MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Ralstonia pickettii 12J plasmid pRPIC01

Total Repeats: 154

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010683	TAT	2	6	939	944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010683	GGC	2	6	3137	3142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_010683	AGC	2	6	3189	3194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010683	ACC	2	6	3202	3207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_010683	ACC	2	6	3240	3245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_010683	AGA	2	6	3282	3287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010683	ATC	2	6	3288	3293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_010683	TGC	2	6	3349	3354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_010683	CCT	2	6	3836	3841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_010683	CGT	2	6	3870	3875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010683	GAC	2	6	3878	3883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_010683	AAG	2	6	3944	3949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010683	GGC	2	6	4709	4714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_010683	CTT	2	6	4741	4746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010683	TCC	2	6	5129	5134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_010683	TCC	2	6	5185	5190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_010683	GTT	2	6	6074	6079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010683	CAT	2	6	6743	6748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_010683	TGA	2	6	6818	6823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010683	AAC	2	6	7968	7973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_010683	CGG	2	6	8017	8022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_010683	GTT	2	6	8274	8279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010683	GGC	2	6	9101	9106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_010683	GCC	2	6	9113	9118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_010683	GCG	2	6	9169	9174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_010683	GCA	2	6	9240	9245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_010683	GCT	3	9	9257	9265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_010683	AGT	2	6	9331	9336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010683	TGC	2	6	9361	9366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010683	GCC	2	6	9379	9384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_010683	TCG	2	6	9499	9504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_010683	CCG	2	6	10675	10680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_010683	GAC	2	6	10690	10695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010683	CGG	2	6	10701	10706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_010683	ATA	2	6	10719	10724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010683	GCC	2	6	10891	10896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_010683	GCA	2	6	10913	10918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_010683	GTA	2	6	10945	10950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010683	ACC	2	6	11011	11016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_010683	ACC	2	6	11093	11098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_010683	CGT	2	6	11291	11296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010683	GCT	2	6	11349	11354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010683	TGG	2	6	11423	11428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010683	TGG	2	6	11478	11483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010683	TGT	2	6	11592	11597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010683	CAG	2	6	11781	11786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_010683	GCG	2	6	11809	11814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_010683	GGT	2	6	11837	11842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010683	GGT	2	6	11849	11854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010683	TCC	2	6	11909	11914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_010683	GCA	2	6	12109	12114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_010683	CCA	2	6	12126	12131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_010683	CAG	2	6	12205	12210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_010683	GCA	2	6	12241	12246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_010683	CGT	2	6	12310	12315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_010683	GTG	2	6	12447	12452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010683	CTG	2	6	12469	12474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_010683	GGC	2	6	14306	14311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010683	GCG	2	6	14338	14343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_010683	CGG	3	9	14345	14353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_010683	TGG	2	6	14431	14436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010683	GCC	3	9	14592	14600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_010683	CGG	2	6	14650	14655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_010683	CCG	2	6	14656	14661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_010683	GGC	2	6	14674	14679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_010683	GAC	2	6	14696	14701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_010683	CGG	2	6	14714	14719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_010683	ACC	2	6	16160	16165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_010683	AAT	2	6	17142	17147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010683	AAC	2	6	17263	17268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_010683	GGC	2	6	18705	18710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_010683	GCT	2	6	18740	18745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_010683	GCA	2	6	18902	18907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_010683	GTC	2	6	19835	19840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_010683	TGG	2	6	22605	22610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010683	AAT	2	6	22634	22639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010683	CGG	2	6	22646	22651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_010683	CAT	2	6	23710	23715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_010683	CTG	2	6	23804	23809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_010683	GCA	2	6	23884	23889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_010683	GAC	2	6	24437	24442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_010683	CCA	2	6	30679	30684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_010683	CGT	2	6	30719	30724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_010683	GGT	2	6	30824	30829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010683	CGT	2	6	33637	33642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_010683	GCC	2	6	34291	34296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_010683	GCG	2	6	34304	34309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_010683	CCA	2	6	38657	38662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_010683	GCA	2	6	38672	38677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_010683	ATG	2	6	38751	38756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010683	TGA	2	6	38783	38788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010683	CGC	2	6	38808	38813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_010683	CGC	2	6	38825	38830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_010683	TGA	2	6	40420	40425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010683	ACT	2	6	41322	41327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_010683	GTT	2	6	43680	43685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010683	CGC	2	6	43959	43964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_010683	GCG	2	6	43984	43989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_010683	CGA	2	6	44009	44014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_010683	CAG	3	9	44046	44054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_010683	AAC	2	6	44057	44062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_010683	GCG	2	6	44066	44071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_010683	TCC	2	6	44129	44134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_010683	CAG	2	6	44170	44175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_010683	GCA	2	6	44180	44185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_010683	GCC	2	6	44249	44254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_010683	AAC	2	6	45906	45911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_010683	ACC	3	9	45955	45963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_010683	AAC	2	6	46054	46059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_010683	ATT	2	6	46071	46076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010683	TTC	2	6	46131	46136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_010683	ACA	2	6	46150	46155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_010683	CGG	2	6	46175	46180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_010683	GCT	2	6	46360	46365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_010683	CAT	2	6	46387	46392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_010683	TCG	2	6	46401	46406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_010683	AGC	2	6	46458	46463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_010683	CTT	2	6	46600	46605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_010683	TGC	2	6	46696	46701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_010683	CGC	2	6	46714	46719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_010683	CTA	2	6	46742	46747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_010683	GAA	2	6	46773	46778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010683	GCG	2	6	46783	46788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_010683	GAC	2	6	46821	46826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_010683	CTG	3	9	46888	46896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_010683	CGC	2	6	46939	46944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_010683	ATC	2	6	47089	47094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_010683	GTT	2	6	49153	49158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010683	CGT	2	6	49300	49305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_010683	CAT	2	6	49902	49907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_010683	AGC	2	6	49984	49989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_010683	GTC	2	6	50356	50361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_010683	GCA	2	6	50364	50369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_010683	GCA	2	6	50782	50787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_010683	GCC	2	6	50825	50830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_010683	GTC	2	6	52520	52525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_010683	TCC	2	6	65588	65593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_010683	GGT	2	6	66142	66147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010683	ATC	2	6	67329	67334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_010683	CCA	2	6	67442	67447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_010683	TGC	2	6	67453	67458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_010683	TTC	2	6	67525	67530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_010683	GAA	2	6	67547	67552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010683	TCT	2	6	68189	68194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_010683	CAT	2	6	69962	69967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_010683	CCT	2	6	78918	78923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_010683	TGG	2	6	79852	79857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_010683	ACA	2	6	80310	80315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_010683	AGG	2	6	80345	80350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
150	NC_010683	GAA	2	6	80409	80414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_010683	CAA	2	6	80415	80420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_010683	TTC	2	6	80468	80473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_010683	GAT	2	6	80489	80494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_010683	CTG	2	6	80568	80573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.