MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Iowa chromosome

Total Repeats: 4301

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010263	ATT	2	6	833	838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010263	TGT	2	6	940	945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010263	GTT	2	6	6060	6065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010263	TAT	2	6	6339	6344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010263	TTC	2	6	6365	6370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010263	TCT	2	6	7693	7698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_010263	AAT	2	6	7736	7741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010263	GCT	2	6	7818	7823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_010263	GAC	2	6	7830	7835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010263	CAA	3	9	7849	7857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010263	AAG	2	6	9212	9217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010263	GGT	2	6	9273	9278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010263	AGT	2	6	9354	9359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010263	GGT	2	6	9370	9375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010263	GCT	2	6	9382	9387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_010263	GAA	2	6	9415	9420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010263	TAA	2	6	9450	9455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010263	AGA	2	6	9534	9539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010263	TAT	2	6	10207	10212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010263	AAC	2	6	10213	10218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_010263	TTG	2	6	10321	10326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010263	AAT	2	6	10413	10418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010263	ATC	2	6	10449	10454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_010263	GTT	2	6	10469	10474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010263	GGT	2	6	10501	10506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010263	GTA	2	6	10556	10561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010263	ACT	2	6	10602	10607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_010263	TTG	2	6	10617	10622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010263	CTT	2	6	10667	10672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010263	TAT	2	6	10749	10754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010263	ATA	2	6	10870	10875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010263	TAC	2	6	10880	10885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010263	AAC	2	6	10944	10949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010263	TGG	2	6	11159	11164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010263	TTA	2	6	11375	11380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010263	ATA	2	6	11443	11448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010263	TTA	2	6	12360	12365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010263	GTG	2	6	12464	12469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010263	TCG	2	6	12572	12577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010263	TTA	2	6	12682	12687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010263	TAA	2	6	14763	14768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010263	GTT	2	6	14784	14789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010263	GAA	2	6	14802	14807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010263	GTC	2	6	17901	17906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010263	ATT	2	6	17976	17981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010263	TTA	2	6	18148	18153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010263	TTA	2	6	18158	18163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010263	TTA	2	6	18232	18237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010263	GTA	2	6	19530	19535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010263	AAT	2	6	19801	19806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010263	TTG	2	6	19887	19892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010263	AAT	2	6	19927	19932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010263	ATT	2	6	19969	19974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010263	ACC	2	6	25922	25927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_010263	AAT	2	6	26002	26007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010263	CAC	2	6	26021	26026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_010263	TAC	2	6	26238	26243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_010263	AAT	2	6	26379	26384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010263	AAC	2	6	26579	26584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_010263	TAA	2	6	26630	26635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010263	TTA	2	6	26648	26653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010263	CTT	2	6	26707	26712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_010263	AAT	2	6	26786	26791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010263	AGT	2	6	26905	26910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010263	TAA	2	6	26969	26974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010263	TAA	2	6	26990	26995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010263	TTA	2	6	27855	27860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010263	GAA	2	6	27875	27880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010263	GAT	2	6	28084	28089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010263	GTA	2	6	28156	28161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010263	ATG	2	6	28172	28177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010263	ATA	2	6	28369	28374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010263	TAT	2	6	28513	28518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010263	ATG	2	6	28654	28659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010263	TAA	2	6	29985	29990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010263	CGA	2	6	31142	31147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_010263	TTA	2	6	32062	32067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010263	TAA	2	6	32123	32128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010263	ATA	2	6	32155	32160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010263	GGA	2	6	32197	32202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010263	CTC	2	6	32813	32818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_010263	ACT	2	6	32915	32920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_010263	CAA	2	6	32947	32952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_010263	ATA	2	6	34674	34679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010263	ATT	2	6	34998	35003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010263	AAT	2	6	36104	36109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010263	TTC	3	9	36521	36529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_010263	TGA	2	6	36619	36624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010263	GAT	2	6	36694	36699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010263	TAT	2	6	37356	37361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010263	TAA	2	6	37664	37669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010263	ATC	2	6	37707	37712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_010263	ATT	2	6	37716	37721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010263	CTT	2	6	37808	37813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_010263	ATT	2	6	37848	37853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010263	TTC	2	6	37866	37871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_010263	TAA	2	6	37880	37885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010263	ATT	2	6	37924	37929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010263	TCC	2	6	37956	37961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_010263	TTG	2	6	38077	38082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010263	ATT	2	6	38088	38093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010263	AAG	2	6	38145	38150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010263	AAT	2	6	38173	38178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010263	ATT	2	6	38220	38225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010263	GTT	2	6	38291	38296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010263	CAC	2	6	38355	38360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_010263	ATA	2	6	38428	38433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010263	TTA	2	6	38500	38505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010263	CGC	2	6	38569	38574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_010263	TAT	2	6	38775	38780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010263	GAG	2	6	38799	38804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010263	GTG	2	6	38844	38849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010263	TTA	2	6	38885	38890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010263	AAT	2	6	38915	38920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010263	ATA	2	6	38946	38951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010263	CAC	2	6	39695	39700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_010263	ATA	2	6	40042	40047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010263	TTC	2	6	40073	40078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_010263	ATT	2	6	40191	40196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010263	TAA	2	6	41009	41014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010263	ATC	2	6	41458	41463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_010263	TCA	2	6	41586	41591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_010263	ATT	2	6	41615	41620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010263	ACT	2	6	41641	41646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_010263	TCT	2	6	42025	42030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_010263	TTA	2	6	42058	42063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010263	AAT	2	6	42072	42077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010263	TAA	2	6	42459	42464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010263	GAT	2	6	42526	42531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010263	TAT	2	6	42562	42567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010263	TAA	2	6	42578	42583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010263	ATT	2	6	43813	43818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010263	ATT	2	6	44542	44547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010263	GAC	2	6	44596	44601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_010263	CGT	2	6	44780	44785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_010263	TAA	2	6	44863	44868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010263	AGT	2	6	44905	44910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010263	GCT	2	6	44916	44921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_010263	GCG	2	6	44941	44946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_010263	ATT	2	6	44950	44955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010263	CGG	2	6	44957	44962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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