATA	2	6	246480	246485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_010994	AGC	2	6	246844	246849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_010994	ATCT	2	8	246985	246992	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
542	NC_010994	CT	3	6	247087	247092	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
543	NC_010994	TCG	2	6	247106	247111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_010994	CCA	2	6	247177	247182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
545	NC_010994	AAG	2	6	247189	247194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_010994	GGC	2	6	247198	247203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_010994	A	6	6	247261	247266	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_010994	GCG	2	6	247276	247281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_010994	GCT	2	6	247415	247420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_010994	TAA	2	6	247756	247761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_010994	AGGG	2	8	247814	247821	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
552	NC_010994	AC	3	6	247849	247854	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
553	NC_010994	AGGAG	2	10	247911	247920	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
554	NC_010994	TCG	2	6	247925	247930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_010994	AT	3	6	247941	247946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_010994	T	6	6	247984	247989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_010994	CTT	2	6	247992	247997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_010994	CCGT	2	8	248019	248026	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
559	NC_010994	TGA	2	6	248042	248047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_010994	CCG	2	6	248082	248087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
561	NC_010994	GGA	2	6	248113	248118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
562	NC_010994	CGA	2	6	249779	249784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_010994	ATG	2	6	254699	254704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_010994	TCCT	2	8	257393	257400	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
565	NC_010994	CCG	2	6	257501	257506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
566	NC_010994	AAGG	2	8	257533	257540	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
567	NC_010994	TTCT	2	8	258191	258198	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
568	NC_010994	TTTC	2	8	258207	258214	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
569	NC_010994	CTGC	2	8	261838	261845	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
570	NC_010994	ACG	2	6	261887	261892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_010994	AGA	2	6	261908	261913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_010994	A	7	7	262384	262390	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_010994	TGAA	2	8	262394	262401	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
574	NC_010994	GAT	2	6	262438	262443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_010994	CCG	2	6	262516	262521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
576	NC_010994	GA	3	6	262548	262553	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
577	NC_010994	AGC	2	6	262580	262585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_010994	GGC	2	6	262919	262924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_010994	ACG	2	6	263010	263015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_010994	AGAA	2	8	268033	268040	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
581	NC_010994	GGAA	2	8	270541	270548	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
582	NC_010994	AT	3	6	271587	271592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_010994	CGGG	2	8	271608	271615	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
584	NC_010994	GCTC	2	8	271635	271642	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
585	NC_010994	GAC	2	6	273294	273299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_010994	ATG	2	6	274710	274715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
587	NC_010994	GAC	2	6	274739	274744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_010994	GCCG	2	8	274797	274804	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
589	NC_010994	CGG	2	6	274813	274818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_010994	CGG	2	6	274872	274877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_010994	CGTTT	2	10	277574	277583	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
592	NC_010994	GTG	2	6	279443	279448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
593	NC_010994	CGTT	2	8	279477	279484	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
594	NC_010994	CACC	2	8	279489	279496	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
595	NC_010994	TGAA	2	8	279546	279553	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
596	NC_010994	AGA	2	6	279564	279569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_010994	TCT	2	6	279573	279578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_010994	GC	3	6	279595	279600	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
599	NC_010994	ATG	2	6	279709	279714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
600	NC_010994	CCA	2	6	281257	281262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
601	NC_010994	TCAA	2	8	281350	281357	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
602	NC_010994	A	6	6	282398	282403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_010994	GCC	2	6	282444	282449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
604	NC_010994	CGGG	2	8	282760	282767	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
605	NC_010994	GCGTTG	2	12	282853	282864	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
606	NC_010994	TCA	2	6	282907	282912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_010994	TAG	2	6	282926	282931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
608	NC_010994	A	6	6	282975	282980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_010994	CGA	2	6	282982	282987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_010994	A	6	6	282992	282997	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_010994	GAAA	2	8	283024	283031	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
612	NC_010994	CCG	2	6	283081	283086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
613	NC_010994	CAG	2	6	283087	283092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_010994	GGC	2	6	283171	283176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_010994	GCA	2	6	286129	286134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_010994	GCC	2	6	286173	286178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
617	NC_010994	GGCA	2	8	286179	286186	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
618	NC_010994	TC	3	6	287122	287127	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
619	NC_010994	TCAT	2	8	287197	287204	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
620	NC_010994	TC	3	6	287244	287249	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
621	NC_010994	A	6	6	287282	287287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_010994	GCC	2	6	287292	287297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
623	NC_010994	GCC	2	6	290785	290790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
624	NC_010994	TTGC	2	8	292974	292981	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
625	NC_010994	CGA	2	6	292989	292994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_010994	CGG	2	6	293046	293051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_010994	AGA	2	6	293670	293675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_010994	A	6	6	293817	293822	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_010994	ATCAC	2	10	293829	293838	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
630	NC_010994	TGC	2	6	293845	293850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_010994	TA	3	6	293883	293888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_010994	AG	3	6	293889	293894	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
633	NC_010994	TCC	2	6	294726	294731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
634	NC_010994	CGG	2	6	296072	296077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_010994	CT	3	6	296079	296084	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
636	NC_010994	GGA	2	6	296125	296130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
637	NC_010994	AGC	2	6	299013	299018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_010994	GCC	2	6	299019	299024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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671	NC_010994	GCC	2	6	306975	306980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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771	NC_010994	TTGCG	2	10	339887	339896	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
772	NC_010994	TTC	2	6	339940	339945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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931	NC_010994	CTG	2	6	418854	418859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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