MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhizobium etli CIAT 652 chromosome

Total Repeats: 11760

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_010994	ACT	2	6	1973403	1973408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5002	NC_010994	GCC	2	6	1973436	1973441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5003	NC_010994	GGA	2	6	1973457	1973462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_010994	T	6	6	1973910	1973915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_010994	T	6	6	1973959	1973964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_010994	TAT	2	6	1974029	1974034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_010994	CCG	2	6	1974086	1974091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5008	NC_010994	GAAT	2	8	1974103	1974110	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_010994	GA	3	6	1976982	1976987	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_010994	GC	3	6	1977507	1977512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5011	NC_010994	AGCG	2	8	1978787	1978794	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5012	NC_010994	TGT	2	6	1979997	1980002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_010994	TAT	2	6	1980040	1980045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_010994	ATT	2	6	1980998	1981003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_010994	GAT	2	6	1981019	1981024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_010994	GTC	2	6	1981038	1981043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_010994	GAC	2	6	1981118	1981123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_010994	CGC	2	6	1981128	1981133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5019	NC_010994	GCAGG	2	10	1985556	1985565	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5020	NC_010994	CGT	2	6	1985570	1985575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_010994	CG	3	6	1985578	1985583	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5022	NC_010994	GAATG	2	10	1985606	1985615	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_010994	GCGG	2	8	1986549	1986556	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5024	NC_010994	CGG	2	6	1986618	1986623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_010994	TCA	2	6	1986687	1986692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5026	NC_010994	CATA	2	8	1986699	1986706	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5027	NC_010994	GCCGC	2	10	1986734	1986743	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5028	NC_010994	AAG	2	6	1987734	1987739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_010994	GAG	2	6	1987795	1987800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_010994	ATG	2	6	1988539	1988544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_010994	CAT	2	6	1988572	1988577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_010994	GGAA	2	8	1990788	1990795	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_010994	GCAAG	2	10	1991937	1991946	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5034	NC_010994	TATT	2	8	1991955	1991962	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_010994	CCCT	2	8	1992029	1992036	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5036	NC_010994	AC	3	6	1992065	1992070	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5037	NC_010994	A	6	6	1992110	1992115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_010994	TCC	2	6	2000243	2000248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5039	NC_010994	CGCA	2	8	2000390	2000397	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5040	NC_010994	GAT	2	6	2000409	2000414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_010994	CA	3	6	2003795	2003800	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5042	NC_010994	G	6	6	2003812	2003817	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_010994	AGG	2	6	2003846	2003851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_010994	TCG	2	6	2005617	2005622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_010994	CACC	2	8	2005715	2005722	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5046	NC_010994	GAA	2	6	2005729	2005734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_010994	T	6	6	2007058	2007063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_010994	AACG	2	8	2007084	2007091	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5049	NC_010994	TTC	2	6	2007561	2007566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_010994	AGGG	2	8	2007603	2007610	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_010994	GGGA	2	8	2008666	2008673	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_010994	TGA	2	6	2010094	2010099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_010994	TTG	2	6	2010166	2010171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_010994	TGG	2	6	2010206	2010211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_010994	GTG	2	6	2010259	2010264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_010994	T	7	7	2010287	2010293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_010994	GCAC	2	8	2010312	2010319	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5058	NC_010994	GGCG	2	8	2010336	2010343	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5059	NC_010994	AGGG	2	8	2010375	2010382	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_010994	AC	3	6	2013003	2013008	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5061	NC_010994	GCC	2	6	2014484	2014489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5062	NC_010994	GAT	2	6	2015109	2015114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_010994	CTTA	2	8	2016485	2016492	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5064	NC_010994	CG	3	6	2016543	2016548	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5065	NC_010994	GATC	2	8	2016553	2016560	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5066	NC_010994	ATGG	2	8	2016599	2016606	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_010994	CG	4	8	2016639	2016646	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5068	NC_010994	CGCC	2	8	2016665	2016672	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5069	NC_010994	TGTC	2	8	2016679	2016686	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5070	NC_010994	GGC	2	6	2016826	2016831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_010994	GCC	2	6	2016845	2016850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5072	NC_010994	CTT	2	6	2016917	2016922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5073	NC_010994	TCT	2	6	2016925	2016930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5074	NC_010994	CGGC	2	8	2016931	2016938	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5075	NC_010994	GCC	2	6	2016949	2016954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5076	NC_010994	CTTG	2	8	2019189	2019196	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5077	NC_010994	AAT	2	6	2019275	2019280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_010994	CTC	2	6	2022923	2022928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5079	NC_010994	CCT	3	9	2022941	2022949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5080	NC_010994	CCG	2	6	2022958	2022963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5081	NC_010994	CAAA	2	8	2023024	2023031	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5082	NC_010994	GCC	2	6	2023079	2023084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5083	NC_010994	TGC	2	6	2023104	2023109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_010994	GC	3	6	2023158	2023163	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5085	NC_010994	CGG	2	6	2023170	2023175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_010994	TGGG	2	8	2023269	2023276	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_010994	TTG	2	6	2024394	2024399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_010994	GCA	2	6	2024403	2024408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5089	NC_010994	CA	3	6	2024449	2024454	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5090	NC_010994	GCC	2	6	2024457	2024462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5091	NC_010994	TTG	2	6	2024537	2024542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_010994	ATCA	2	8	2024558	2024565	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5093	NC_010994	GAT	2	6	2024627	2024632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_010994	CGG	2	6	2024660	2024665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_010994	G	6	6	2024664	2024669	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_010994	TAT	2	6	2024674	2024679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_010994	GCC	2	6	2024729	2024734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5098	NC_010994	CGC	2	6	2024809	2024814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5099	NC_010994	GCG	2	6	2024821	2024826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5100	NC_010994	G	6	6	2024835	2024840	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_010994	TAC	2	6	2024855	2024860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5102	NC_010994	GCC	2	6	2024870	2024875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5103	NC_010994	AGA	2	6	2025655	2025660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_010994	TTC	2	6	2025675	2025680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_010994	T	6	6	2025702	2025707	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_010994	CTCC	2	8	2027203	2027210	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5107	NC_010994	TGT	2	6	2027211	2027216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_010994	GCT	2	6	2027269	2027274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5109	NC_010994	AACT	2	8	2027345	2027352	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5110	NC_010994	AGC	2	6	2027452	2027457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_010994	TGC	2	6	2027518	2027523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5112	NC_010994	GAAC	2	8	2027638	2027645	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5113	NC_010994	ATG	2	6	2027646	2027651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_010994	ATTG	2	8	2027682	2027689	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_010994	AGT	2	6	2027715	2027720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_010994	CAGA	2	8	2027880	2027887	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5117	NC_010994	ATC	2	6	2027945	2027950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5118	NC_010994	GAA	2	6	2029562	2029567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_010994	GAG	2	6	2029597	2029602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_010994	TCG	2	6	2029608	2029613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5121	NC_010994	TTTA	2	8	2030769	2030776	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_010994	CAC	2	6	2031512	2031517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5123	NC_010994	TTC	2	6	2031555	2031560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_010994	AAG	2	6	2031570	2031575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_010994	GAG	2	6	2031617	2031622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_010994	AGC	2	6	2031664	2031669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5127	NC_010994	TTG	2	6	2031670	2031675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_010994	GATC	2	8	2031729	2031736	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5129	NC_010994	CCGG	2	8	2031758	2031765	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5130	NC_010994	CTGG	2	8	2032802	2032809	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5131	NC_010994	G	6	6	2037382	2037387	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_010994	GTGACG	2	12	2038476	2038487	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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5260	NC_010994	TGTC	2	8	2074843	2074850	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5261	NC_010994	ATG	2	6	2074857	2074862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5262	NC_010994	TCCC	2	8	2075229	2075236	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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5265	NC_010994	CAG	2	6	2075395	2075400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5377	NC_010994	ATTTC	2	10	2102576	2102585	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5378	NC_010994	CCCG	2	8	2102587	2102594	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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5382	NC_010994	GA	3	6	2103992	2103997	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5383	NC_010994	CGG	2	6	2106442	2106447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5386	NC_010994	TGT	2	6	2106540	2106545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5387	NC_010994	AT	3	6	2106574	2106579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5388	NC_010994	TCG	2	6	2108101	2108106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5389	NC_010994	CATTC	2	10	2108159	2108168	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5390	NC_010994	TGGC	2	8	2108217	2108224	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5391	NC_010994	GCG	2	6	2108277	2108282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5392	NC_010994	ACA	2	6	2108322	2108327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5393	NC_010994	A	7	7	2108373	2108379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5395	NC_010994	T	8	8	2114938	2114945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5396	NC_010994	T	6	6	2114992	2114997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5397	NC_010994	GGA	2	6	2115025	2115030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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