MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Ralstonia pickettii 12J chromosome 1

Total Repeats: 137

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010682	CGTCGG	2	12	9786	9797	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_010682	AGCCTG	2	12	15572	15583	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_010682	GCAACG	2	12	15930	15941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010682	ACGGGC	2	12	16646	16657	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_010682	CTCACC	2	12	18065	18076	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_010682	ATGCGG	2	12	21605	21616	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_010682	GCCGGT	2	12	23125	23136	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_010682	CGTGTG	2	12	38396	38407	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_010682	TTCGCC	2	12	59124	59135	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10	NC_010682	CACAAA	2	12	72428	72439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010682	CAGAAA	2	12	78186	78197	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_010682	GTTTTG	3	18	92754	92771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010682	TGCGCG	2	12	94333	94344	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_010682	ACTGAG	2	12	155952	155963	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_010682	TTTTTG	2	12	162257	162268	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010682	TGAAGA	2	12	178074	178085	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010682	GGCGCC	2	12	205313	205324	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_010682	CTTCCG	2	12	291505	291516	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
19	NC_010682	GCTCAC	2	12	303591	303602	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
20	NC_010682	GTGGAC	2	12	317794	317805	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_010682	GGCCGT	2	12	336063	336074	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_010682	GCATCC	2	12	353471	353482	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
23	NC_010682	TCTTTC	2	12	382660	382671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_010682	ATCGTG	2	12	459545	459556	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_010682	TGATGG	2	12	460064	460075	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010682	AACAAG	2	12	484937	484948	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_010682	ACGCGA	2	12	508772	508783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_010682	CTGCCC	2	12	520613	520624	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_010682	GGGGTT	2	12	546912	546923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010682	CCTCAA	2	12	569300	569311	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_010682	CGTGGC	2	12	592768	592779	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_010682	TCGACA	2	12	611800	611811	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010682	ATCTGA	2	12	644190	644201	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_010682	GCGGAC	2	12	649722	649733	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_010682	CGTTCG	2	12	686589	686600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010682	GCGCAG	2	12	737222	737233	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010682	GAAACA	2	12	844309	844320	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_010682	GATGGA	2	12	908142	908153	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010682	TGCCGC	2	12	927626	927637	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
40	NC_010682	TCAGGC	3	18	929874	929891	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010682	GCGAAG	2	12	944197	944208	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_010682	ACGCCG	2	12	950014	950025	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
43	NC_010682	GCTCCG	2	12	967750	967761	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
44	NC_010682	TGCGCA	2	12	972012	972023	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010682	GCCTCC	2	12	992048	992059	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_010682	CCAGCA	2	12	1008730	1008741	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
47	NC_010682	TCAAAA	2	12	1052418	1052429	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_010682	CGCGGC	2	12	1129681	1129692	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_010682	GATTGG	2	12	1162145	1162156	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010682	CCGGGC	2	12	1187195	1187206	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_010682	CAGCGC	2	12	1205349	1205360	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
52	NC_010682	ATCGGG	2	12	1207247	1207258	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_010682	GATGGA	2	12	1213022	1213033	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010682	CCGAGG	2	12	1236913	1236924	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_010682	GAGGGG	2	12	1318781	1318792	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010682	CAGGCC	2	12	1441107	1441118	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
57	NC_010682	GTTGTG	2	12	1531275	1531286	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010682	ATTTTT	2	12	1537613	1537624	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010682	TGCCGC	2	12	1550078	1550089	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
60	NC_010682	CTTGGC	2	12	1556801	1556812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_010682	GCTCTC	2	12	1558082	1558093	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
62	NC_010682	GGCGAT	2	12	1558343	1558354	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_010682	GCCTTG	2	12	1577965	1577976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_010682	GTCTTT	2	12	1602073	1602084	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_010682	GCGAGA	2	12	1662809	1662820	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_010682	ACGCGG	2	12	1736069	1736080	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_010682	GAAAAC	2	12	1754466	1754477	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_010682	GCAGCC	2	12	1782677	1782688	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
69	NC_010682	CGCAGT	2	12	1798063	1798074	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_010682	ACCTTG	2	12	1798454	1798465	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_010682	CAAACG	2	12	1821860	1821871	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_010682	CCTCGT	2	12	1838013	1838024	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
73	NC_010682	GCAAGC	2	12	1880658	1880669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_010682	CGCGCA	2	12	1905952	1905963	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
75	NC_010682	CCAGGC	2	12	1933604	1933615	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
76	NC_010682	GAGAAT	2	12	1937324	1937335	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010682	CCGAAG	2	12	2003360	2003371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_010682	CAAAAA	2	12	2091108	2091119	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_010682	TGGTTA	2	12	2100970	2100981	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010682	GCTTCA	2	12	2129394	2129405	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_010682	CCATCC	2	12	2169242	2169253	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_010682	TTGCAA	2	12	2178923	2178934	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_010682	CGAACT	2	12	2179139	2179150	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_010682	CGGCCC	2	12	2221369	2221380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_010682	AGGCCG	2	12	2280321	2280332	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_010682	CGCCTC	2	12	2390563	2390574	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_010682	TCCCCA	2	12	2405896	2405907	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_010682	TGATTT	2	12	2426708	2426719	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010682	GATGCC	2	12	2459209	2459220	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_010682	GCGCTC	2	12	2460242	2460253	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
91	NC_010682	GCGTTG	2	12	2470316	2470327	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_010682	ACAACG	2	12	2479052	2479063	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_010682	TTGGGG	2	12	2503113	2503124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010682	AAGAAA	3	18	2522060	2522077	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010682	CTTCAC	2	12	2524958	2524969	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_010682	AGCGAG	2	12	2555765	2555776	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_010682	CGATTC	2	12	2571946	2571957	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_010682	CGCCCA	2	12	2587468	2587479	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_010682	GGCTTC	2	12	2587796	2587807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_010682	CCCCGA	2	12	2643049	2643060	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_010682	CGCCAT	2	12	2683019	2683030	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
102	NC_010682	TGCCAT	2	12	2725988	2725999	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_010682	GCAAGA	2	12	2823962	2823973	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_010682	GGCACC	2	12	2894278	2894289	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
105	NC_010682	GGCCGC	2	12	2894374	2894385	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_010682	TGACGA	2	12	2901604	2901615	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_010682	CCCGCT	2	12	2911083	2911094	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_010682	CCCCGG	2	12	2918860	2918871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_010682	TGCAAA	2	12	2934898	2934909	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_010682	ACTTTT	2	12	3010477	3010488	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_010682	GGCTGC	2	12	3039466	3039477	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_010682	CGTTTT	2	12	3067676	3067687	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_010682	CCGCGC	2	12	3081626	3081637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_010682	CGGCAG	2	12	3096201	3096212	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_010682	TGCGAT	2	12	3166142	3166153	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_010682	GACAAG	2	12	3189529	3189540	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_010682	CCTGGC	2	12	3271248	3271259	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
118	NC_010682	TCGACT	2	12	3277567	3277578	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_010682	TCGATC	2	12	3296867	3296878	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_010682	GCCTTG	2	12	3473372	3473383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_010682	GTTTTT	2	12	3473525	3473536	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010682	AACCAA	5	30	3562953	3562982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_010682	CAAAAG	2	12	3626533	3626544	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_010682	CCTTCC	2	12	3634277	3634288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_010682	ACCAAA	2	12	3645325	3645336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_010682	CAAAAA	2	12	3654770	3654781	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_010682	CGCCCC	2	12	3654812	3654823	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
128	NC_010682	GTTTTT	2	12	3710055	3710066	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010682	CGCGTT	2	12	3744945	3744956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_010682	TGCGCC	2	12	3817932	3817943	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
131	NC_010682	TTTGCG	2	12	3861859	3861870	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_010682	GCCGCA	2	12	3870824	3870835	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
133	NC_010682	GCATCG	2	12	3879364	3879375	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_010682	GGCAGC	2	12	3894054	3894065	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_010682	CGTTTT	2	12	3926484	3926495	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_010682	TCGCGG	2	12	3936062	3936073	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_010682	GCCCGA	2	12	3936435	3936446	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.