MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Iowa chromosome

Total Repeats: 924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010263	TTTA	2	8	866	873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010263	ATTT	2	8	1401	1408	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010263	TAAA	2	8	6434	6441	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010263	ATTA	2	8	10889	10896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010263	ATTA	2	8	11103	11110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010263	ATCT	2	8	11409	11416	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_010263	TTAA	2	8	12374	12381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010263	TTAG	2	8	14750	14757	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010263	AGTA	2	8	19812	19819	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010263	AAAC	2	8	19862	19869	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_010263	TAAA	2	8	19937	19944	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010263	TTAT	2	8	20135	20142	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010263	ACTA	2	8	25868	25875	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_010263	ATGT	2	8	26531	26538	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010263	TTAT	2	8	26585	26592	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010263	AGCA	2	8	26659	26666	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_010263	TAAA	2	8	28579	28586	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010263	AGGA	2	8	28637	28644	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010263	TAAA	2	8	28669	28676	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010263	GCTA	2	8	28679	28686	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_010263	TAAT	2	8	29926	29933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010263	AATG	2	8	37651	37658	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010263	GTTT	2	8	38165	38172	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010263	ATAA	2	8	38660	38667	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010263	AACA	2	8	38757	38764	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_010263	TGCT	3	12	41494	41505	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_010263	GCTT	2	8	41621	41628	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_010263	TTTA	2	8	41661	41668	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010263	ATTA	2	8	42102	42109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010263	ATTA	2	8	42465	42472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010263	AAAT	2	8	42568	42575	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010263	TACC	2	8	44648	44655	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_010263	AAAC	2	8	44656	44663	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_010263	TAAT	2	8	44732	44739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010263	ATTT	2	8	44759	44766	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010263	ATTA	2	8	44767	44774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010263	AAAT	2	8	44786	44793	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010263	ATGA	2	8	44989	44996	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010263	AGTA	2	8	48877	48884	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010263	ATAC	2	8	49095	49102	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_010263	TGTT	2	8	49609	49616	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010263	AAGT	2	8	49646	49653	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010263	ATCT	2	8	50692	50699	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_010263	TTTA	2	8	51275	51282	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010263	ACTC	2	8	51386	51393	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_010263	TAAA	2	8	51424	51431	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010263	ATTA	2	8	52539	52546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010263	TAAA	2	8	55974	55981	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010263	ATCT	2	8	57179	57186	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_010263	AACG	2	8	58559	58566	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_010263	GTTA	2	8	58931	58938	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010263	TTAA	2	8	59161	59168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010263	TAAA	2	8	62308	62315	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010263	ATTT	2	8	62329	62336	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010263	ATTT	2	8	64325	64332	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010263	TTAA	2	8	65872	65879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010263	TAGT	2	8	66360	66367	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010263	ATAA	2	8	68410	68417	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010263	CAAT	2	8	73690	73697	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_010263	TAAG	2	8	74197	74204	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010263	CAAT	2	8	74693	74700	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_010263	TAAA	2	8	75636	75643	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010263	TTTA	2	8	75681	75688	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010263	AAAT	2	8	75755	75762	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010263	TAAA	2	8	77326	77333	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010263	ATGA	2	8	77390	77397	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010263	ATTT	2	8	77447	77454	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010263	AAAT	2	8	83397	83404	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010263	TATC	2	8	87044	87051	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_010263	TAGC	2	8	87147	87154	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_010263	TAAA	2	8	92554	92561	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010263	TTTA	2	8	95223	95230	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010263	AAAT	2	8	95247	95254	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010263	AATT	2	8	95470	95477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010263	TAAA	2	8	96828	96835	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010263	ATTA	2	8	97065	97072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010263	AATG	2	8	98274	98281	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010263	TCCA	2	8	100104	100111	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_010263	AAGC	2	8	100199	100206	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_010263	ATGT	2	8	102254	102261	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010263	AAAG	2	8	107027	107034	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010263	ATTT	2	8	107178	107185	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010263	TTTA	2	8	107219	107226	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010263	ATTA	2	8	113143	113150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010263	GAAA	2	8	113264	113271	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010263	AAGT	2	8	120552	120559	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010263	CTAC	2	8	122368	122375	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_010263	CGCT	2	8	125072	125079	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_010263	TCAC	2	8	125101	125108	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_010263	GCAG	2	8	125121	125128	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_010263	ATTC	2	8	129573	129580	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_010263	TAAT	2	8	129594	129601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010263	TTTA	2	8	129767	129774	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010263	GTTA	2	8	130535	130542	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010263	AATT	2	8	131413	131420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010263	TTTG	2	8	132246	132253	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010263	AAAC	2	8	151500	151507	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_010263	TGAT	2	8	151695	151702	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010263	ATTA	2	8	151963	151970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010263	CGAT	2	8	152203	152210	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_010263	TAAT	2	8	152338	152345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010263	TAGA	2	8	152736	152743	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010263	ATTT	2	8	152983	152990	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010263	ATAA	2	8	153171	153178	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010263	TTGC	2	8	153874	153881	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_010263	GGTG	2	8	154695	154702	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010263	ATAA	2	8	154705	154712	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010263	TCTA	2	8	167424	167431	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_010263	TTTA	2	8	167434	167441	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010263	TTTA	2	8	170015	170022	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010263	TCAT	2	8	172868	172875	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_010263	TAAT	2	8	176910	176917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010263	ATTA	2	8	178059	178066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010263	TTAA	2	8	180218	180225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010263	TCAA	2	8	180789	180796	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_010263	ATAA	2	8	181369	181376	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010263	TCAG	2	8	181595	181602	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_010263	ATAA	2	8	191816	191823	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010263	TTAC	2	8	193468	193475	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_010263	CTTT	2	8	206268	206275	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_010263	TTTA	2	8	207399	207406	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010263	TATT	2	8	210397	210404	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010263	TGAT	2	8	210473	210480	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010263	TATT	2	8	211078	211085	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010263	CTAA	2	8	215109	215116	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_010263	TAAT	2	8	215129	215136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010263	AGCA	2	8	215168	215175	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_010263	ATTT	2	8	217119	217126	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010263	ATTT	2	8	217865	217872	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010263	TAAA	2	8	219019	219026	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010263	TTAA	2	8	228865	228872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010263	AAGT	2	8	228980	228987	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010263	AATG	2	8	229179	229186	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010263	TTCA	2	8	229834	229841	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_010263	AGCT	2	8	229970	229977	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_010263	ATTT	2	8	230126	230133	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010263	ATCC	2	8	230717	230724	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_010263	TTTC	2	8	230797	230804	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_010263	TTTC	2	8	233914	233921	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_010263	TTAG	2	8	234340	234347	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010263	TACT	2	8	235560	235567	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_010263	ATTT	2	8	237687	237694	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010263	TAAA	2	8	245254	245261	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010263	ATAC	2	8	250167	250174	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_010263	TAAT	2	8	250342	250349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010263	AACA	2	8	250627	250634	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_010263	TTTC	2	8	251565	251572	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_010263	TATT	2	8	254215	254222	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_010263	ATTA	2	8	255217	255224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_010263	ATTT	2	8	257672	257679	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_010263	TGTT	2	8	257828	257835	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_010263	TTGT	2	8	258581	258588	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
153	NC_010263	AAGA	2	8	258637	258644	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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